病毒学报

贵州省南部地区2019-2024年手足口病病原谱构成及流行特征的研究

聚集性发热疫情相关的柯萨奇病毒A组4型VP1区基因特征分析

北京市丰台区人偏肺病毒聚集性发热疫情的基因特征分析

朊病毒感染的细胞及小鼠模型中SUMO1修饰的变化及与朊蛋白相互作用的研究

2023年广州市荔湾区诺如病毒胃肠炎疫情毒株遗传变异特征分析

肺泡巨噬细胞极化与线粒体代谢重编程在病毒性肺炎中的相互作用机制及中医药治疗的研究进展

病毒性肺炎的免疫病理损伤与肺泡巨噬细胞（Alveolar macrophages, AMs）的极化失衡密切相关，而线粒体代谢重编程是AMs功能表型调控的核心机制之一，AMs可通过动态切换代谢模式，调节极化平衡，从而调控免疫应答强度，而极化状态又通过细胞因子和信号分子反馈调节线粒体代谢活性，这种相互作用在病毒性肺炎中既参与抗病毒防御，又可能介导免疫病理损伤。病毒作用于AMs线粒体代谢的关键节点，干扰代谢-免疫平衡，导致AMs发生M1和M2型极化，从而进入不同的代谢状态；不同极化状态下的AMs又能够通过合成不同的细胞因子对线粒体的代谢模式进行反馈调节。因此，靶向AMs线粒体代谢相关靶点，调节AMs极化平衡，有利于促进肺部炎症消散和肺组织修复过程的平衡，是病毒性肺炎相关药物研发的重要方向。对此，本文分别总结了AMs极化与线粒体代谢过程的相互调控机制及其在病毒性肺炎发病机制中的作用，以期深入揭示病毒感染后，宿主代谢-免疫微环境的整体调节规律，并进一步阐明中药多通路、多靶点的特性在调控代谢-免疫平衡治疗病毒性肺炎中的优势所在，为中药抗病毒新药的研发提供参考。

2024-2025年冬季河南省商丘市一养殖场犬流感暴发特征分析

河南省商丘市一处宠物犬养殖场在2024–2025年冬季出现两次聚集性流感样病例，本研究采集了流感样病例样本并进行了A型流感病毒检测和测序，描述了A型流感病毒的流行病学特征与基因进化特征。共采集来自2024只犬的3898份样本，其中708份A型流感阳性。两次暴发中咽拭子阳性率均最高（59.03%、25.26%）、肛拭子阳性率均最低（17.62%、4.80%），所有阳性肛拭子对应犬只咽拭子均阳性，表明病毒主要存在于犬只的呼吸道。阳性样本中376份获得了HA与NA完整度>80%的序列，HA同源性98.28%–100.00%,NA同源性99.00%–100.00%。系统发育分析显示，本研究序列与2018年后犬源H3N2聚为同一分支，NA树内形成两个小分支，提示可能存在多个来源。高频率的新犬引入可能是持续暴发的关键驱动因素，建立犬流感病毒监测体系、实现疫情早期识别与干预，将为后续犬只呼吸道传染病防控策略的优化提供重要支持。

肠道病毒病的防控现状、核心难题及创新方向

肠道病毒病是由肠道病毒（Enterovirus, EV）感染引起的一组疾病，从传统的脊髓灰质炎（Poliomyelitis）到现今常见的手足口病（Hand, foot, and mouth disease, HFMD），一直是全球公共卫生领域的重要问题。在肠道病毒病防控过程中，口服脊髓灰质炎减毒活疫苗（Oral poliovirus vaccine, OPV）和注射脊髓灰质炎灭活疫苗（Inactive poliovirus vaccine, IPV）为全球根除脊髓灰质炎行动（Global polio eradication initiative, GPEI）提供了有力支持，同时，肠道病毒病疫情监测体系的建立也有效提升了应对能力。然而，肠道病毒病的疾病负担依然较重，其传播途径多样，且病毒基因组易变异，导致防控工作面临持续挑战。本文介绍肠道病毒病的基本特征与防控现状，强调加强防控的必要性，并提出相应策略，为疾病防控和公共卫生风险管理提供参考。

我国人副流感病毒相关急性呼吸道感染流行特征和疾病负担的Meta分析

为了解我国人副流感病毒（Human parainfluenza viruses, HPIVs）的流行特征和疾病负担，本研究对筛选出的2006至2025年我国155篇HPIVs感染相关中英文研究（覆盖25个省份944983名免疫功能正常个体）进行了系统回顾和Meta分析，以评估HPIVs感染的流行病学特征，并基于傅里叶项线性时间序列回归模型预测HPIVs流行趋势，采用归因分数估算5岁以下儿童HPIVs感染的疾病负担。结果显示，我国急性呼吸道感染（acute respiratory infection, ARI）中HPIVs感染合并阳性率为7.25%(95%CI:6.26%～8.23%),5岁以下儿童为主要易感人群（6.42%,95%CI:5.63%～7.26%），其中<1岁婴幼儿合并阳性率最高（8.38%,95%CI:6.79%～9.97%）;2019年5岁以下儿童中约5.22%(18.6万例)的下呼吸道感染（Lower respiratory tract infection, LRTI）病例和5.23%(678例)LRTI相关死亡病例可归因于HPIVs感染。HPIV3和HPIV2主要感染1岁以下婴儿，而HPIV1和HPIV4则主要分布于1-2岁幼儿组；HPIVs与LRTI显著相关（合并阳性率为7.52%,95%CI:6.09%～9.25%），其中HPIV3、HPIV1和HPIV2在LRTI/严重急性呼吸道感染病例组的合并阳性率显著高于上呼吸道感染/轻型ARI病例组（均P<0.001）。北方地区合并阳性率（7.99%,95%CI:5.79%～10.19%），显著高于南方地区（6.79%,95%CI:5.69%～7.90%）(P<0.001)；除外HPIV4，各血清型在北方地区的合并阳性率均显著较高（P<0.001）;HPIVs流行呈现"夏季高发、秋冬季低发"特征，以HPIV3（流行高峰4～9月）和HPIV1（流行高峰6～10月）为主要流行型别。季节性流行模式在新冠疫情期间被打破，尽管2023-2024年疫情后已逐步恢复，但HPIVs感染合并阳性率（3.47%,95%CI:2.42%～4.70%）仍显著低于2019年之前的水平（5.55%,95%CI:4.82%～6.32%）。本研究完善了我国HPIVs流行病学数据，为指导临床诊疗、疾病防控和疫苗研发提供了重要循证依据。

双抗体夹心ELISA法检测发热伴血小板减少综合征病毒核蛋白抗原的方法研究

为建立发热伴血小板减少综合征病毒（Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV）抗原检测方法，本研究基于SFTSV核衣壳蛋白（Nucleocapsid protein, NP）抗原表位分布特征分析，通过大肠杆菌原核表达系统对NP蛋白进行分段重组表达，制备了完整的NP(1～256 aa)、NP氨基端（1～151 aa）和NP蛋白羧基端（149～256 aa）三种蛋白。经Western-Blot验证重组蛋白免疫原性，免疫新西兰兔制备多克隆抗血清，采用间接ELISA和间接免疫荧光（Immunofluorescence assay, IFA）进行评估和结合活性定量分析，对捕获抗体与酶标抗体最佳组合等反应条件进行优化，比较优化样本处置方式，建立双抗体夹心ELISA检测病毒抗原的方法。以定量的热灭活病毒和重组NP蛋白为参考品绘制标准曲线，评价方法的灵敏性，确定检测限，并通过与qRT-PCR检测确诊SFTS患者血清30份、核酸检测阴性健康体检者血清30份、灭活汉坦病毒和登革病毒各5份、肾综合征出血热患者血清10份，评估方法的其敏感性、特异性和重复性。结果显示，本研究建立的夹心ELISA检测方法对NP蛋白和SFTSV病毒液的最低检出限分别为0.13 pg/μL,17 PFU/100μL，与登革病毒、汉坦病毒不发生交叉反应，批间、批内变异系数均小于5%，样本处理温度和非离子型去污剂的添加是影响抗原检测灵敏度的一个重要因素。综上，本研究建立的双抗体夹心ELISA抗原检测方法具有良好的特异性、灵敏度和重复性，为SFTSV感染的早期临床诊断和现场流行病学调查提供了一种可靠、高效的检测工具。

含P_RP_L启动子的原核高效表达载体的组建及其应用

我们组建了一个含P_RP_L自动子的原核高效表达载体,它同时含有cI调控基因、多酶切点和两个强的转录终止序列。带起始密码子ATG的外源基因可以插入启动子下游的多酶切点,表达非融合蛋白,产品可供临床使用。我们实验室已用它成功地表达了人γ干扰素、人白细胞介素-2和人肿瘤坏死因子等,表达量均占菌体总蛋白的20％以上。

鸡的J亚群白血病病毒的分离及部分序列比较

通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应 (PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应 (IFA) ,从某大型肉用型种鸡场的疑似J亚群白血病的病鸡中 ,以及 2 5个临床健康的商品代肉鸡群的 2群中 ,分离鉴定出J亚群禽白血病病毒 (ALV J)。在用抗ALV Jgp85单克隆抗体JE9的IFA中 ,来自病鸡群的两株病毒SD990 1和SD990 2呈强阳性反应 ,来自临床健康肉鸡群的YZ990 1和YZ990 2株呈弱阳性反应。对YZ990 1株和SD990 2株的PCR产物直接测序结果表明 ,这二个中国株的囊膜蛋白 gp85的氨基酸组成与原型株HPRS 10 3及美国分离株ADOL Hcl有 89%～ 93%的同源性 ,它们相互间的同源性是 92 %。其 3′端LTR区与原型株HPRS 10 3则有 95 %～ 97%的同源性 ,但中国的两株病毒在紧靠 3′端LTR的“E”成分中 ,出现了一个 139个碱基的缺失性突变 ,而代之以一个 11个碱基的插入序列。

在我国腹泻患儿中发现诺瓦克样病霉感染

诺瓦克病毒是引起无菌性急性胃肠炎爆发的重要病原。１９９０年１０月至１９９１年１月从河南省急性腹泻门诊患儿便样中发现了诺瓦克样病毒。经电镜观察，病毒直径约为２８ｎｍ，病毒壳似由有结构的亚单位组成，进一步用诺瓦克病毒特异的寡核苷酸引物做逆转录一聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ），检定为阳性。由ＰＣＲ产物测得的核苷酸序列与诺瓦克病毒原型株相应序列比较，同源性为７２％。以上结果证实，在我国腹泻病人中有诺瓦克样病毒感染。这对我国病毒性胃肠炎流行的防治研究具有重要意义。

肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征

2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源

我国地方品种鸡分离到的一个禽白血病病毒新亚群的鉴定

为探明我国地方品种鸡群禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)的特点,通过接种DF-1细胞及细胞培养上清液p27抗原的检测,从芦花鸡中分离得到三株外源性ALV禽白血病病毒,分别是JS11C1、JS11C2和JS11C3,并对其进行亚群鉴定分析。用PCR方法扩增env基因测序,并与已知鸡源各亚群ALV的囊膜蛋白(gp85)作氨基酸同源性比较。这三株ALV的env基因的gp85大小为1 005bp,编码335个氨基酸;env基因的gp37大小为609bp,编码203个氨基酸。三个毒株之间gp85的同源性为91.9%～97.0%。与A、B、C、D和E五个经典亚群在GenBank中已发表的18个毒株的gp85的同源性仅在77.7%～84.6%间,显著低于鸡群中常见的A、B、E各亚群内的同源性范围(分别为88.2%～98.5%,91.6%～98.8%和97.9%～99.4%),而与J亚群参考株的同源性更是只有34.2%～36.5%。上述结果表明,芦花鸡分离到的三株病毒可能是不同于鸡源ALV已知6个亚群的一个新亚群,按国际上对ALV亚群分类的习惯,初步将其定名为K亚群。

新冠病毒SARS-CoV-2的感染机制研究进展

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的冠状病毒病2019(COVID-19)作为一种新发传染病,已经蔓延到全世界的多个国家和地区,被WHO判定为全球大流行病(Pandemic disease),引发了严重的公共卫生安全问题。自SARS-CoV-2出现以来,病毒溯源和中间宿主等问题得到了民众的广泛关注,虽然只有约2%的感染者有野生动物接触史,但科学家普遍认为SARS-CoV-2是一种来自野生动物的病毒。病毒的跨种属传播十分困难,而且往往会引起新宿主的高病死率,但SARS-CoV-2被发现以来,表现出对人类机体已经有了很好的适应性,具有传播能力强和病死率较低的特性,这与之前发现的引起新发、突发传染病的大多数病毒有所不同。因此,本文对SARS-CoV-2的病原学,功能受体和基因组进化等方面的研究进展进行综述,以期为SARS-CoV-2的溯源提供新的视角。

新型冠状病毒肺炎的疫情趋势预测

2019年12月以来,湖北省武汉市部分医院陆续发现了多例不明原因肺炎病例,现已证实为新型冠状病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)。全国各地采取了前所未有的措施,大力开展疾病救治和防疫工作。本文收集中国国家卫生健康委员会公布的官方统计数据预测疫情走向。传统SEIR模型中仅考虑病例和处于潜伏期的感染者,病例具有传染性而潜伏者无传染性;事实上,新冠肺炎确诊患者在医院中隔离无法对外界易感人群造成感染,有研究表明处于潜伏期的感染者可能具有传染性。因此,本研究提出了改进的传染病传播模型—ISEIR,将患者分为未收治的发病患者(具有传染性)和已收治的确诊患者(不考虑传染性),并考虑处于潜伏期的感染者具有传染性;以历史数据动态拟合模型参数,来摆脱固定参数的局限性。在数据预处理中根据每日有效再生数的概率分布将2020年2月12至14日这三天的临床诊断数据进行预处理,摊入到前期数据中。疫情分成全国(湖北省外)和湖北省两大区域分别进行探讨,通过新模型ISEIR预测今后疫情的进一步发展,并计算每日的有效再生数变化。结果显示,湖北省的有效再生数从3.108逐渐降低,2020年4月19日所有患者将全部治愈出院,累计确诊患者为66 487人;全国(湖北省外)的初始有效再生数为1.929,小于湖北省,2020年3月26日所有患者全部治愈,累计确诊患者13 270人。从结果中可以发现,在严格的防控措施下疫情得到了有效抑制,验证了目前防控措施的有效性,但仍需要防止复工潮引起的疫情反弹。

新型冠状病毒（2019-nCoV）治疗药物体内外研究及药物研发进展

2019年12月以来,中国湖北省武汉市陆续发现了多例新型冠状病毒感染的肺炎患者,随着疫情的蔓延,中国其他地区及境外也相继发现了此类病例。2020年1月12日,世界卫生组织(WHO)将该新病毒暂定命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。2019-nCoV是继SARS冠状病毒(SARS-CoV)、MERS冠状病毒(MERS-CoV)之后发现的一种具有高传染性且可以引起重症呼吸道疾病的新型病毒,临床尚无特效治疗药物。本文结合临床治疗、体内外的研究对相关指南推荐的治疗药物及药物研发进展进行综述,旨在为2019-nCoV病毒感染的肺炎患者的临床治疗提供借鉴。

2019新型冠状病毒的研究进展

自2019年12月以来,新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的肺炎疫情在中国武汉暴发,随后疫情迅速蔓延,扩散至中国其它各省市。新型冠状病毒属于β冠状病毒属,与SARS-CoV和MERS-CoV近缘但有较大区别,尤其是刺突蛋白(Spike,S),根据序列相似性推断可能来源于蝙蝠,使用与SARS-CoV相同的血管紧张素转化酶Ⅱ(Angiotensin-converting enzyme Ⅱ,ACE2)受体进入细胞,以飞沫和接触传播为主要传播途径,缺乏有效药物治疗和疫苗是疫情防控的挑战。

埃博拉病毒侵染细胞机制的研究进展

埃博拉病毒能在人类和非人灵长类中引起严重的埃博拉出血热,病死率可高达90%,并且目前还没有针对埃博拉病毒有效的疫苗或者是治疗手段。面对埃博拉病毒带来的挑战,针对埃博拉病毒的相关研究已经成为病毒学的热点问题。其中,关于埃博拉病毒侵染细胞机制的科学研究对于开发病毒疫苗以及新型治疗药物有非常关键的作用。因此,本综述拟就埃博拉病毒侵染细胞机制方面的研究进展进行总结。