尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东;

• 1:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室
• 2:云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室
• 3:Centre for Human Virology and Genomics
• 4:Nigerian Institute of Medical Research

摘要(Abstract)：

为了解云南省汉坦病毒的分子流行病学特征,本研究在云南省祥云县、泸西县、禄丰县和楚雄市4个地区布点,采集鼠类动物标本,运用实时荧光RT-PCR检测鼠肺标本中的汉坦病毒中的汉滩病毒和首尔病毒核酸,通过PCR扩增S节段的全基因序列,并进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析。结果共捕获鼠类动物70份,包含10个鼠种,其中褐家鼠30只,占42.9%,其次是鼩鼱12只,占17.1%;核酸检测阳性标本19份,均为首尔病毒,检出率为27.1%,源自祥云县的标本检出率在四个地区中最高(32.0%)。从鼠肺标本中扩增得到8条汉坦病毒S节段全基因序列,相似性为87.0%～99.7%,遗传进化分析显示基因序列聚集形成2个分支,一个分支属于S1亚型,另一个分支在遗传进化分析和blast比对分析中与其他亚型同源性均小于90%,属首尔病毒中独立的新的遗传进化分支,提示了云南省鼠类动物间多基因亚型首尔汉坦病毒流行,应进一步关注由宿主动物溢出感染人的潜力。

关键词(KeyWords)： 汉坦病毒;首尔病毒;汉滩病毒;基因型

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 重大传染病防治专项（项目号：2016ZX10004222-002），题目：非洲病毒性出血热实验室检测及血清流行病学调查研究;重大传染病防治专项（项目号：2018ZX10711001），题目：病毒感染高通量快速检测与应急筛检技术研究;重大传染病防治专项（项目号：2017ZX10104001），题目：基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究~~

作者(Authors): 尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东;

DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004076

参考文献(References)：

• [1] Maes P,Calisher C H,Charbonnel N,Fulhorst C F,Klempa B, Klingstr?m J, Song J W, Zhang Y Z.2018.010M. N. v3. Hantaviridae_4subfam. Creation of 4subfamilies and 3 new genera in the family Hantaviridae(Bunyavirales). https：//talk. ictvonline. org/ictv/proposals/2018.010M.A.v3.Hantaviridae_4subfam.zip.
• [2] Elliott R M. Molecular biology of the Bunyaviridae[J]. J Gen Virol,1990,71(3):501-522.
• [3] Forbes K M,Sironen T,Plyusnin A,et al. Hantavirus maintenance and transmission in reservoir host populations[J]. Curr Opin Virol,2018:1-6.
• [4] Zhang Y Z,Zou Y,Fu Z F,Plyusnin A. Hantavirus infections in humans and animals, China[J]. Emerg Infect Dis,2010,16(8):1195-1203.
• [5] Zuo S Q,Zhang P H,Jiang J F,Zhan L,Wu X M,Zhao W J,Wang R M,Tang F,Dun Z,Cao W C.Seoul virus in patients and rodents from Beijing,China[J]. Am J Trop Med Hyg,2008,78(5):833-837.
• [6] Jiang H,Zheng X Y,Wang L M,Du H,Wang P Z,Bai X F. Hantavirus infection:a global zoonotic challenge.[J]. Virol Sin,2017,32(1):32-43.
• [7] Tian H Y,Yu P B,Luis A D,Bi P,Cazelles B,Laine M,Huang S Q,Ma C F,Zhou S,Wei J,Li S,Lu X L,Qu J H,Dong J H,Tong S L,Wang J J,Grenfell B,Xu B. Changes in rodent abundance and weather conditions potentially drive hemorrhagic fever with renal syndrome outbreaks in Xi’an,China,2005–2012[J].PLoS Neglect Trop D,2015,9(3):e0003530.
• [8] Wang H,Yoshimatsu K,Ebihara H,Ogino M,Araki K,Kariwa H,Wang Z X,Luo Z Z,Li D X,Hang C S,Arikawa J. Genetic diversity of hantaviruses isolated in china and characterization of novel hantaviruses isolated from niviventer confucianus and rattus rattus[J].Virology,2000,278(2):332-345.
• [9] Zhang Y Z,Dong X,Li X,Ma C,Xiong H P,Yan G J,Gao N,Jiang D M,Li M H,Li L P,Zou Y,Plyusnin A. Seoul virus and hantavirus disease,shenyang,people’s republic of China[J]. Emerg Infect Dis,2009,15(2):200-206.
• [10]Li Q,Cai Y N,Wei YM,Han X,Han Z Y,Zhang Y B,Qi S X,Xu Y G. Genovariation study of hantavirus in main endemic areas of hemorrhagic feverwith renal syndrome in hebei province, China.[J/OL]. PLoS One,2016,11(7):e0159731.
• [11]Pang Z,Li A Q,Li J D,Qu J,He C C,Zhang S,Li C,Zhang Q F,Liang M F,Li D X. Comprehensive multiplex one-step real-time taqman qrt-pcr assays for detection and quantification of hemorrhagic fever viruses[J/OL]. PLoS One,2014,9(4):e95635.
• [12]周济华，张海林，杨卫红，章域震.云南省2008年肾综合征出血热监测研究[J].医学动物防制，2009(10):18-21+24.
• [13]李金梅，张海林，杨卫红，周济华，王静林，章域震，邓淑珍. 2007年云南省汉坦病毒宿主动物及其基因分型研究[J].疾病预防控制通报，2009(6):1-7.
• [14]高丽芬，吴学林，胡海梅，罗琼梅，阎勇，钱发宝，胡秋凌，李蕊. 2005-2015年楚雄州肾综合征出血热流行特征分析[J].现代预防医学，2017(04):18-22.
• [15]邹洋，张海林，张云智，米竹青，杨卫红，袁庆虹，章域震，王静林，薛燕萍，陈化新，张永振.云南省褐家鼠与黄胸鼠中汉坦病毒的流行病学研究[J].中国媒介生物学及控制杂志，2006,17(5):399-403.
• [16]Zhang Y Z,Yuan J F,Yang X L,Zhou J H,Yang W H,Peng C,Zhang H L,Shi Z L. A novel hantavirus detected in Yunnan red-backed vole(Eothenomys miletus)in China[J]. J Gen Virol,2011,92(6):1454-1457.
• [17]Ge X Y,Yang W H,Pan H,Zhou J H,Han X,Zhu G J,Desmond J S,Daszak P,Shi Z L,Zhang Y Z.Fugong virus,a novel hantavirus harbored by the small oriental vole(Eothenomys eleusis)in China[J]. Virol J,2016,13(1):27-27.
• [18]王静林，张海林，周济华，杨卫红，章域震，米竹青，罗德荣，杨蛟，杨利圭，赵五生，张品元，李华昌，李卫，吕韬，张希良.首次从我国大绒鼠中检测到类似Tula样汉坦病毒[J].中国人兽共患病学报，2010(05):12-16.
• [19]邓洪岩，王静林，李利利，信云云，刘蒙蒙，王云，段招军.云南蝙蝠携带新型汉坦病毒及其基因组分析[J].中华实验和临床病毒学杂志，2018,32(2):140-144.