病毒学报

慢性乙型肝炎功能性治愈生物标志物的过去、现状与未来

埃可病毒11型不同基因型间交叉中和效应及抗原性变异的初步研究

2023年福建省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析

EV-A71疫苗上市前后河北地区EV-A71流行株VP1区基因特征分析

EV-A71或CV-A16灭活疫苗通过两种不同接种途径免疫小鼠诱导的BCR重链可变区基因特征比较

深度突变扫描在RNA病毒变异风险评估中的应用

深度突变扫描（Deep mutational scanning,DMS）是近年发展的一种高通量的评估病毒变异风险的前沿生物技术方法。DMS通过人工突变产生海量的病毒变异体模拟病毒潜在的变异，同时测定变异体的重要表型如受体结合亲和力、免疫逃逸、适应性和耐药性等，评估变异对表型的影响及其风险。DMS需要综合运用病毒突变文库构建、病毒表型测定和深度测序等多种高通量平台，对于平台技术的要求极高。新冠病毒疫情期间，DMS被广泛应用于评估病毒变异对受体结合力和免疫逃逸等表型的影响，全方位地展示了其在表型预测和变异风险评估中的重要作用。本文对DMS在新冠病毒、肠道病毒、流感病毒和HIV等代表性RNA病毒研究中的应用进行综述，帮助认识DMS在RNA病毒变异风险评估中的广阔应用前景。

基于PRV-copGFP的伪狂犬病毒快速中和抗体效价检测方法的建立

本研究开发了一种高效且精准的伪狂犬病病毒（Pseudorabies virus, PRV）中和抗体效价检测新方法。通过同源重组和CRISPR-Cas9技术，将桡足纲绿色荧光蛋白（copepod Pontellina plumata Green Fluorescent Protein,copGFP）基因表达盒精确嵌入PRV基因组的UL40/41区域，经过多轮筛选与纯化，成功构建了重组病毒PRVcopGFP。生长特性对比实验表明，PRV-copGFP与野生型PRV-Bartha之间无显著差异（P>0.05）。借助CTLImmunoSpot?S6仪器计数表达copGFP的细胞数目，确定了最佳观测时间和最佳病毒滴度。该方法可精确计算中和抗体效价，并通过传统噬斑减少中和试验（Plaque reduction neutralization test, PRNT）进行验证。与传统方法相比，本检测方法将检测窗口缩短至10h，且通量显著提升。本方法在快速评估PRV中和抗体效价方面具有显著优势，可为PRV疫苗研发、疾病防控及相关研究提供有力的技术支持。

家蚕对核型多角体病毒抗性的研究进展

家蚕核型多角体病毒（Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV）是家蚕的主要病原，其引发的家蚕血液型脓病严重危害蚕桑产业发展。研究家蚕对BmNPV的抗性机制有利于防控脓病，对蚕业发展具有重大意义。本文对家蚕抗BmNPV的遗传规律、品种选育、主效基因连锁定位、相关基因/蛋白发掘以及免疫应答机制等方面研究进展进行了综述，提出了图位克隆鉴定家蚕抗BmNPV主效基因，并对其功能和涉及的通路进行研究，将会是今后研究的重点，而优化家蚕参考基因组和采取新策略排除微效基因干扰是定位出该主效基因的必要之举。

人乳头瘤病毒相关宫颈癌中DNA甲基化的研究现状

宫颈癌与人乳头瘤病毒（Human papilloma virus,HPV）联系紧密，持续感染高危HPV是宫颈癌的主要诱因。表观遗传的重要修饰方式DNA甲基化在基因转录中发挥关键作用，基因甲基化水平异常与细胞癌变联系紧密。甲基化可表现在宿主细胞基因中，亦可表现在HPV病毒基因中，两者相互影响，在癌变进程中起着关键作用。本文总结了HPV基因甲基化改变，综述了宿主基因甲基化及与HPV基因甲基化关联，有助于进一步探讨宫颈癌的治疗新思路。

MPXV的流行动态、遗传演化分支及其公共卫生安全挑战

猴痘（Monkeypox,Mpox）是由猴痘病毒（Mpox virus,MPXV）感染引起的一种以发热、皮疹和淋巴结肿大为特征的病毒性人兽共患病，近3年内两次被WHO认定为“全球关注的突发公共卫生事件”，分别由MPXV进化亚支Ⅱb和Ⅰb毒株谱系引起，并在世界范围内暴发流行，其中MPXV进化亚支Ⅱb毒株曾在我国输入性感染和本土隐秘性传播，波及全国至少25个省市区，目前MPXV进化亚支Ⅰb毒株也输入我国，并造成密切接触感染形成二代病例，这对我国公共卫生安全构成了巨大的威胁和挑战。该文通过对MPXV的流行动态以及不同遗传进化亚支毒株和生物学特性的介绍，探讨其从动物到人类适应后在人际间共流行的趋势和危害，为Mpox防控和公共卫生风险应对提供依据。

含P_RP_L启动子的原核高效表达载体的组建及其应用

我们组建了一个含P_RP_L自动子的原核高效表达载体,它同时含有cI调控基因、多酶切点和两个强的转录终止序列。带起始密码子ATG的外源基因可以插入启动子下游的多酶切点,表达非融合蛋白,产品可供临床使用。我们实验室已用它成功地表达了人γ干扰素、人白细胞介素-2和人肿瘤坏死因子等,表达量均占菌体总蛋白的20％以上。

鸡的J亚群白血病病毒的分离及部分序列比较

通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应 (PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应 (IFA) ,从某大型肉用型种鸡场的疑似J亚群白血病的病鸡中 ,以及 2 5个临床健康的商品代肉鸡群的 2群中 ,分离鉴定出J亚群禽白血病病毒 (ALV J)。在用抗ALV Jgp85单克隆抗体JE9的IFA中 ,来自病鸡群的两株病毒SD990 1和SD990 2呈强阳性反应 ,来自临床健康肉鸡群的YZ990 1和YZ990 2株呈弱阳性反应。对YZ990 1株和SD990 2株的PCR产物直接测序结果表明 ,这二个中国株的囊膜蛋白 gp85的氨基酸组成与原型株HPRS 10 3及美国分离株ADOL Hcl有 89%～ 93%的同源性 ,它们相互间的同源性是 92 %。其 3′端LTR区与原型株HPRS 10 3则有 95 %～ 97%的同源性 ,但中国的两株病毒在紧靠 3′端LTR的“E”成分中 ,出现了一个 139个碱基的缺失性突变 ,而代之以一个 11个碱基的插入序列。

在我国腹泻患儿中发现诺瓦克样病霉感染

诺瓦克病毒是引起无菌性急性胃肠炎爆发的重要病原。１９９０年１０月至１９９１年１月从河南省急性腹泻门诊患儿便样中发现了诺瓦克样病毒。经电镜观察，病毒直径约为２８ｎｍ，病毒壳似由有结构的亚单位组成，进一步用诺瓦克病毒特异的寡核苷酸引物做逆转录一聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ），检定为阳性。由ＰＣＲ产物测得的核苷酸序列与诺瓦克病毒原型株相应序列比较，同源性为７２％。以上结果证实，在我国腹泻病人中有诺瓦克样病毒感染。这对我国病毒性胃肠炎流行的防治研究具有重要意义。

肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征

2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源

我国地方品种鸡分离到的一个禽白血病病毒新亚群的鉴定

为探明我国地方品种鸡群禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)的特点,通过接种DF-1细胞及细胞培养上清液p27抗原的检测,从芦花鸡中分离得到三株外源性ALV禽白血病病毒,分别是JS11C1、JS11C2和JS11C3,并对其进行亚群鉴定分析。用PCR方法扩增env基因测序,并与已知鸡源各亚群ALV的囊膜蛋白(gp85)作氨基酸同源性比较。这三株ALV的env基因的gp85大小为1 005bp,编码335个氨基酸;env基因的gp37大小为609bp,编码203个氨基酸。三个毒株之间gp85的同源性为91.9%～97.0%。与A、B、C、D和E五个经典亚群在GenBank中已发表的18个毒株的gp85的同源性仅在77.7%～84.6%间,显著低于鸡群中常见的A、B、E各亚群内的同源性范围(分别为88.2%～98.5%,91.6%～98.8%和97.9%～99.4%),而与J亚群参考株的同源性更是只有34.2%～36.5%。上述结果表明,芦花鸡分离到的三株病毒可能是不同于鸡源ALV已知6个亚群的一个新亚群,按国际上对ALV亚群分类的习惯,初步将其定名为K亚群。

新冠病毒SARS-CoV-2的感染机制研究进展

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的冠状病毒病2019(COVID-19)作为一种新发传染病,已经蔓延到全世界的多个国家和地区,被WHO判定为全球大流行病(Pandemic disease),引发了严重的公共卫生安全问题。自SARS-CoV-2出现以来,病毒溯源和中间宿主等问题得到了民众的广泛关注,虽然只有约2%的感染者有野生动物接触史,但科学家普遍认为SARS-CoV-2是一种来自野生动物的病毒。病毒的跨种属传播十分困难,而且往往会引起新宿主的高病死率,但SARS-CoV-2被发现以来,表现出对人类机体已经有了很好的适应性,具有传播能力强和病死率较低的特性,这与之前发现的引起新发、突发传染病的大多数病毒有所不同。因此,本文对SARS-CoV-2的病原学,功能受体和基因组进化等方面的研究进展进行综述,以期为SARS-CoV-2的溯源提供新的视角。

新型冠状病毒肺炎的疫情趋势预测

2019年12月以来,湖北省武汉市部分医院陆续发现了多例不明原因肺炎病例,现已证实为新型冠状病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)。全国各地采取了前所未有的措施,大力开展疾病救治和防疫工作。本文收集中国国家卫生健康委员会公布的官方统计数据预测疫情走向。传统SEIR模型中仅考虑病例和处于潜伏期的感染者,病例具有传染性而潜伏者无传染性;事实上,新冠肺炎确诊患者在医院中隔离无法对外界易感人群造成感染,有研究表明处于潜伏期的感染者可能具有传染性。因此,本研究提出了改进的传染病传播模型—ISEIR,将患者分为未收治的发病患者(具有传染性)和已收治的确诊患者(不考虑传染性),并考虑处于潜伏期的感染者具有传染性;以历史数据动态拟合模型参数,来摆脱固定参数的局限性。在数据预处理中根据每日有效再生数的概率分布将2020年2月12至14日这三天的临床诊断数据进行预处理,摊入到前期数据中。疫情分成全国(湖北省外)和湖北省两大区域分别进行探讨,通过新模型ISEIR预测今后疫情的进一步发展,并计算每日的有效再生数变化。结果显示,湖北省的有效再生数从3.108逐渐降低,2020年4月19日所有患者将全部治愈出院,累计确诊患者为66 487人;全国(湖北省外)的初始有效再生数为1.929,小于湖北省,2020年3月26日所有患者全部治愈,累计确诊患者13 270人。从结果中可以发现,在严格的防控措施下疫情得到了有效抑制,验证了目前防控措施的有效性,但仍需要防止复工潮引起的疫情反弹。

新型冠状病毒（2019-nCoV）治疗药物体内外研究及药物研发进展

2019年12月以来,中国湖北省武汉市陆续发现了多例新型冠状病毒感染的肺炎患者,随着疫情的蔓延,中国其他地区及境外也相继发现了此类病例。2020年1月12日,世界卫生组织(WHO)将该新病毒暂定命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。2019-nCoV是继SARS冠状病毒(SARS-CoV)、MERS冠状病毒(MERS-CoV)之后发现的一种具有高传染性且可以引起重症呼吸道疾病的新型病毒,临床尚无特效治疗药物。本文结合临床治疗、体内外的研究对相关指南推荐的治疗药物及药物研发进展进行综述,旨在为2019-nCoV病毒感染的肺炎患者的临床治疗提供借鉴。

2019新型冠状病毒的研究进展

自2019年12月以来,新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的肺炎疫情在中国武汉暴发,随后疫情迅速蔓延,扩散至中国其它各省市。新型冠状病毒属于β冠状病毒属,与SARS-CoV和MERS-CoV近缘但有较大区别,尤其是刺突蛋白(Spike,S),根据序列相似性推断可能来源于蝙蝠,使用与SARS-CoV相同的血管紧张素转化酶Ⅱ(Angiotensin-converting enzyme Ⅱ,ACE2)受体进入细胞,以飞沫和接触传播为主要传播途径,缺乏有效药物治疗和疫苗是疫情防控的挑战。

埃博拉病毒侵染细胞机制的研究进展

埃博拉病毒能在人类和非人灵长类中引起严重的埃博拉出血热,病死率可高达90%,并且目前还没有针对埃博拉病毒有效的疫苗或者是治疗手段。面对埃博拉病毒带来的挑战,针对埃博拉病毒的相关研究已经成为病毒学的热点问题。其中,关于埃博拉病毒侵染细胞机制的科学研究对于开发病毒疫苗以及新型治疗药物有非常关键的作用。因此,本综述拟就埃博拉病毒侵染细胞机制方面的研究进展进行总结。