病毒学报

2022, v.38(01) 149-155

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2018-2019年云南省部分地区鼠类携带汉坦病毒基因型别分析
Genotyping of Hantaviruses from Rodents in Yunnan Province,China,2018-2019

尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东;

摘要(Abstract):

为了解云南省汉坦病毒的分子流行病学特征,本研究在云南省祥云县、泸西县、禄丰县和楚雄市4个地区布点,采集鼠类动物标本,运用实时荧光RT-PCR检测鼠肺标本中的汉坦病毒中的汉滩病毒和首尔病毒核酸,通过PCR扩增S节段的全基因序列,并进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析。结果共捕获鼠类动物70份,包含10个鼠种,其中褐家鼠30只,占42.9%,其次是鼩鼱12只,占17.1%;核酸检测阳性标本19份,均为首尔病毒,检出率为27.1%,源自祥云县的标本检出率在四个地区中最高(32.0%)。从鼠肺标本中扩增得到8条汉坦病毒S节段全基因序列,相似性为87.0%~99.7%,遗传进化分析显示基因序列聚集形成2个分支,一个分支属于S1亚型,另一个分支在遗传进化分析和blast比对分析中与其他亚型同源性均小于90%,属首尔病毒中独立的新的遗传进化分支,提示了云南省鼠类动物间多基因亚型首尔汉坦病毒流行,应进一步关注由宿主动物溢出感染人的潜力。

关键词(KeyWords): 汉坦病毒;首尔病毒;汉滩病毒;基因型

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 重大传染病防治专项(项目号:2016ZX10004222-002),题目:非洲病毒性出血热实验室检测及血清流行病学调查研究;重大传染病防治专项(项目号:2018ZX10711001),题目:病毒感染高通量快速检测与应急筛检技术研究;重大传染病防治专项(项目号:2017ZX10104001),题目:基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究~~

作者(Authors): 尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东;

DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004076

参考文献(References):

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