我国首次发现的HIV-1和HIV-2双重感染样品中病毒部分基因的序列特征分析Viral Sequence Analysis of HIV-1 and HIV-2 Dual Infection Firstly Found in China
邢辉,潘品良,冯毅,林旭东,于健石,龚新昌,戴玉琳,邵一鸣
摘要(Abstract)：
上海市卫生检疫局送检了一例HIV - 1和HIV - 2抗体检测均呈阳性的双重感染样品 ,对其感染的HIV前病毒的 gag和env基因区进行了序列分析 ,首次阐明我国发现的HIV双重感染样品的HIV部分基因特征。从HIV感染者淋巴细胞 (peripheralbloodmononuclearcells,PBMC)中提取前病毒DNA ,分别使用HIV 1和HIV 2特异性引物用套式PCR扩增HIV 1和HIV 2的部分基因区。PCR产物不经克隆直接测序 ,经GenBank检索并使用GCG软件包进行序列分析。结果表明 ,其中感染的HIV 2毒株中gag基因区与德国株HI2PEI2KR相似 ,基因离散率仅为8 1% ,env基因C2 -V3区与来自几内亚比绍的HIV 2U0 5 35 8株最近 ,离散率为 13 0 4% ,在其 gp36区发现与HIV 2U0 5 35 8基因离散率为 10 6 3% ,两个毒株均属HIV 2中的A亚型。而其HIV 1型毒株在 gag和env区都与从尼日利亚分离的H92NG0 83株相似 ,属HIV 1的G亚型。本文首次对我国发现的HIV 2型毒株进行了主要基因区的序列分析 ,表明在非洲较常见的HIV 2A亚型和HIV 1G亚型毒株 ,已随援外劳工传入我国。
关键词(KeyWords)： 人类免疫缺陷病毒1型、2型(HIV-1,HIV-2);双重感染;亚型;套式聚合酶链式反应(nested-PCR);序列分析;系统树分析
基金项目(Foundation):
作者(Author): 邢辉,潘品良,冯毅,林旭东,于健石,龚新昌,戴玉琳,邵一鸣
DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001220
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