• 新型冠状病毒肺炎长期健康损害的研究进展

    陈祺;胡潇文;黄兴成;黄悦;吴婷

    新型冠状病毒感染者在康复后可能会出现长期且持续的症状,受累器官系统广泛,给感染者造成健康损害。新型冠状病毒仍可能在全球范围内持续流行且免疫逃逸突变株不断出现,新冠肺炎后综合征已成为人类与新冠病毒抗衡道路上的又一重要挑战。本文对新冠肺炎长期健康损害的发生风险、临床表现及影响因素进行综述,以期为新冠肺炎后综合征的管理及疫情防控策略制定提供参考。

    网络首发时间: 2023-01-11 16:40:04[查看摘要][在线阅读][下载 689K]
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  • 四次跨膜蛋白在病毒感染中作用的研究进展

    李婉莹;叶伟;薛亚娟;张芳琳

    四次跨膜蛋白(Tetraspanins,Tspans)是一个作为“细胞膜主要组织者”的跨膜糖蛋白家族。它们与其他膜蛋白横向结合形成富含Tspans的微结构域(Tetraspanin-enriched microdomains,TEMs),在细胞表面建立了独特的平台,从而直接或间接参与病毒感染的多个阶段。Tspans在调控病毒进入、转录、复制和组装释放等阶段均发挥了重要作用。研究Tspans在病毒感染中的作用,可以为病毒感染疾病的临床药物研发提供新靶点。本文综述了Tspans在病毒感染中作用的研究进展。

    网络首发时间: 2023-01-04 10:54:16[查看摘要][在线阅读][下载 707K]
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  • 2011—2019年我国腹泻住院患儿中G1P[8]型A组轮状病毒的流行病学和临床特征分析

    魏宇航;孙晓曼;彭蕊;王萌璇;李静欣;庞立丽;范佳欣;李丹地;段招军

    了解2011—2019年G1P[8]型A组轮状病毒(Group A rotavirus,RVA)在我国腹泻住院患儿中的流行病学和临床特征。收集2011年1月—2019年12月我国病毒性腹泻监测网络数据。监测网数据的采集和整理采用EpiData 3.0软件和Excel 2010,应用SPSS 26.0软件进行数据分析。2011—2019年共采集到我国5岁以下急性胃肠炎住院患儿标本共计47 386份,结果显示G1P[8]型RVA阳性率为1.98%(938/47 386),G1P[8]型RVA感染不具有明显的性别分布特征。G1P[8]型RVA的流行季节为秋冬季,夏季该基因型有小暴发的情况发生。G1P[8]型RVA住院患儿在腹泻严重程度(χ~2=0.177,P=0.915,P>0.05)与非G1P[8]型RVA住院患儿无明显差异,G1P[8]型RVA相对于非G1P[8]型RVA患儿在发热(χ~2=22.572,P=0,P<0.05)、皮疹、肺炎、败血症等并发症(χ~2=12.921,P=0,P<0.05)少且轻。2011-2019年我国G1P[8]型RVA流行趋势逐渐下降,季节高峰为秋冬季,夏季偶有暴发,G1P[8]型RVA发热等并发症较非G1P[8]型RVA轻。本研究为RVA疫苗候选毒株选择提供数据参考,为G1P[8]型RVA防控和治疗提供基础数据支持。

    网络首发时间: 2022-12-22 16:19:41[查看摘要][在线阅读][下载 604K]
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  • 11种灭活型样本保存液对病毒核酸保护效果的比较

    史春丽;黄中强;范晓瑜;肖艳群;王雪亮

    收集11种不同厂家的灭活型样本保存液,将甲型流感病毒加入保存液和生理盐水中,在4℃、25℃和37℃条件下保存0 h、2 h、4 h、6 h和24 h后,分别提取各组的病毒核酸,并通过逆转录实时荧光PCR检测病毒载量变化,以探究不同样本保存液对病毒核酸保护效果是否存在差异。结果发现不同样本保存液中的病毒载量随保存时间和温度变化存在显著差异。据此可将11种灭活型样本保存液的保存效果分为四类:(1)优秀产品:在任一温度(4℃、25℃、37℃)条件下,即使保存24h时病毒核酸都未发生明显降解,占比27.2%(3/11);(2)良好产品:低温(4℃)和室温(25℃)情况下核酸未出现降解,但在高温(37℃)条件下6 h后保存效果明显下降,占比27.2%(3/11);(3)合格产品:低温(4℃)条件下对病毒核酸具有较好的保护效果,但在室温(25℃)和高温(37℃)情况下随保存时间延长其保护效果显著下降,占比18.1%(2/11);(4)不合格产品:任一保存条件下对病毒核酸的保护效果都较差,甚至加入病毒后立即导致病毒核酸发生快速降解,占比27.2%(3/11)。以上结果说明不同厂家样本保存液对病毒核酸的保护效果存在显著差异,可能会导致病毒核酸检测出现假阴性结果。因此,需重点加强对样本保存液的质量监管,以有效保障病毒核酸检测,尤其是新冠核酸检测质量,以更好地做好疫情防控工作。

    网络首发时间: 2022-12-22 16:09:25[查看摘要][在线阅读][下载 933K]
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  • 6种呼吸道病毒RT-RPA检测体系构建与应用

    徐聪灵;王静;耿合员;张阳;杨国平;陈峰;刘文干

    早期快速诊断是防控呼吸道病毒传播的有效手段,研发灵敏、特异、快速的分子检测技术方法是早期防控的前提和保障。本研究建立同时快速检测甲型流感病毒(Influenza A virus,FluA)、副流感病毒1型(Human parainfluenza virus 1,HPIV-1)、呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)通用型、人偏肺病毒(Human metapneumovirus,HMPV)、人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)通用型和腺病毒B型(Adenovirus type B,AdVB)6种呼吸道病毒重组酶聚合酶扩增(Recombinase polymerase amplification,RPA)检测体系新的技术方法。选择人β-actin基因外显子区域序列作为内标基因,根据6种病毒特异性基因的保守区设计引物探针,结合商业化的逆转录重组酶聚合酶扩增(Revers transcript recombinases polymerase amplification,RT-RPA)反应试剂,优化体系的引物及探针浓度、温度、反应时间,构建6种病毒的RT-RPA检测体系。优化后病毒和内标基因的RT-RPA检测引物和探针终浓度分别为400nmol/L和200nmol/L,最佳反应温度为39℃,最优反应时间为15min。敏感性实验结果表明,本研究建立的RT-RPA反应体系对6种病毒的敏感性为1.0×10~4拷贝/mL,其中,对AdV-B的敏感性高达1.0×10~3拷贝/mL;特异性试验结果表明,不同病毒间特异性好,无交叉反应;重复性试验结果表明,6种病毒对高浓度(1.0×10~7拷贝/mL)和低浓度(1.0×10~4拷贝/mL)标准品检测出峰时间T变异系数小于5%,重复性好;对100例临床标本进行回顾性实验测试,与市售实时荧光PCR检测试剂盒的阳性符合率、阴性符合率和总体符合率均为100%。本研究提示,建立的RT-RPA检测体系可用于国境口岸对上述6种呼吸道病毒的日常监测与快速检测。

    网络首发时间: 2022-12-12 16:37:30[查看摘要][在线阅读][下载 868K]
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  • 2010-2021年杭州市儿童埃可病毒感染及流行特征分析

    邱晓枫;李钧;张国忠;于新芬;潘劲草;赵刚

    研究杭州市儿童感染埃可病毒(Echovirus,E)状况和流行病学特征。收集2010-2021年杭州市发热患儿咽拭子、肛拭子等临床样本。首先通过实时荧光RT-PCR试剂盒进行肠道病毒(Enterovirus,EV)通用筛查。选取Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV阳性核酸样本,用普通PCR方法扩增EV VP1序列。获得VP1序列通过GenBank进行BLAST比对,确定埃可病毒血清型,并对埃可病毒优势血清型构建遗传进化树。通过回顾性调查埃可病毒阳性患儿的临床资料进行流行病学特征分析。采用卡方检验对埃可病毒阳性患儿的采样时间、年龄、性别等进行分组比较。本研究共收集临床样本7 835份,获得EV通用阳性样本数共计2 023份。选取827份Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV通用核酸阳性样本;共检出埃可病毒68份,8个血清型,阳性率为8.22%;分别为21份E30、12份E9、13份E6、7份E11、11份E18、2份E25、1份E7、1份E3。春、夏、秋、冬四季的埃可病毒阳性率分别为4.37%、21.03%、1.75%、1.22%。0-4岁、4-7岁、7-14岁患儿的埃可病毒阳性数分别为29、23、16,在EV阳性病例中的阳性率分别为5.24%、10.09%、34.78%。男、女童埃可病毒阳性率分别为9.48%、6.13%。埃可病毒阳性患儿临床诊断主要以急性上呼吸道感染为主,有29例占42.65%;其次是病毒性脑炎25例占36.76%;再是手足口病11例占16.18%。构建E30遗传进化树,发现杭州21株E30病毒株有多个不同进化分支,可能存在不同的流行传播链。E30杭州株之间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为88.0%~100.0%、97.3%~100.0%。2010-2021年期间,夏季是杭州市儿童埃可病毒感染的高发季;建议医疗机构在夏季加强埃可病毒监测,有效预防和控制夏季埃可病毒引起的疫情暴发流行。

    网络首发时间: 2022-11-16 09:38:41[查看摘要][在线阅读][下载 650K]
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  • 2016-2020年安徽省手足口病流行病学特征及CVA6基因进化分析

    傅荔艳;葛盈露;马婉婉;冯明子;王鹏;罗婉蓉;孙永;史永林

    为了解安徽省2016-2020年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行特征与病原谱构成,及分析CVA6(Coxsackievirus A6,CVA6)VP1区基因进化情况。本研究收集2016-2020年安徽省HFMD病例流行病学资料,描述性流行病学方法分析病例三间分布情况。随机选取480份HFMD其他肠道病毒阳性咽拭子样本,RT-PCR扩增肠道病毒VP1基因片段,测定基因序列并鉴定其他肠道病毒基因型别。生物软件分析部分代表性CVA6基因序列相似性并构建系统发育树。流行病学结果显示,2016-2020年安徽省HFMD发病率仍处于较高水平,但重症病例与死亡病例数有所减少,5个年度均以其他肠道病毒流行为主,五岁以下散居儿童为主要患病人群,男女性别比为1.50∶1。2016-2019年度发病均呈现为双峰流行模式。病原分型鉴定结果为CVA6 215例(215/245,87.76%),CVA10 16例(16/245,6.53%),CVA4 12例(12/245,4.90%),CVA5 1例(1/245,0.41%),CVA2 1例(1/245,0.41%)。选取的60株代表性CVA6 VP1区序列相似性分析表明,各序列间VP1核苷酸序列相似性为91.6%~100%,氨基酸序列相似性为97.4%~100%;与D3基因型代表株之间核苷酸序列相似性为90.7%~98.9%,氨基酸序列相似性为96.7%~100%;与CVA6原型株核苷酸序列相似性为82.3%~83.9%,氨基酸序列相似性为95.1%~96.7%。进化分析显示,CVA6划分为A-D四个基因型,60株CVA6毒株均属于D3基因亚型中的D3a分支,为中国大陆地区优势流行型别。应加强对安徽省CVA6及其他肠道病毒监测,这对制定减轻HFMD疾病负担以及防控HFMD策略具有重要意义。

    网络首发时间: 2022-11-14 11:35:28[查看摘要][在线阅读][下载 608K]
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  • 口服轮状病毒疫苗RotaTeq对不同人种轮状病毒胃肠炎免疫原性的meta分析

    魏宇航;彭蕊;王萌璇;范佳欣;吴铮;毛彤瑶;王明雯;孙晓曼;李丹地

    评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对全球儿童轮状病毒胃肠炎免疫原性,为疫苗的使用提供循证参考。检索2006-2021年公开发表的有关口服轮状病毒减毒活疫苗(Oral Live Attenuated Rotavirus Vaccine,ORV)RotaTeq(RV5)的文献,根据纳入排除标准筛选,共纳入了8 015名研究对象,其中疫苗组纳入研究对象4 062名,对照组纳入研究对象3 953名,使用RevMan5.3软件进行数据分析。共纳入6篇文献,对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了73%(95%CI:65%~81%)、35%(95%CI:19%~50%)、11%(95%CI:6%~16%)、12%(95%CI:5%~19%)、30%(95%CI:21%~38%)、23%(95%CI:8%~38%);与对照组相比,黄色人种疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了75%(95%CI:66%~85%)、41%(95%CI:19%~62%)、14%(95%CI:4%~24%)、19%(95%CI:7%~31%)、28%(95%CI:9%~47%)、34%(95%CI:11%~58%);白色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了82%(95%CI:77%~87%)、54%(95%CI:42%~66%)、15%(95%CI:5%~24%)、9%(95%CI:2%~16%)、38%(95%CI:26%~51%)、22%(95%CI:10%~33%);黑色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了59%(95%CI:52%~67%)、19%(95%CI:14%~24%)、6%(95%CI:2%~10%)、5%(95%CI:1%~9%)、27%(95%CI:19%~36%)、10%(95%CI:5%~16%)。口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq在不同的人种中免疫原性有一定的差异,且在黄色人种和白色人种中的免疫原性要比黑色人种的免疫原性更好。

    网络首发时间: 2022-10-08 15:32:58[查看摘要][在线阅读][下载 649K]
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  • 蛋白质组学在病毒学研究中的应用

    陈雅萍;孙欣;王盛羽;敖弟书;宋鸿

    病毒入侵宿主细胞后,导致宿主产生一系列复杂的变化。探索病毒-宿主的相互作用为预防和治疗病毒感染的研究提供重要线索。近年来,以质谱(Mass spectrometry,MS)为核心的蛋白质组学已经为病毒学的发展做出了巨大贡献。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、猴痘病毒(Monkeypox virus,MPXV)以及其它病毒的出现,使得对病毒蛋白质的分子功能及感染后宿主蛋白质组的深入探索更加迫切。本文综述了应用不同蛋白质组学方法来阐明病毒蛋白质的组成、病毒-宿主蛋白质相互作用、宿主蛋白质组的改变以及感染诱导的翻译后调控方面的现状。并讨论蛋白质组学与其他组学联用的策略,总结了蛋白质组学的限制和优势,为寻找病毒感染生物标志物、抗病毒药物靶点提供新的思路。

    网络首发时间: 2022-09-26 10:02:35[查看摘要][在线阅读][下载 573K]
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  • 新冠病毒变异株“奥密克戎”的研究进展

    孙泽宇;柴佳彤;许建成

    2021年11月在南非首次发现严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)Omicron变异株(B.1.1.529),随后世卫组织将该毒株定义为第五种关注变体(VOC)。与其他四种VOC(Alpha、Beta、Gamma和Delta)相比,Omicron是突变最多的毒株,更易传播和发生免疫逃逸。如今Omicron正发展成为全球许多国家的主要毒株,给预防和控制2019年冠状病毒病(COVID-19)带来新的挑战。本文章旨在对Omicron变异株的流行病学、突变及来源、传染性、核酸和抗原检测、临床致病性、疫苗反应性等信息作一简要综述,以期为监测、预防和疫苗研发策略提供科学参考。

    网络首发时间: 2022-08-05 16:43:48[查看摘要][在线阅读][下载 582K]
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  • 4例新型冠状病毒感染病例鼻拭子、咽拭子病毒核酸检测和血浆抗体检测结果分析

    陈荣华;李勤光;赵敏;陈惠聪;康惠玲;柳丽娟

    新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测和血浆抗体检测是目前确诊新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的重要依据。为比较分析SARS-CoV-2感染病例鼻拭子与咽拭子的病毒核酸检测及其血浆病毒抗体检测结果,本研究采用实时荧光定量PCR方法,分别检测4例COVID-19确诊病例鼻拭子与咽拭子标本的SARS-CoV-2 ORF 1ab基因和N基因,并采用胶体金法检测血浆标本中的SARS-CoV-2 IgM和IgG抗体。结果显示,在4例COVID-19确诊病例中,鼻拭子中病毒ORF 1ab基因及N基因的核酸扩增信号均强于咽拭子,Ct值均低于咽拭子;血浆病毒抗体检测仅发现1例标本SARS-CoV-2 IgG单阳性。本研究结果提示,鼻拭子标本的病毒含量明显高于咽拭子标本,血浆病毒IgM和IgG抗体检测是COVID-19辅助临床诊断的有效工具。

    网络首发时间: 2021-04-08 17:02:37[查看摘要][在线阅读][下载 1162K]
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