• 小鼠仙台病毒TaqMan-MGB探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立

    孙权麟;马跃宇;孙莉;费东亮;白杰英;张旭;李明;马鸣潇

    仙台病毒(Sendai virus,SeV)能够引起啮齿类动物呼吸道疾病,引起免疫应答,严重影响SPF级动物模型实验结果,实验动物质量国家标准T/CALAS49-2017也将其作为SPF级大小鼠质量检测必检项目之一。为了开发用于快速检测及日常监测SeV的分子生物学诊断方法,本研究基于TaqMan-MGB探针荧光技术,根据GenBank中SeV的L基因的保守区段(8 556-15 242)序列,设计了1对特异性引物与1条5‵端携带羧基荧光素(FAM)与3‵端为淬灭基团(Eclipse)标记的TaqMan探针,标准品进行稀释建立标准曲线,并经反应条件优化,建立了TaqMan-MGB探针荧光定量RT-PCR检测方法,并对其特异性、敏感性与重复性进行评估。结果显示,最佳优化反应条件为:反应体系,20μmol/L;引物和探针浓度,10μmol/L和15μmol/L;退火温度,54℃;在特异性试验中,除SeV检测出现特异性曲线外,其他鼠类常见病毒均未出现特异性曲线;在敏感性试验中,Sev最低检测限为5.29×10~1拷贝/μL。在重复性试验中,其批内变异系数为0.44%~0.77%,批间变异系数为0.44%~1.03%。对临床样本进行检测,检出率高于常规的RT-PCR方法。因此,以SeV L基因保守序列为靶基因建立的TaqMan探针荧光定量RT-PCR方法具有敏感性高、特异性强、良好的重复性等优点,适用于对SPF级实验动物的SeV定期监测以及对野生鼠类的SeV日常监测和流行病学调查,为相关研究提供了良好的技术支持。

    网络首发时间: 2022-12-01 18:27:34[查看摘要][在线阅读][下载 1089K]
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  • 2010-2021年杭州市儿童埃可病毒感染及流行特征分析

    邱晓枫;李钧;张国忠;于新芬;潘劲草;赵刚

    研究杭州市儿童感染埃可病毒(Echovirus,E)状况和流行病学特征。收集2010-2021年杭州市发热患儿咽拭子、肛拭子等临床样本。首先通过实时荧光RT-PCR试剂盒进行肠道病毒(Enterovirus,EV)通用筛查。选取Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV阳性核酸样本,用普通PCR方法扩增EV VP1序列。获得VP1序列通过GenBank进行BLAST比对,确定埃可病毒血清型,并对埃可病毒优势血清型构建遗传进化树。通过回顾性调查埃可病毒阳性患儿的临床资料进行流行病学特征分析。采用卡方检验对埃可病毒阳性患儿的采样时间、年龄、性别等进行分组比较。本研究共收集临床样本7 835份,获得EV通用阳性样本数共计2 023份。选取827份Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV通用核酸阳性样本;共检出埃可病毒68份,8个血清型,阳性率为8.22%;分别为21份E30、12份E9、13份E6、7份E11、11份E18、2份E25、1份E7、1份E3。春、夏、秋、冬四季的埃可病毒阳性率分别为4.37%、21.03%、1.75%、1.22%。0-4岁、4-7岁、7-14岁患儿的埃可病毒阳性数分别为29、23、16,在EV阳性病例中的阳性率分别为5.24%、10.09%、34.78%。男、女童埃可病毒阳性率分别为9.48%、6.13%。埃可病毒阳性患儿临床诊断主要以急性上呼吸道感染为主,有29例占42.65%;其次是病毒性脑炎25例占36.76%;再是手足口病11例占16.18%。构建E30遗传进化树,发现杭州21株E30病毒株有多个不同进化分支,可能存在不同的流行传播链。E30杭州株之间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为88.0%~100.0%、97.3%~100.0%。2010-2021年期间,夏季是杭州市儿童埃可病毒感染的高发季;建议医疗机构在夏季加强埃可病毒监测,有效预防和控制夏季埃可病毒引起的疫情暴发流行。

    网络首发时间: 2022-11-16 09:38:41[查看摘要][在线阅读][下载 650K]
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  • 2016-2020年安徽省手足口病流行病学特征及CVA6基因进化分析

    傅荔艳;葛盈露;马婉婉;冯明子;王鹏;罗婉蓉;孙永;史永林

    为了解安徽省2016-2020年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行特征与病原谱构成,及分析CVA6(Coxsackievirus A6,CVA6)VP1区基因进化情况。本研究收集2016-2020年安徽省HFMD病例流行病学资料,描述性流行病学方法分析病例三间分布情况。随机选取480份HFMD其他肠道病毒阳性咽拭子样本,RT-PCR扩增肠道病毒VP1基因片段,测定基因序列并鉴定其他肠道病毒基因型别。生物软件分析部分代表性CVA6基因序列相似性并构建系统发育树。流行病学结果显示,2016-2020年安徽省HFMD发病率仍处于较高水平,但重症病例与死亡病例数有所减少,5个年度均以其他肠道病毒流行为主,五岁以下散居儿童为主要患病人群,男女性别比为1.50∶1。2016-2019年度发病均呈现为双峰流行模式。病原分型鉴定结果为CVA6 215例(215/245,87.76%),CVA10 16例(16/245,6.53%),CVA4 12例(12/245,4.90%),CVA5 1例(1/245,0.41%),CVA2 1例(1/245,0.41%)。选取的60株代表性CVA6 VP1区序列相似性分析表明,各序列间VP1核苷酸序列相似性为91.6%~100%,氨基酸序列相似性为97.4%~100%;与D3基因型代表株之间核苷酸序列相似性为90.7%~98.9%,氨基酸序列相似性为96.7%~100%;与CVA6原型株核苷酸序列相似性为82.3%~83.9%,氨基酸序列相似性为95.1%~96.7%。进化分析显示,CVA6划分为A-D四个基因型,60株CVA6毒株均属于D3基因亚型中的D3a分支,为中国大陆地区优势流行型别。应加强对安徽省CVA6及其他肠道病毒监测,这对制定减轻HFMD疾病负担以及防控HFMD策略具有重要意义。

    网络首发时间: 2022-11-14 11:35:28[查看摘要][在线阅读][下载 608K]
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  • 新型冠状病毒荧光定量PCR的Ct值与病毒分离的结果分析

    郑焕英;张官婷;柯碧霞;梁丹;李安安;洪文珊;梁玉凤;王涛;黎薇;彭晓放;柯昌文;邓小玲

    为探究利用SARS-CoV-2的ORF1ab基因和N基因作为靶标进行荧光定量检测的Ct值与SARS-CoV-2病毒分离阳性率之间的关系。本研究对广州入境的新型冠状病毒肺炎输入病例临床样本进行荧光定量PCR检测和用Vero细胞进行病毒分离,统计病毒分离率与荧光定量PCR检测Ct值之间的关系,再通过logistics回归模型用Ct值来预测病毒分离率;同时对收集到的临床样本进行三代测序及进化树的构建。结果显示,在160例新型冠状病毒肺炎输入病例临床样本中,分离到74株新型冠状病毒,分离阳性率为46.25%,分离到包括20株Alpha、9株Beta、2株Delta等VOC毒株和2株Epsilon、1株Eta等VOI毒株,其他变异株42株;病例样本荧光定量PCR检测ORF1ab基因Ct值为16.12~39.00,N基因的Ct值为17.82~39.41;病毒分离率与样本荧光定量PCR检测的ORF1ab基因和N基因的Ct值均呈负相关,在Ct值>31时,分离率仅9.10%(6/66),而当Ct值<23.1时,病毒分离阳性率可超过95%,分离到新冠病毒的病例样本荧光定量PCR检测的ORF1ab基因和N基因的最高Ct值分别为33.74和34.47。本研究结果提示,当SARS-CoV-2荧光定量PCR检测结果的Ct值越高时,毒株分离率越低,在Ct值>31时病毒分离阳性率显著降低。

    网络首发时间: 2022-11-04 16:15:53[查看摘要][在线阅读][下载 528K]
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  • 埃博拉假病毒小鼠攻毒模型的建立与评估

    孙冰洁;范鹏飞;房婷;于长明;陈薇

    埃博拉病毒具有极大的危险性,对其活病毒相关的操作必须严格限制在生物安全四级实验室(BSL-4)中,阻碍了疫苗和治疗药物的研发进程。本研究将扎伊尔埃博拉病毒(EBOV)膜表面糖蛋白(GP)表达质粒与携带荧光素酶报告基因的pNL4-3.Luc.R-E-慢病毒载体共转染至HEK293T细胞,包装HIV骨架的EBOV GP-Fluc假病毒颗粒,建立了BSL-2条件下基于假病毒和生物发光成像(BLI)技术的BALB/c小鼠EBOV感染模型,并通过不同给药时间、途径和抗体种类的系统评估对其可靠性进行了验证。腹腔注射包含GP全长的假病毒在第4d可检测到集中于胸腺部位的最大发光信号,测试抗体在预防性静脉给药时可完全阻断假病毒的感染,在暴露后腹腔给药时表现出与其在活病毒小鼠模型中一致的保护效力。该模型为埃博拉病毒以及类似烈性病原体防治药物研发提供了一种简单有效的前期筛选方案。

    网络首发时间: 2022-10-27 16:18:53[查看摘要][在线阅读][下载 749K]
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  • GⅡ.4基因型香港株P蛋白受体结合特征的研究

    吴铮;苏韫曦;丛鑫;王金冬;朱曦;靳淼;孙晓曼;段招军

    分析GⅡ.4基因型中国香港株(GⅡ.4 HongKong,GⅡ.4 HK)P颗粒蛋白与组织血型抗原的相互作用方式以探索GⅡ.4 HK的受体结合特征。利用大肠杆菌蛋白表达系统得到GⅡ.4 HK及GⅡ.4 Sydney的P颗粒蛋白,通过寡糖和唾液结合实验研究其与不同组织血型抗原的结合特异性;对序列和结构进行分析,比较P蛋白的结构和功能特征。成功制备到GⅡ.4 HK与GⅡ.4 Sydney的P颗粒蛋白,GⅡ.4 HK和GⅡ.4 Sydney P颗粒与人A、B、AB、O型唾液均有结合,也与含fucose的H双糖寡糖有很好的结合。GⅡ.4 HK与GⅡ.4 Sydney流行株具有相似的组织血型抗原结合特征,但结合能力弱于GⅡ.4 Sydney流行株,GII.4 HK在多个抗原位点有氨基酸改变,可能引起抗原改变,有必要对GⅡ.4 HK流行情况的持续监测。

    网络首发时间: 2022-10-11 16:21:16[查看摘要][在线阅读][下载 913K]
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  • 牛病毒性腹泻病毒基因组快速进化表现出来的遗传多样性

    王慧慧;冯茜莉;蒲飞洋;汪梦竹;程燕;马晓霞;马忠仁;周建华

    牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)基因组的高突变性和同源/异源重组性导致其成为一种较难防控的家畜病原体。目前普遍接受的两种基因型是BVDV-1和BVDV-2,其中基因1型含有21个亚型而基因2型含有4个亚型。在流行态势上,BVDV-1无论在遗传多样性还是分离毒株的数量上均高于BVDV-2。虽然BVDV-1和BVDV-2在基因组遗传特征上存在明显的遗传差异,但是其基因组内部特定区域在遗传进化上存在着密切关联。除了病毒基因组自身高变异的特性外,同源/异源RNA重组在BVDV遗传变异进程中也发挥着重要的作用。借助这些遗传进化的途径,BVDV在世界各地的流行传播可以用“随心所欲”来形容。BVDV的流行特征总体表现为基因1型的毒株为主要流行毒株,各基因亚型之间交替更迭并呈现遗传多样性。鉴于BVDV遗传进化的多变性和复杂性,紧密追踪主要流行基因亚型的更迭以及收集不同基因亚型的特征性遗传信息对于制定切实有效的BVDV防控措施具有实际意义。

    网络首发时间: 2022-10-11 12:02:27[查看摘要][在线阅读][下载 537K]
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  • 口服轮状病毒疫苗RotaTeq对不同人种轮状病毒胃肠炎免疫原性的meta分析

    魏宇航;彭蕊;王萌璇;范佳欣;吴铮;毛彤瑶;王明雯;孙晓曼;李丹地

    评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对全球儿童轮状病毒胃肠炎免疫原性,为疫苗的使用提供循证参考。检索2006-2021年公开发表的有关口服轮状病毒减毒活疫苗(Oral Live Attenuated Rotavirus Vaccine,ORV)RotaTeq(RV5)的文献,根据纳入排除标准筛选,共纳入了8 015名研究对象,其中疫苗组纳入研究对象4 062名,对照组纳入研究对象3 953名,使用RevMan5.3软件进行数据分析。共纳入6篇文献,对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了73%(95%CI:65%~81%)、35%(95%CI:19%~50%)、11%(95%CI:6%~16%)、12%(95%CI:5%~19%)、30%(95%CI:21%~38%)、23%(95%CI:8%~38%);与对照组相比,黄色人种疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了75%(95%CI:66%~85%)、41%(95%CI:19%~62%)、14%(95%CI:4%~24%)、19%(95%CI:7%~31%)、28%(95%CI:9%~47%)、34%(95%CI:11%~58%);白色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了82%(95%CI:77%~87%)、54%(95%CI:42%~66%)、15%(95%CI:5%~24%)、9%(95%CI:2%~16%)、38%(95%CI:26%~51%)、22%(95%CI:10%~33%);黑色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了59%(95%CI:52%~67%)、19%(95%CI:14%~24%)、6%(95%CI:2%~10%)、5%(95%CI:1%~9%)、27%(95%CI:19%~36%)、10%(95%CI:5%~16%)。口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq在不同的人种中免疫原性有一定的差异,且在黄色人种和白色人种中的免疫原性要比黑色人种的免疫原性更好。

    网络首发时间: 2022-10-08 15:32:58[查看摘要][在线阅读][下载 649K]
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  • 蛋白质组学在病毒学研究中的应用

    陈雅萍;孙欣;王盛羽;敖弟书;宋鸿

    病毒入侵宿主细胞后,导致宿主产生一系列复杂的变化。探索病毒-宿主的相互作用为预防和治疗病毒感染的研究提供重要线索。近年来,以质谱(Mass spectrometry,MS)为核心的蛋白质组学已经为病毒学的发展做出了巨大贡献。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、猴痘病毒(Monkeypox virus,MPXV)以及其它病毒的出现,使得对病毒蛋白质的分子功能及感染后宿主蛋白质组的深入探索更加迫切。本文综述了应用不同蛋白质组学方法来阐明病毒蛋白质的组成、病毒-宿主蛋白质相互作用、宿主蛋白质组的改变以及感染诱导的翻译后调控方面的现状。并讨论蛋白质组学与其他组学联用的策略,总结了蛋白质组学的限制和优势,为寻找病毒感染生物标志物、抗病毒药物靶点提供新的思路。

    网络首发时间: 2022-09-26 10:02:35[查看摘要][在线阅读][下载 573K]
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  • 二代测序技术分析2018年济南市污水中的人星状病毒基因特征

    赵云;林小娟;刘尧;纪峰;张丽;徐爱强;陶泽新;温红玲

    人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)是引起急性胃肠炎的主要致病病毒之一,为了解HAstV的型别分布和遗传变异特征,本研究于2018年在济南市按月采集12份生活污水样本,浓缩处理后提取RNA,进行HAstV部分ORF2编码区的PCR扩增,阳性产物进行下一代测序(Next generation sequencing,NGS)分析,探索HAstV各型别的动态变化和系统发生学特征。结果显示所有污水中均检出HAstV核酸,NGS分析显示所测读长分属于HAstV-1至HAstV-6共6个型别,其中HAstV-1型占比最大(27.4%),但不同月份的优势型别有所差别。系统发生学分析显示HAstV-1、HAstV-2、HAstV-5型山东株序列属于多个遗传分支,提示这些型别有多个传播链在当地循环。本研究描述了2018年济南市本地流行的人星状病毒基因型分布和序列特征,研究结果证明基于扩增子NGS的环境监测是探索人群中HAstV分子流行病学特征的有效手段。

    网络首发时间: 2022-09-19 11:27:57[查看摘要][在线阅读][下载 537K]
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  • SARS-CoV-2 Omicron变异株荧光定量PCR鉴别方法的建立及应用

    牛培华;何雅青;李晓燕;马红霞;朱琳;郑宝璐;魏欣仪;李诗敏;朱灿;卢清菊;孟君;彭博;王佶;马学军

    开发和评价一种用于鉴别Omicron变异株的荧光定量PCR方法。我们针对Omicron变异株S基因的两个特异性突变位点开发了一种基于荧光定量PCR的Omicron变异株分型方法(Omicron RT-qPCR)。通过测试临床样本来评价方法的特异性,通过标准品评价方法的灵敏度。Omicron RT-qPCR分型方法显示能够可靠地区分Omicron变异株和“野生型”SARS-CoV-2及Alpha、Beta、Delta变异株及甲型流感病毒。选取68例新冠疑似样本,全基因组测序(Whole genome sequencing,WGS)结果显示44例为Omicron变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阳性;11例为Delta变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阴性;另外,通过WGS分析未能成功分型的7例样本,通过Omicron RT-qPCR分型方法成功鉴定为Omicron BA.1和BA.2变异株。我们开发的Omicron RT-qPCR分型方法可以在普通的PCR检测实验室应用,为我国疾控系统和医疗机构及时监测SARS-CoV-2 Omicron变异株的传播提供可靠的技术支撑。

    网络首发时间: 2022-09-07 11:47:43[查看摘要][在线阅读][下载 460K]
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  • 扁刺蛾核型多角体病毒新分离株的基因组测序与分析

    王金昌;类承凤;陈俊晖;占智高;况文东;关丽梅;杨健;李江怀;周溪;靳亮;王君

    从自然死亡的扁刺蛾幼虫分离到一株核型多角体病毒。扁刺蛾核型多角体病毒新分离株(Oxyplax ochracea nucleopolyhedrovirus-Thosea sinensis,OxocNPV-Ts)具有典型的杆状病毒特征,呈单粒包埋型病毒粒子,病毒颗粒(Occlusion-derived virus,ODV)呈不规则的多边形,直径为0.63μm~1.49μm。OxocNPV-Ts能有效杀灭扁刺蛾幼虫,它对扁刺蛾幼虫的半致死浓度LC_(50)为4×10~6PIB/mL,是一种理想的生物防治剂。本实验对OxocNPV-Ts基因组进行了测序和鉴定。OxocNPV-Ts基因组全长114781 bp,包含124个开放阅读框。它与斜纹刺蛾核型多角体病毒(OxocNPV)关系最为密切,序列相似性高达99%。系统进化分析表明,OxocNPV-Ts属于杆状病毒科alpha杆状病毒属(Alphabaculovirus),根据国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)的种属划分标准,OxocNPV-Ts是OxocNPV的一个株系。新报道的基因组为研究该病毒毒力的分子机制提供了理论基础。

    网络首发时间: 2022-08-25 17:32:58[查看摘要][在线阅读][下载 1020K]
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  • 非编码RNA调控流感病毒复制的作用及相关机制研究进展

    杨娟;李岩;刘平;沈朝建;李吉达;毕玉海;韩岩岩;张毅

    流感病毒是一种重要人畜共患病,严重危害人类健康和畜牧业发展。A型流感病毒(Influenza A Virus,IAV)在宿主细胞内的复制受到多种因素的影响和调节,近年来的研究证明,非编码RNA(ncRNA),包括miRNA、LncRNA、CirRNA等,在流感病毒复制过程中起到重要的调控作用。ncRNA调控流感病毒复制有直接途径和间接途径两种,其中直接途径为直接作用于病毒的vRNA或mRNA,在转录或翻译水平影响病毒的复制。间接途径为作用于细胞内不同的信号通路,通过影响细胞因子合成、诱导宿主细胞凋亡、引起细胞自噬反应等途径,影响病毒的复制。通常情况下,由宿主编码的ncRNA能够抑制病毒的复制,而由病毒编码的ncRNA能够减弱宿主细胞的抗病毒反应,促进病毒复制。通过总结和梳理近年来关于ncRNA调控流感病毒复制的研究,我们发现ncRNA能够作为调控增强宿主细胞抗病毒免疫、下调病毒转录和翻译的工具,有望开发成为抗流感病毒靶向药物。后续的机制研究应不局限于某一种或几种ncRNA的作用,而应在ncRNA在宿主细胞内的分泌机制、调控的分子网络等方面进行深层次的探究。

    网络首发时间: 2022-08-18 15:44:28[查看摘要][在线阅读][下载 451K]
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  • SARS-CoV-2引发缺血性脑卒中的机制研究进展

    丁慧敏;李彦杰;华晓琼;郝晨源;赵楠楠;孙孟艳;郝晓丹

    新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)目前仍在全球肆虐传播,在引发2019新冠肺炎(Corona virus disease 2019,COVID-19)的同时,还能造成感染者中枢神经系统的损伤。缺血性脑卒中是COVID-19相关神经系统损伤常见病之一。本文归纳出SARS-CoV-2进入中枢的途径,以及该病毒是如何通过介导氧化应激反应、肾素-血管紧张素系统的失调、攻击血管内皮细胞、激活NLRP3炎症小体、释放中性粒细胞胞外陷阱、引发细胞因子风暴等一系列分子机制导致缺血性脑卒中的发病,以期为疾病的临床预防和治疗提供一些新的见解和思路。

    网络首发时间: 2022-08-18 09:50:17[查看摘要][在线阅读][下载 430K]
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  • 病毒感染调控JAK/STAT信号通路:逃避与利用

    侯贝;徐乐灵;王涛

    JAK/STAT信号通路是天然免疫过程中一条关键通路,参与了干扰素信号传递入细胞核的过程。研究表明,病毒通过逃避甚至利用JAK/STAT信号通路,对抗干扰素系统的抗病毒效果。在此过程中,调控干扰素受体蛋白、减少JAK和STAT蛋白的数量、阻碍STAT的磷酸化或核易位,又或是上调SOCS家族蛋白都是病毒常用的手段。本文重点介绍了病毒调控JAK/STAT信号通路的过程,为病毒致病机理的研究和抗病毒药物的设计提供了理论基础。

    网络首发时间: 2022-08-16 15:21:44[查看摘要][在线阅读][下载 422K]
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  • 自噬与NLRP3炎症小体的相互作用

    田娇;谢正德

    自噬是一种普遍存在的细胞内稳态机制,通过将细胞质成分运送到溶酶体进行降解,以抵抗病原体感染并促进氨基酸循环。NLRP3炎症小体是一种多蛋白复合物,在多种内源和外源性刺激下被激活,介导促炎细胞因子的分泌,参与炎症的发生。自噬功能失调可导致NLRP3炎症小体的过度激活,引起各种炎症性疾病以及癌症的发生。自噬作为NLRP3炎症小体的一种重要调节方式,可以通过去除NLRP3炎症小体的激活信号、包裹和降解其成分来调控炎症小体。此外,自噬在调控IL-1β的分泌中也起着重要作用。同样,NLRP3炎症小体也调控自噬过程,以平衡宿主防御所需的适当炎症反应以及预防过度、有害炎症的发生。因此,阐明这两个生物学过程之间的相互作用,能够加深对相关疾病发病机制的认识,为疾病治疗及药物研发提供新的思路和理论基础。

    网络首发时间: 2022-08-11 18:22:05[查看摘要][在线阅读][下载 474K]
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  • 新冠病毒变异株“奥密克戎”的研究进展

    孙泽宇;柴佳彤;许建成

    2021年11月在南非首次发现严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)Omicron变异株(B.1.1.529),随后世卫组织将该毒株定义为第五种关注变体(VOC)。与其他四种VOC(Alpha、Beta、Gamma和Delta)相比,Omicron是突变最多的毒株,更易传播和发生免疫逃逸。如今Omicron正发展成为全球许多国家的主要毒株,给预防和控制2019年冠状病毒病(COVID-19)带来新的挑战。本文章旨在对Omicron变异株的流行病学、突变及来源、传染性、核酸和抗原检测、临床致病性、疫苗反应性等信息作一简要综述,以期为监测、预防和疫苗研发策略提供科学参考。

    网络首发时间: 2022-08-05 16:43:48[查看摘要][在线阅读][下载 582K]
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  • 人低密度脂蛋白受体相关蛋白6通过增强I型干扰素信号通路抑制宿主中的肠道病毒EV71和柯萨奇病毒CA16

    郭泽铭;蔡秋虹

    初步探索在EV71和CA16感染过程中,人低密度脂蛋白受体相关蛋白6(Low-density lipoprotein receptorrelated protein 6,LRP6)通过作用于I型干扰素信号通路对EV71和CA16的抑制作用。使用qRT-PCR和Western Blot分别检测了EV71和CA16两种病毒感染Vero细胞后LRP6的表达情况;通过TCID50实验检测细胞中EV71和CA16病毒的RNA水平;通过双荧光素酶报告实验检测LRP6对NF-κB活化的影响;通过双荧光素酶报告实验检测RIG-I转录活性。EV71和CA16感染后,随着感染时间的延长,LRP6的表达逐渐升高;过表达LRP6后,细胞中感染性活病毒滴度也有显著下降;在仙台病毒诱导下,过表达LRP6,NF-κB转录活性显著增强;LRP6是通过靶向TBK1及其上游分子来激活I型干扰素通路。LRP6在EV71和CA16感染过程中会增强I型干扰素信号。

    网络首发时间: 2022-07-04 09:42:04[查看摘要][在线阅读][下载 506K]
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  • 4例新型冠状病毒感染病例鼻拭子、咽拭子病毒核酸检测和血浆抗体检测结果分析

    陈荣华;李勤光;赵敏;陈惠聪;康惠玲;柳丽娟

    新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测和血浆抗体检测是目前确诊新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的重要依据。为比较分析SARS-CoV-2感染病例鼻拭子与咽拭子的病毒核酸检测及其血浆病毒抗体检测结果,本研究采用实时荧光定量PCR方法,分别检测4例COVID-19确诊病例鼻拭子与咽拭子标本的SARS-CoV-2 ORF 1ab基因和N基因,并采用胶体金法检测血浆标本中的SARS-CoV-2 IgM和IgG抗体。结果显示,在4例COVID-19确诊病例中,鼻拭子中病毒ORF 1ab基因及N基因的核酸扩增信号均强于咽拭子,Ct值均低于咽拭子;血浆病毒抗体检测仅发现1例标本SARS-CoV-2 IgG单阳性。本研究结果提示,鼻拭子标本的病毒含量明显高于咽拭子标本,血浆病毒IgM和IgG抗体检测是COVID-19辅助临床诊断的有效工具。

    网络首发时间: 2021-04-08 17:02:37[查看摘要][在线阅读][下载 1162K]
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  • EB病毒的发现:偶然之中的必然

    夏巍;赖永静;杜龙;王梦琳;王红;戢克铜;冯清源;唐安洲

    肿瘤作为威胁人类健康的第一大杀手,自发现伊始全球科研工作者对于其病因的求索就从未停止过。1958年英国外科医师Denis Parsons Burkitt在乌干达医院观察到一种独特类型的肿瘤,1964年Michael Anthony Epstein和Yvonne Barr利用电子显微镜在这种特殊肿瘤的活检组织细胞中观察到一种类似疱疹病毒颗粒的新病毒,并将其命名为EB病毒,这无疑为肿瘤的病因研究开启了一扇新的大门—病毒与肿瘤。EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)的发现是医学史上一项革命性的发现,如同许多其它伟大发现一样,EB病毒的发现之旅充满了曲折艰辛,亦不乏机缘巧合,例如Denis Parsons Burkitt与Michael Anthony Epstein具有决定性作用的会面,一个是外科医师,一个是动物病毒学家;一个在贫穷落后的非洲乌干达,一个在正值百花齐放、百家争鸣的英国伦敦,似乎是命运的安排才让两个看似毫不相干的人得以相见。这样的“偶然”还有很多。然而,当我们详尽的了解这趟不同寻常的旅程之后发现每一个巧合或是偶然背后都有着必然,这种必然来源于他们对真理的坚持,对细节的专注,以及敢于推陈出新的创新精神。探寻EB病毒的发现过程,不仅可以更加全面的了解EB病毒,丰富科研知识,更重要的是对前辈们优秀品质的继承和发扬。

    网络首发时间: 2019-03-15 10:50:34[查看摘要][在线阅读][下载 442K]
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  • 五株人冠状病毒NL63的基因型鉴定及S1 domain基因特征分析

    何佩;崔爱利;徐瑾;高立冬;余鹏博;孙凯旋;许文波;许晓光

    为阐明我国部分地区人冠状病毒(Human coronavirus,HCoV)NL63基因特征,本研究对2013年陕西省、2018年河南省和湖南省送检的5株HCoV-NL63核酸检测阳性的呼吸道样本进行HCoV-NL63基因型别鉴定及S1 domain基因特征分析。通过对HCoV-NL63棘突蛋白(Spike glycoprotein,S)基因的S1 domain区域进行基因扩增和序列测定,同时结合GenBank数据库下载的1983~2018年其他国家74条HCoV-NL63代表株序列和2007~2010年中国流行的12条HCoV-NL63代表株序列,构建基因亲缘性关系树,并对S蛋白的S1 domain区域进行核苷酸序列比对分析。结果提示全球HCoV-NL63流行株可划分为A和B两个基因型;A基因型可进一步划分为A0,A1,A2和A3四个基因亚型,其中本研究将GenBank中2008年中国流行的2株HCoV-NL63毒株划分为新基因亚型(A3);B基因型可进一步划分为B0,B1和B2三个基因亚型。A和B基因型的HCoV-NL63代表株序列在地域分布上无明显差异,但A基因型不同基因亚型的HCoV-NL63序列在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。在我国A和B基因型HCoV-NL63均已被检测到,但主要以A基因型流行为主,且主要集中在A1和A2基因亚型。不同基因型HCoV-NL63序列在S1 domain区域核苷酸和氨基酸序列上存在特征性差异。本研究通过对五株HCoV-NL63基因型鉴定及S1 domain基因特征分析,初步阐明了我国部分地区流行的HCoV-NL63基因型/基因亚型分布情况及基因特征,丰富了我国本土流行的HCoV-NL63基因数据库,为我国HCoV-NL63分子流行病学研究及分子检测和监测技术的改进和验证提供了基础基因数据。

    网络首发时间: 2019-03-08 15:54:24[查看摘要][在线阅读][下载 563K]
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