病毒学报

2016, v.32(06) 683-688

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山东省柯萨奇病毒B1型VP1区全基因序列分析
Phylogenetic Analysis of Complete VP1 Sequence of Coxsackievirus B1 in Shandong Province,China

王海岩,陶泽新,李岩,张文强,刘晓林,徐爱强

摘要(Abstract):

为了解柯萨奇病毒B1型(Coxsackievirus B1,CV-B1)山东地方株的分子流行病学特征,本研究对1994年至2015年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统、环境污水监测和无菌性脑膜炎病例标本中分离到的CV-B1病毒进行了VP1序列测定、系统发生学分析和同源性分析。共分离到CV-B1病毒53株,其中AFP监测、污水和及脑炎标本各分离到41株、4株和8株。基于VP1完整编码区序列的系统发生学分析显示CVB1山东株与国内其他分离株属于一个大的分支,该分支内无国外分离株,国外分离株构成了其他两个分支。山东株之间的VP1核苷酸同源性为84.4%~100.0%,与其他国家分离株的同源性为77.9%~85.0%。研究结果表明,中国CV-B1分离株与国外株相比有较大的遗传差异,需要加强相关手足口病病毒学监测,关注不同传播链的新的基因亚型的肠道病毒的输入。

关键词(KeyWords): 手足口病;柯萨奇病毒B1型;系统发生;肠道病毒;同源性

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 泰山学者工程专项经费资助(项目号:ts.201511105);; 山东省自然科学基金项目(项目号:ZR2012HM007),题目:柯萨奇病毒B病毒体外重组感染性克隆的构建及生物学特性的鉴定;; 国家自然科学基金项目(项目号:81302481),题目:环境污水中人类肠胃炎病毒的型别多样性、遗传进化规律及其与人群疾病发生的关系

作者(Author): 王海岩,陶泽新,李岩,张文强,刘晓林,徐爱强

DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003062

参考文献(References):

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