人类病毒研究论著

  • 发热伴血小板减少综合征病毒在不同环境条件下的稳定性研究

    杨晓艺;杜珊珊;黄晓霞;李阿茜;李川;田婷婷;王芹;孙丽娜;芜为;刘铁柱;郑张琦;王世文;梁米芳;李德新;谢春;李建东;

    为评估发热伴血小板减少综合征病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)在环境中的稳定性,本研究比较分析了实验室制备的SFTSV在不同介质表面的稳定性以及温度、自然通风干燥和常用酒精消毒剂等因素对其生存能力的影响。不同时间点收获的病毒样本,通过接种于Vero细胞中传代培养、空斑试验和实时荧光定量RT-PCR等方法测定病毒的感染性、滴度和复制培养过程中的动态变化。结果显示,在室温(约25℃)自然通风干燥条件下,不同介质表面的SFTSV感染性快速下降,在硬币、塑料等介质表面的病毒感染性可维持24 h,但病毒感染性滴度24 h内显著下降分别约10~(4.46)倍和10~(4.6)倍,在无纺布和纸张表面的病毒感染性滴度在6 h内就下降分别约10~(3.82)倍和10~(4.12)倍。如果将SFTSV置于密闭湿润环境中,病毒感染性可维持长时间的稳定性,24 h病毒感染性滴度下降不明显,1周内下降约10~(1.49)倍,在3周时仍可通过细胞培养分离到感染性病毒颗粒,4周后失去了感染性;而SFTSV处于4℃时,感染性保持相对稳定性,在4周后,病毒感染性滴度下降仅约10~(2.09)倍,可通过细胞分离培养扩增病毒。使用酒精消毒剂对物体表面消毒时受SFTSV在物体表面的状态影响,当病毒处于干燥状态时,喷洒70%酒精可灭活病毒,如果处于湿润状态则不能有效灭活病毒。本研究比较研究了不同环境条件下SFTSV的稳定性,显示了环境材料性质、自然通风干燥程度、温度对SFTSV感染性的影响,有助于增进对SFTSV接触传播风险的理解,为完善SFTSV防控措施提供了参考依据。

    2023年06期 v.39 1521-1527页 [查看摘要][在线阅读][下载 1083K]
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  • 生物信息学分析人类病毒互作广谱蛋白的特征

    庹超皓;彭友松;孟祥贤;朱兆中;

    了解病毒与人类蛋白的相互作用对于理解病毒感染宿主机制非常重要,已有研究主要集中在病毒如何进入宿主细胞、复制、扩散和致病等方向上,对病毒与人类蛋白的相互作用模式缺乏系统研究。本研究中我们构建了迄今为止最全面的病毒与人类之间的蛋白相互作用网络,涵盖来自218种病毒的1 674种蛋白与来自人类的13 724种蛋白的108 832对蛋白相互作用;在此基础上鉴定出109个至少与12种病毒家族存在蛋白相互作用的人类蛋白,定义为人类的病毒互作广谱蛋白(简称广谱蛋白);从结构、功能、蛋白互作网络以及组织表达量等四个方面系统地分析了广谱蛋白的特征,发现广谱蛋白相较于非广谱蛋白以及其它人类蛋白具有更密集的转角结构、更多的结构域、更高的网络中心度和组织表达量,表明它们可能在病毒感染宿主过程中起着重要作用。本研究有助于加深我们对于病毒感染人类模式的理解,同时也对进一步探究病毒与疾病之间的关联有一定的帮助。

    2023年06期 v.39 1528-1540页 [查看摘要][在线阅读][下载 1740K]
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  • 褪黑素通过抑制NLRP3介导的炎症反应及细胞焦亡减轻甲型流感病毒诱导肺上皮细胞损伤

    吕圣杰;李春香;吕园;杨逢永;

    甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)感染引起肺上皮细胞损伤与Nod样受体蛋白3(Nod like receptor protein 3,NLRP3)炎症小体介导的炎症反应及细胞焦亡相关。褪黑素对NLRP3炎症小体的激活具有抑制作用,为研究褪黑素对AV诱导肺上皮细胞损伤的保护作用及机制,本研究通过细胞实验观察褪黑素通过抑制NLRP3介导的炎症反应及细胞焦亡减轻IAV诱导肺上皮细胞损伤。培养小鼠肺上皮细胞株MLE-12,按照MOI=0.2感染IAV,给予800μmol/L褪黑素或/和1.28μmol/L NLRP3激动剂BMS-986299干预,24h后检测细胞活力,细胞中细胞核增殖抗原(Proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、NLRP3、Caspase-1、GSDMD-N的mRNA表达和蛋白表达,培养基中白介素(Interleukin,IL)-1β、IL-18、肿瘤坏死因子-α(Tumor Necrosis Factor-α,TNF-α)的水平。结果显示,IAV组细胞活力、细胞中PCNA的mRNA表达和蛋白表达水平低于对照组,细胞中NLPR3、半胱氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)、GSDMD N端结构域(Gasdermin D-N,GSDMD-N)的mRNA表达和蛋白表达水平、培养基中乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)、IL-1β、IL-18、TNF-α的水平高于对照组(P<0.05);褪黑素组细胞活力、细胞中PCNA的mRNA表达和蛋白表达水平高于IAV组,细胞中NLPR3、Caspase-1、GSDMD-N的mRNA表达和蛋白表达水平、培养基中LDH、IL-1β、IL-18、TNF-α的水平低于IAV组(P<0.05);NLRP3激动剂组细胞活力、细胞中PCNA的mRNA表达和蛋白表达水平低于IAV组,细胞中Caspase-1、GSDMD-N的mRNA表达和蛋白表达水平、培养基中LDH、IL-1β、IL-18、TNF-α的水平高于IAV组(P<0.05),NLPR3的mRNA表达和蛋白表达水平与IAV组比较无显著性差异(P>0.05);褪黑素+NLRP3激动剂组细胞活力、细胞中PCNA的mRNA表达和蛋白表达水平低褪黑素组,细胞中Caspase-1、GSDMD-N的mRNA表达和蛋白表达水平、培养基中LDH、IL-1β、IL-18、TNF-α的水平高于褪黑素组(P<0.05),NLPR3的mRNA表达和蛋白表达水平与褪黑素组比较无显著性差异(P>0.05)。以上结果表明,褪黑素组减轻IAV诱导肺上皮细胞损伤,相关的分子机制是抑制NLRP3炎症小体介导的炎症反应和细胞焦亡。

    2023年06期 v.39 1541-1548页 [查看摘要][在线阅读][下载 1081K]
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  • CpG联合铝佐剂增强RBD-Fc重组蛋白诱导小鼠免疫反应效果的研究

    任虎;何远薇;张亚楠;李海;郭晋源;张燕;祝双利;冀天娇;曹蕾;许文波;

    由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的2019冠状病毒病(Coronavirus disease 2019,COVID-19)大流行对全球健康和经济构成了严重威胁,SARS-CoV-2关切变异株(Variants of concern,VOCs)的出现更增加了疫苗研发的难度,因此,优化设计对突变株具有广谱免疫反应的疫苗显得尤为重要。本研究选取具有大量显性中和表位的受体结合域(Receptor-binding domain,RBD)蛋白作为目标抗原,在SARS-CoV-2经典株RBD序列的基础上引入多个VOCs的关键突变位点,将其与人IgG1 Fc片段融合表达,并结合CpG单佐剂、氢氧化铝单佐剂或CpG与氢氧化铝复合佐剂两剂次免疫小鼠,比较CpG联合铝佐剂相比单独使用铝或CpG佐剂诱导细胞免疫和体液免疫反应的增强作用,同时观察小鼠产生抗不同VOCs活病毒的交叉中和抗体滴度。结果显示,与单佐剂相比,RBD-Fc蛋白结合CpG与氢氧化铝复合佐剂免疫小鼠可产生最高的IgG结合抗体及高水平Th1偏向的细胞免疫应答。同时,小鼠血清还可以有效地中和SARS-CoV-2贝塔株(GMT:11143)、德尔塔株(GMT:4850)、经典株(GMT:3675),甚至是奥密克戎BA.1株(GMT:1393)和BA.5株(GMT:459)的感染。这些结果表明含有突变位点的SARS-CoV-2 RBD-Fc重组蛋白具有良好的潜力,联合使用CpG和铝佐剂可明显提高和平衡小鼠的细胞免疫反应,产生对不同SARS-CoV-2高滴度的交叉中和抗体,可作为一种广谱疫苗进一步研究和开发。

    2023年06期 v.39 1549-1560页 [查看摘要][在线阅读][下载 1195K]
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  • 基于下一代测序技术分析临沂市污水中肠道病毒的遗传多样性

    韩咏霖;张晓;纪峰;林小娟;温红玲;陶泽新;

    本研究通过环境污水监测和下一代测序(Next generation sequencing, NGS)技术来了解临沂市肠道病毒(Enterovirus, EV)的型别分布和遗传特征,为肠道病毒病的防控提供科学依据。我们从2019年1月至2021年12月,在山东省临沂市兰山区污水处理厂按月采集污水标本,使用阴离子膜吸附洗脱法对标本进行浓缩,接种RD、HEp-2、L20B细胞进行EV分离和型别鉴定;同时,提取污水浓缩液核酸,进行VP1部分编码区的RT-PCR扩增和扩增产物的NGS,分析不同EV型别的读序构成,并使用Mega 11.0和BioEdit 7.0进行序列分析。3年中共采集污水样本34份,其中从23份中分离到EV 257株,鉴定为8个型别;28份污水浓缩液核酸的RT-PCR反应呈阳性,通过NGS共检出29个EV型别,分别属于EV-A(8)、EV-B(15)、EV-C(6)。其中柯萨奇病毒B3型(Coxsackievirus B3,CVB3)、埃可病毒11型、CVA16型为读序数最多的3种血清型,分别占总读序数的24.5%、23.1%和8.2%,同时还检出肠道病毒A76型、A89型、A90型等3种新型EV,以及EV-A71、CVA4、CVA6、CVA10、CVA24等传统病毒分离方法难以从污水中检测到的型别。系统发生学分析显示国内的新型病毒与国外分离株的亲缘关系较远。由此我们得出结论,基于NGS技术的环境污水监测是探索EV区域性流行的敏感且有效的手段。临沂环境污水中存在多种肠道病毒的共循环,具有高度的遗传多样性。

    2023年06期 v.39 1561-1569页 [查看摘要][在线阅读][下载 1182K]
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  • 2009-2019年中国大陆柯萨奇病毒A14型基因特征分析

    于力恒;郭琴;卫海燕;童文彬;刘莹莹;祝双利;王东艳;杨倩;冀天娇;肖金波;路环环;刘莹;李冀琛;王雯慧;张勇;许文波;严冬梅;

    柯萨奇病毒A14型属于肠道病毒A组,可引起手足口病和无菌性脑膜炎等疾病,但目前全球对CVA14的分子流行病学研究较少,尚无对CVA14基于全长VP1区进行明确分型的相关研究。因得到中国手足口病监测网络的技术支持,本研究获得2009-2019年在中国大陆分离到的15株CVA14,应用RT-PCR对其全长VP1区进行扩增、测序和分析,并与GenBank中下载的22条CVA14全长VP1序列共同构建系统发育树。结果显示,2009-2019年中国大陆分离的15株CVA14与原型株G-14的核苷酸与氨基酸相似性分别为81.8%~82.9%与95.6%~96.9%,15株CVA14之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~99.7%与98.3%~100%。中国大陆所有的22条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~100.0%与98.3%~100.0%。中国大陆所有的CVA14与国外8条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为80.7%~86.0%与94.9%~97.9%。基于全长VP1系统发育树,全球CVA14可划分为A-G七个基因型,目前全球范围内流行的CVA14的基因型主要为G基因型,中国大陆流行的基因型全部为G基因型。本研究建立了全球CVA14基于全长VP1的基因分型方法,揭示了CVA14在中国大陆及全球范围内的分子流行特征,为CVA14的致病机制研究提供了分子流行病学方面的基础。

    2023年06期 v.39 1570-1577页 [查看摘要][在线阅读][下载 1133K]
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  • 2022年深圳市5株肠道腺病毒41型(HAdV-41)的分子特征分析

    周莎;张海龙;陈龙;屈雅丽;黄小丽;刘婉秋;孟君;杨洪;朱贞;何雅青;

    人腺病毒41型(Human adenovirus, HAdV-F41)是儿童胃肠炎的常见病因,但目前HAdV-F41的分子特征尚未得到详细研究。本研究选取2022年2-5月的5个儿童急性腹泻患者的粪便样本,进行高通量测序得到全基因组序列。5个深圳株与参考株Tak(DQ315364)的核苷酸序列同一性为97.5%~98.6%,在四个重要结构基因中无核苷酸的插入和缺失,有2株在Hexon基因可见ε抗原表位发生突变,可能使毒株出现免疫逃逸,出现显著突变的基因区域还有E2A、L4、L5和E4。从NCBI上下载37个完整的HAdV-41全基因组序列建立系统发育树。系统发育树主要分为四个进化分支,其中分支1和分支2是主要的流行分支,5株深圳株处于这两个分支上。在5株深圳株中未发现有明显重组现象。

    2023年06期 v.39 1578-1585页 [查看摘要][在线阅读][下载 1473K]
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  • 2015年人腺病毒C亚属辽宁分离株的全基因组序列特征及其分子进化分析

    邵玉平;王作虪;任丽萍;陈涛;方兴;

    人腺病毒C亚属(Human mastadenovirus species C,HAdV-C)是呼吸系统疾病最常见的病原体。本文从辽宁省2015年急性弛缓性麻痹(AFP)监测病例的粪便标本中分离出一株HAdV-C的重组毒株LN2015,对其全基因组序列进行了测序和分析,并对HAdV-C的分子进化机制进行了研究。我们从GenBank数据库中选取了77条代表各个地区各个年份毒株的全(近)基因组序列,以猴腺病毒SAdV-40.1和SAdV-42.1为外类群,分别构建了基于邻接法和最大似然法的系统发育树,并用软件simplot3.5.1对基因组特征进行分析。结果表明,LN2015与北京株BJ09(MF315029)序列一致性最高,其Penton base、DBP、pV、pVI和HAdV-1相似,Hexon和Fiber为HAdV-2,3'端的E1B和5'的E4和HAdV-5相似,其基因型为P1H2F2。在两个系统发育树中,HAdV-2都聚为5个不同的谱系,每个谱系几乎都没有HAdV-6基因的参与,因此推测出HAdV-C的一条进化路线,即先由HAdV-5(或其共同祖先病毒)进化出HAdV-1,然后再进化出HAdV-2。HAdV-6和HAdV-2是HAdV-C两条独立的进化分支。未来有必要对HAdV-C的进化和变异进行更深入的研究。

    2023年06期 v.39 1586-1595页 [查看摘要][在线阅读][下载 1440K]
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  • 南通地区腺病毒41型遗传变异及进化特征分析

    季霄雷;郭陈;孙怡华;陈雨佳;陈璐;蔡秀丽;

    F亚属的人类腺病毒(Human adenovirus,HAdV)与急性胃肠炎相关,是儿童急性胃肠炎住院的常见病因。本研究收集了712份<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本,检出HAdV-F阳性52例,阳性检出率为7.30%。对Ct值<30的样本进行文库构建及测序,经Blast比对,得到的21条全基因组序列均为HAdV-41。与HAdV-41原型株相比较,Long fiber和Short fiber的核苷酸一致性低于全基因组核苷酸一致性。对HAdV-41全基因组的遗传进化分析显示,其分子进化速率为7.882×10~(-5)替换/位点/年(95%HPD,3.885×10~(-5)~1.234×10~(-4))。本课题研究对南通地区流行的HAdV-41进行了流行病学特征及基因进化特征分析,为南通地区HAdV-41所致疾病防控及病原溯源奠定了基础。

    2023年06期 v.39 1596-1606页 [查看摘要][在线阅读][下载 1603K]
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  • HBV cccDNA通过破坏宿主染色质三维结构抑制抗病毒基因MAU2的表达

    沈从乐;李韦杰;任博;王雅杰;

    HBV cccDNA的持续存在是慢乙肝难以治愈的重要原因。研究发现HBV cccDNA会在空间距离上靠近宿主染色体的转录活跃区域,提示HBV能够借助宿主基因组的转录开放环境促进自身复制。但具体作用方式尚未阐明。本研究将通过染色质构象捕获技术检测19p13.11增强子与潜在靶基因MAU2的染色质空间构象变化,探究HBV对宿主基因MAU2染色质空间构象的破坏作用,明确HBV对MAU2基因表达的抑制,并同时验证MAU2的抗病毒功能。结果显示,MAU2是19p13.11增强子的下游靶基因,HBV cccDNA能够通过影响MAU2基因与19p13.11增强子之间原有的染色质三维构象抑制MAU2的表达,而MAU2能够反向抑制HBV的复制转录。本研究将为了解HBV的转录调控机制以及寻找更多抗病毒因子提供新的思路。

    2023年06期 v.39 1607-1614页 [查看摘要][在线阅读][下载 1179K]
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  • 应用宏基因组纳米孔测序技术分析流行性腮腺炎样病例病原体

    韩桃利;焦洋;赵剑虹;张淑;顾琳;赵玉倩;李臻;曹阳;张建;高艳;孙灵利;

    为了解流行性腮腺炎样病例可能的病原体,本研究采用宏基因组纳米孔技术检测22例流行性腮腺炎样病例(病例组)和17例健康人群(对照组)的腮腺管口拭子中可能的病原。针对在病例组和对照组样本测序中发现的可疑病原体,应用实时荧光PCR进行检测确认。同时应用SPSS 23.0软件对两组的检测结果进行统计分析。宏基因组测序结果发现病例组和对照组未发现有统计学差异的致病细菌。人副流感病毒3型(Human parainfluenza virus3, HPIV-3)只在病例组5例病例中检出,而人疱疹病毒7型(Human herpesvirus 7, HHV-7)分别在病例组和对照组中的4例和6例病例中检出。实时荧光PCR验证结果与宏基因组测序结果一致。进一步分析发现,病例组和对照组的HPIV-3检出率的差异具有统计学意义(χ~2=9.186,P=0.011),而HHV-7检出率无统计学意义(χ~2=0.364,P=0.393)。本研究结果提示HPIV-3可能是调查地区导致流行性腮腺炎样病例的病原体,在今后对流行性腮腺炎诊断并报告时应注意鉴别,并加强病原学监测和检测。

    2023年06期 v.39 1615-1622页 [查看摘要][在线阅读][下载 1597K]
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  • 基于磁珠吸附的污水病毒高通量富集方法研究

    阳海怡;江慧敏;曾会玲;渠林;练惠敏;邱明;杨明达;谢春燕;陈泽玲;卢晓贤;刘璇;刘贺;梁均和;郑焕英;陈亮;杨颖;陆靖;

    基于环境污水的传染病病原监测是基于病例的传染病监测体系的重要补充。当前常规的污水病毒富集方法存在人力耗费大、周期长、精密度低等缺陷,导致污水病原监测难以大规模开展。本研究系统地探究了磁珠吸附法(磁珠法)对污水中的传染病相关病毒(包括新冠状病毒(SARS-CoV-2)、诺如病毒(Norovirus, NoV))富集的回收率和精密度,探讨了不同样本存储条件对磁珠法富集病毒效果的影响,采取磁珠法和现行标准的聚乙二醇(PEG)沉淀法富集含不同SARS-CoV-2拷贝数加标污水中的病毒,并检测SARS-CoV-2的核酸浓度,通过计算病毒载量来比较两种方法的检出限、病毒回收率和重复富集的精密度;利用2023年5月-6月广东省五个地市采集的28份污水样本,比较两种方法对新鲜水样本中SARS-CoV-2、NoV的富集效果,并探索了污水经冻融以及4度保存24 h后,磁珠法富集SARS-CoV-2和NoV效果的差异。结果表明在加标水重复试验中,磁珠法的检出限在100拷贝/mL,而经PEG沉淀法富集的100拷贝/mL加标水中仅有一份检出阳性,磁珠法病毒回收率在1000拷贝/mL加标水中的变异系数是0.14,低于PEG沉淀法的变异系数0.19。在12份新鲜水样的实验中,磁珠法富集SARS-CoV-2和NoV的效率(回收率)均高于PEG沉淀法。新鲜污水4℃放置24 h后,经过磁珠法富集,检测出病毒载量有所下降;与PEG沉淀法相比,冻融将显著影响磁珠法富集SARS-CoV-2的效果。在合适的样本保存条件下,通过磁珠法富集污水中SARS-CoV-2和NoV可以获得比当前PEG沉淀法更优的富集效果,且磁珠富集方法自动化程度高、实验周期短、大大节省人力成本,是未来开展高样本通量污水监测的重要方法之一。

    2023年06期 v.39 1623-1632页 [查看摘要][在线阅读][下载 1147K]
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短篇论著

  • 鸭冠状病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

    高月花;朱彤;刘丽萍;郭效珍;马芹;胡峰;汪建华;于可响;黄兵;宋敏训;李玉峰;

    为建立一种鸭冠状病毒(Duck coronaviruses,DuCoV)的临床快速诊断方法,根据鸭冠状病毒1b基因保守区域设计特异性引物,成功建立了用于检测鸭冠状病毒的特异性SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。该方法特异性强、敏感性高、重复性好,对鸭冠状病毒有特异性扩增,最低检测限为8.04×100拷贝/μL,比普通PCR方法敏感10倍,批内变异系数与批间变异系数分别为0.28%~0.34%、0.25%~0.36%,均小于1%。对临床可疑鸭泄殖腔拭子进行检测,本方法与常规PCR方法的检测结果阳性符合率为100%,阴性符合率为96.43%,样本总符合率为97.62%。本研究建立的鸭冠状病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,可用于鸭冠状病毒的临床快速诊断及流行病学监测。

    2023年06期 v.39 1633-1641页 [查看摘要][在线阅读][下载 1131K]
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  • 2022年海南省新型冠状病毒奥密克戎(BA.1.1)变异株基因特征分析

    孙初阳;邱丽;李丹丹;苏林梁;蔡英桂;邝仕壮;陈海云;吴庆梓;甘晓婷;王如敏;曾云婷;张亚淋;潘正帆;崔蕾;遇晓杰;马焱;

    为进一步积累和完善海南省新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株病原学特点的认识,本研究对2022年海南省14例感染奥密克戎(BA.1.1)变异株病例进行新冠病毒基因特征分析。应用Illumina公司MiSeqDX深度测序平台进行全基因组序列测定,Nextclade在线分析平台和DNASTAR 7.0.1生物信息学软件进行多序列比对和基因组特征分析,采用MEGA 10.1.8邻位归并法(Neighbour-joining)绘制系统进化树,结合流行病学调查进行回顾性溯源分析。海南省14例病例感染的奥密克戎(BA.1.1)变异株基因组高度相似,同武汉参考序列(GenBank No.NC_045512)相比,存在63或64个核苷酸突变位点,39个核苷酸位点缺失,22204位点有9个核苷酸插入,引起43个氨基酸突变和16个氨基酸位点缺失。刺突(Spike, S)蛋白存在32个氨基酸突变位点,S1蛋白RBD区R346K是VOC/Omicron(BA.1.1)变异株特征性突变位点。14例病例分布在三亚市及外溢到周边陵水、儋州等市县,均为外省来琼感染者引发后续本地传播。海南省因输入病例引起本土新冠疫情的风险较大,应继续加强新冠病毒重要流行变异株的研究,持续开展新冠病毒基因型变异监测。

    2023年06期 v.39 1642-1649页 [查看摘要][在线阅读][下载 1106K]
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  • 2021-2022年嘉兴市乙型流感病毒序列进化分析

    宋银;张雪;李丽娜;燕勇;朱国英;吉季梅;

    本研究分析了嘉兴市2021-2022年乙型流感病毒基因进化特征。首先采集2021-2022年嘉兴市流感样病例咽拭子标本进行流感病毒核酸检测、病毒分离。然后从嘉兴市2021-2022年流感分离株中共选取27株乙型流感病毒代表毒株进行全基因组高通量测序。最后利用生物信息学软件从核苷酸、氨基酸及分子层面对流感毒株进行分子特征分析。2021年嘉兴市共检测1362例流感样病例标本,阳性标本数98例,阳性率为7.20%,均为乙型流感病毒Victoria系(Influenza B virus Lineage Victoria, BV)。2022年嘉兴市共检测1318例流感样病例标本,阳性标本数335例,其中BV系89例,阳性率为6.75%,H3N2亚型246例,阳性率为18.66%。与疫苗株相比,2021年血凝素(haemagglutinin,HA)核苷酸与氨基酸序列相似性为98.92%±0.24%、98.55%±0.21%,神经氨酸酶(neuraminidase,NA)核苷酸与氨基酸序列相似性为99.25%±0.13%、99.37%±0.22%;2022年HA核苷酸与氨基酸序列相似性为99.12%±0.08%、99.64%±0.16%,NA核苷酸与氨基酸序列相似性为98.16±0.25%、98.1±0.19%。2021年嘉兴市分离的BV系流感病毒归属于V1A.3a.1和V1A.3a.2分支,2022年分离的BV系病毒归属于V1A.3a.2分支,V1A.3a.2为2021-2022年嘉兴市优势毒株。在2021年流感毒株中发现一株HA/NA系内重组株B/Zhejiang-Nanhu/1921/2021。与流感疫苗株相比,嘉兴市分离株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生H137N、H137Q、A137T、R148G、P159L、N165K、A172T、G196E、 R133K、H137K、R156G等多个氨基酸位点改变,而在NA蛋白上未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。2021-2022年嘉兴市分离的BV系流感毒株与疫苗株同源性较高,但HA蛋白关键抗原存在数个位点变异,可能导致流感病毒发生抗原漂移等改变,因此应加强对病毒变异的持续监测,为疫苗株更新、流感防控及临床诊疗措施的制定提供参考。

    2023年06期 v.39 1650-1659页 [查看摘要][在线阅读][下载 1635K]
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动物病毒研究论著

  • 干扰素刺激基因IFIT1抑制蓝舌病病毒的复制

    张国芮;康棣;王轩莹;田占成;高闪电;关贵全;常惠芸;薛慧文;殷宏;独军政;

    为了研究干扰素刺激基因1(Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1,IFIT1)在蓝舌病病毒1型(Bluetongue virus serotype 1,BTV1)感染复制过程中的作用,首先利用实时定量PCR检测到BTV1感染绵羊睾丸细胞后IFIT1基因的转录水平明显升高,利用RT-PCR方法扩增获得羊IFIT1基因,测序后进行生物信息学分析,将其克隆到质粒载体pcDNA3.1/(+)上,构建重组表达质粒pcDNA3.1-OV-IFIT1,将其转染BHK-21细胞,观察到IFIT1基因在细胞内的成功表达,然后利用BTV1感染质粒pcDNA3.1-OV-IFIT1转染的细胞,从病毒的mRNA转录、蛋白表达和病毒滴度的变化评价IFIT1对BTV1复制的影响。结果显示,IFIT1在细胞中的过表达可显著抑制BTV1复制,相反,敲低IFIT1的表达可促进BTV1的复制。本研究首次报道了干扰素刺激基因IFIT1在BTV1感染复制过程中的作用,这将有助于揭示BTV1和宿主细胞IFIT1的相互作用机制,同时也为抗病毒药物研发提供了理论指导。

    2023年06期 v.39 1660-1669页 [查看摘要][在线阅读][下载 1252K]
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  • 口蹄疫病毒热驯化及生物学特性分析

    刘仲元;张振兴;张韵;卢渊录;孙世琪;郭慧琛;董虎;宋建领;

    口蹄疫(Foot and mouth disease, FMD)是一种全球性的、感染偶蹄动物的传染病。病毒衣壳对温度,pH敏感,容易在疫苗生产及储存过程中裂解为免疫原性较低的五聚体,影响疫苗的质量。口蹄疫病毒(Foot and mouth disease virus, FMDV)对热敏感的机制研究对于疫苗抗原稳定性意义重大。本文通过循环热应激驯化方式诱导基因突变向耐热性发展,经噬斑纯化获得了驯化毒株M3,M9和M10。通过多序列比对分析发现驯化毒株P1区发生氨基酸突变,一步生长曲线表明驯化毒株氨基酸突变基本不影响病毒的复制,而驯化毒株相比野生型毒株衣壳耐热性有显著提高。驯化毒株M10单一位点突变(A1013T)增强衣壳稳定性,表明A1013T位点对于O型FMDV毒株衣壳耐热性的重要性,但机制仍待后期进一步阐明。该研究将为制备耐热性的FMD疫苗提供了理论依据。

    2023年06期 v.39 1670-1676页 [查看摘要][在线阅读][下载 1185K]
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  • 非洲猪瘟抗体胶体金免疫层析检测方法的建立及评价

    李鹏宇;张蕾;董春娜;李静;宋芳;肖进;

    为建立一种快速、高效、便捷的非洲猪瘟病毒抗体检测方法,本试验采用生物信息学方法筛选得到了性能优异的非洲猪瘟病毒抗原表位多肽P54t,利用P54t多肽作为检测抗体的特异性抗原,建立了一种特异性、敏感性好的胶体金免疫层析抗体检测方法,用于检测待测样品中是否含有非洲猪瘟病毒抗体。结果显示,该方法的敏感性为100%,特异性为100%,最低检测限度可达1:12800,与商品化试剂盒比较,符合率为94.3%。结果表明,该方法敏感性好、特异性强,检测结果准确,可用于非洲猪瘟病毒特异性抗体检测。

    2023年06期 v.39 1677-1681页 [查看摘要][在线阅读][下载 946K]
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植物病毒研究论著

  • 西番莲病毒可视化多重RT-LAMP检测技术的建立

    谢丽雪;陈细红;张小艳;陈江姗;张立杰;高芳銮;沈建国;李韬;

    东亚西番莲病毒(East Asian Passiflora virus, EAPV)、夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)和黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)是当前危害我国西番莲的主要病毒种类。为建立同时快速检测西番莲上EAPV、TeMV和CMV的可视化多重逆转录环介导等温核酸扩增(Multiplex reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, multiplex RT-LAMP)技术,本研究根据GenBank已报道的EAPV、TeMV和CMV外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列保守区域分别设计、筛选特异性引物,并通过反应体系和反应条件的优化,建立了可同时快速检测EAPV、TeMV和CMV的多重RT-LAMP技术,并进行了特异性、灵敏度测定及西番莲果园样品的检测。结果表明,建立的多重RT-LAMP方法特异性良好,可对EAPV、TeMV和CMV同时进行检测,而与西番莲上其他病毒及阴性对照无交叉反应;多重RT-LAMP的灵敏度最低可检测稀释至145×10-3 ng/μL总RNA,与一步法RT-PCR方法的灵敏度相当;西番莲果园样品3种病毒的多重RT-LAMP检测结果与一步法RT-PCR检测结果一致。本研究建立的多重RT-LAMP方法操作简便、特异性强、灵敏度高,适用于基层实验室和现场对西番莲上EAPV、TeMV和CMV的快速初筛。

    2023年06期 v.39 1682-1692页 [查看摘要][在线阅读][下载 1185K]
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人类病毒综述

  • CRISPR/Cas系统在病毒检测中的应用研究进展

    刁韵;柴春霞;王炜;

    CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)全称为成簇的、规律间隔的短回文重复序列,是细菌或古细菌在进化中产生的防御系统。CRISPR/Cas系统由于其高灵敏度、高特异性和操作简便等特点成为新一代的病毒检测工具。本文介绍了CRISPR/Cas系统的工作原理及分类,综述了CRISPR/Cas系统作为病毒检测技术的应用进展,并对未来CRISPR/Cas系统在病毒检测方面的发展方向进行了展望。

    2023年06期 v.39 1693-1702页 [查看摘要][在线阅读][下载 1103K]
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  • 抗猴痘病毒药物的研究进展

    公玥;彭宗根;

    猴痘是由痘病毒科正痘病毒属猴痘病毒(Monkeypox virus, MPXV)感染引起的一种人畜共患病,其患者症状与天花患者相似。尽管2023年5月世界卫生组织宣布猴痘不再构成“国际关注突发公共卫生事件”,但是仍建议猴痘预防和护理应纳入现有国家卫生规划。2022年JYNNEOS疫苗被FDA批准紧急使用用于治疗MPXV感染,但目前尚无抗猴痘病毒的药物批准用于临床。因此,抗MPXV的药物研发仍是一个迫在眉睫的挑战。本文综述了抗MPXV感染的潜在药物,以期为未来抗MPXV的药物研发提供参考。

    2023年06期 v.39 1703-1712页 [查看摘要][在线阅读][下载 1162K]
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  • 呼吸道合胞病毒感染与脂质代谢相关性研究进展

    赵天伦;秦露;刘亚丽;王晨曦;刘广绪;冯帅;李峰;

    呼吸道合胞病毒是所有2岁以下儿童感染的重要病原,近年来多项研究表明,呼吸道合胞病毒感染与脂质代谢关系密切,在肺炎的致病机制中发挥重要作用,该文综述脂质在呼吸道合胞病毒生命周期中的重要性及呼吸道合胞病毒感染与脂质代谢的相互作用。

    2023年06期 v.39 1713-1719页 [查看摘要][在线阅读][下载 1003K]
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  • 流感-新冠混合疫苗的研究进展及展望

    叶子晖;项露莹;叶柔含;陈跃文;陈书畅;姜世勃;韩海军;张娜茹;

    严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)和甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)均可引起严重的呼吸系统疾病,且二者存在共同感染从而导致病情加重的情况,疫苗接种是预防新冠肺炎和流感大流行的重要措施之一。基于两种疫苗的作用效果、生产成本以及就诊人群的依从性考虑,流感-新冠混合疫苗的研发具有重要意义。本文介绍了SARS-CoV-2与IAV的出现与发展以及流感-新冠混合疫苗的研究进展,包括疫苗的种类、免疫方法以及免疫效果,期望为流感-新冠混合疫苗的进一步研发提供具体思路。

    2023年06期 v.39 1720-1730页 [查看摘要][在线阅读][下载 1157K]
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  • 肠道病毒与细胞凋亡的关系

    张哲;王涛;王志云;

    肠道病毒可导致多种疾病,严重损害机体健康。为抵抗病毒侵染,宿主会利用细胞凋亡清除被感染的细胞和病毒。肠道病毒在与宿主细胞的斗争中,进化出了平衡细胞凋亡的策略以利于自身的复制和传播。本文讨论了几种肠道病毒调节细胞凋亡的途径,为进一步阐明肠道病毒急性感染相关机制和抗病毒药物的研发提供了理论基础。

    2023年06期 v.39 1731-1739页 [查看摘要][在线阅读][下载 1014K]
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  • 病毒相关环状DNA研究进展

    张可祥;赵林清;

    环状DNA作为生命遗传物质存在形式之一,在多种生命活动中发挥重要作用。部分病毒基因组DNA以环状形式存在,不仅可以作为承载遗传信息的病毒基因组通过滚环复制的方式进行复制,也可以作为附加体建立持久感染或者潜伏感染,还可以帮助逆转录病毒整合到染色体形成前病毒逃避细胞沉默机制。无论是人-病毒杂交形成的染色体外环状DNA,还是转座整合形成的转座子,都能通过特定癌基因产生高拷贝转录本,影响宿主的生物学功能。随着研究的不断深入,环状DNA更多的功能和生物学特性被挖掘,有助于乙肝病毒清除策略制定、逆转录病毒相关疫苗研制、或抑制肿瘤形成新靶点确定等多种医学问题的解决。

    2023年06期 v.39 1740-1746页 [查看摘要][在线阅读][下载 1039K]
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  • 重组水疱性口炎病毒的改造策略及在病毒学研究中的应用进展

    吴曦;王佑春;黄维金;

    水疱性口炎病毒(Vesicular stomatitis virus,VSV)是一种在家畜中流行,给畜牧业造成严重经济损失的病毒。然而,随着研究的深入,VSV不仅作为负链RNA病毒的代表种帮助阐明了负链RNA病毒的复制机制,并且随着通过cDNA克隆拯救VSV技术的建立,VSV成为了病毒学研究、疫苗研发及肿瘤治疗的有力工具。本文对VSV的基因组结构、增殖方式、重组VSV的构建技术以及重组VSV在基础研究和临床方面的应用进行了综述。

    2023年06期 v.39 1747-1756页 [查看摘要][在线阅读][下载 1009K]
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  • 巨噬细胞极化在单纯疱疹病毒1型感染中的作用研究进展

    张豪博;张莹;

    巨噬细胞具有功能可塑性,使其能够根据微环境线索不同极化为不同表型,主要分为两种类型,即促炎M1型巨噬细胞和抗炎M2型巨噬细胞,它们在单纯疱疹病毒1型(Herpes simplex virus-1, HSV-1)感染的疾病发展中行使不同的功能。当巨噬细胞出现极化失衡时,可以通过多种因素对其失衡状态进行调节,靶向调节巨噬细胞的极化状态对于治疗HSV-1感染具有重要意义。本文对巨噬细胞极化及其在HSV-1感染中的作用研究进展进行总结,以期为HSV-1感染的进一步研究及治疗提供参考依据。

    2023年06期 v.39 1757-1767页 [查看摘要][在线阅读][下载 1040K]
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  • 人巨细胞病毒编码的趋化因子及其受体同源物参与病毒免疫逃逸新进展

    李硕;何浩;鹿腾飞;张俊玲;陈敬贤;陆杨;王明丽;

    人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)在人群中的感染率高,在正常人体内该病毒IgG抗体呈现阳性者占60%~100%,但并不具有明显的保护作用。HCMV侵入人体后能感染体内多种组织细胞,如上皮细胞、内皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞等,并长期潜伏于体内,具有典型潜伏再激活的感染特征。研究发现,该病毒在感染机体过程中,病毒基因US27、US28、UL33、UL78、UL128、UL146和UL147等能够编码多种趋化因子同源物和趋化因子受体同源物等免疫活性分子进入免疫细胞,干扰机体的正常免疫功能,以达到免疫逃逸的目的。它们不仅是病毒潜伏感染和播散的物质基础,也在多种疾病的发生或发展中发挥了重要作用。本文综述了HCMV编码的趋化因子及其受体同源物的免疫调控及其机制研究进展,探讨该病毒与宿主免疫的相互作用过程及其结局,为更好地开发新的抗病毒疗法、设计更加高效安全的HCMV疫苗提供新思路。

    2023年06期 v.39 1768-1777页 [查看摘要][在线阅读][下载 1094K]
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  • 衣壳修饰对病毒样颗粒稳定性及其免疫原性的影响

    赵梓名;李响;高洁;

    全球现有疫苗种类中,病毒样颗粒(Virus-like particles, VLPs)疫苗以其安全性和高效性而被广泛关注。VLPs是一种不含核酸的病毒蛋白衣壳,目前可根据不同需求设计目标衣壳蛋白序列并在不同的表达系统中构建生产。在疫苗设计环节,对VLPs衣壳蛋白进行合理设计和修饰,可大大增强VLPs的稳定性,尤其是提高衣壳组装过程及组装体的稳定性,间接影响VLPs的免疫原性,对提升VLPs疫苗的有效性和安全性有重要作用。近年来国内外研究表明影响VLPs衣壳组装过程的稳定性的基本因素是组装环境中的离子强度和pH值,而影响VLPs组装体稳定性及其免疫原性的主要因素有疏水性质和静电相互作用及糖基化水平等。疏水性对VLPs蛋白质结构的动态平衡和生物功能的发挥起关键作用,静电相互作用通过改变VLPs分子表面或内部的静电势能,影响VLPs衣壳内分子共价键的形成及其与外界环境的相互作用,糖基化修饰则利用自身修饰基团的生物学结构或其他功能性质影响整体VLPs颗粒的结构稳定性和免疫学功能。本文根据现阶段对VLPs的生产应用和结构的研究,综述了影响VLPs衣壳组装过程和组装体稳定性的主要因素,以及VLPs如何通过衣壳修饰来调节这些影响因素的负面影响,提升VLPs疫苗的免疫原性和有效性,从而促进未来VLPs作为疫苗平台或其他生物平台,如药物递送、基因治疗等的创新和应用。

    2023年06期 v.39 1778-1793页 [查看摘要][在线阅读][下载 1210K]
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动物病毒综述

  • 鸭坦布苏病毒E蛋白结构与功能的研究进展

    陆泳锟;魏无缺;刘梦凡;李雨泽;尹政浩;徐杭;王俏容;朱秀同;黄淑坚;梅堃;

    鸭坦布苏病毒病是一种由鸭坦布苏病毒(Duck tembusu virus, DTMUV)引起雏鸭出现神经症状、种鸭生产性能降低、蛋鸭产蛋性能大幅下降的传染性疾病。DTMUV编码3种结构蛋白(C, E, prM),其中E蛋白作为DTMUV重要的免疫原性蛋白,其各结构域的氨基酸位点突变可对病毒粒子的致病性产生不同影响。本文总结了目前关于DTMUV E蛋白的研究进展,包括结构特点和关键毒力位点分析、其在病毒入侵细胞过程的功能与诱导细胞凋亡等的最新研究、以及蛋白抗原表位的最新发现。为进一步探究DTMUV E蛋白的致病机理奠定理论基础。

    2023年06期 v.39 1794-1803页 [查看摘要][在线阅读][下载 1396K]
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  • 鼠戊型肝炎病毒(Rocahepevirus ratti genotype C1)感染人类的研究进展

    吴焓;周璐;陆一涵;

    随着在中国香港、加拿大、西班牙和法国相继报道人感染鼠戊型肝炎病毒(Rocahepevirus ratti genotype C1;HEV-C1)病例,HEV-C1作为一种新发的人兽共患病毒,引起了全球的广泛关注。本研究对于HEV-C1感染人类相关的病原学特征、流行病学、基因组系统进化、动物和细胞模型以及病原学检测等进行系统综述,以期为HEV-C1的深入研究及疾病防控提供参考。

    2023年06期 v.39 1804-1813页 [查看摘要][在线阅读][下载 1127K]
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噬菌体研究综述

  • 热液、冷泉、深渊和极地海洋极端环境中噬菌体宏基因组研究进展

    刘港;梁彦韬;汪岷;

    海洋极端环境中存在着丰富的微生物类群,这些独特的生态系统为研究微生物群落的结构、功能和进化提供了良好的机会。噬菌体作为地球上最丰富的生物实体,在海洋微生物群落调控、基因转移、代谢重编程、物质循环和能量代谢中起着重要作用。本文综述了近年来在热液、冷泉、深渊和极地四种海洋极端环境中噬菌体宏基因组的研究进展,探究了噬菌体在四种不同生境中的群落组成、生活方式、与宿主的相互作用和功能基因等,发现在不同的海洋极端环境中噬菌体存在着区别和相似性,以期为未来海洋极端环境中噬菌体的研究提供新的思路。

    2023年06期 v.39 1814-1824页 [查看摘要][在线阅读][下载 3287K]
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信息

  • 《中文核心期刊要目总览》入编通知

    <正>《病毒学报》主编先生/女士:我们谨此郑重通知:依据文献计量学的原理和方法,经研究人员对相关文献的检索、统计和分析,以及学科专家评审,贵刊《病毒学报》入编《中文核心期刊要目总览》2020年版(即第9版)基础医学类的核心期刊。该书由北京大学出版社出版。书中按《中国图书馆分类法》的学科体系,列出了74个学科的核心期刊表,并逐一对核心期刊进行了著录。著录项目包括:刊名、并列刊名、主办单位、出版年、出版频率、中图分类号、ISSN号、CN号、邮发代号、编辑部地址、电话、网址、内容简介等。

    2023年06期 v.39 1825页 [查看摘要][在线阅读][下载 32K]
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  • 中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术·2022版)

    <正>~~

    2023年06期 v.39 1830页 [查看摘要][在线阅读][下载 641K]
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  • 中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术·2023版)

    <正>~~

    2023年06期 v.39 1831页 [查看摘要][在线阅读][下载 364K]
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  • 2023年中国微生物学会及各专业委员会学术活动计划表

    <正>~~

    2023年06期 v.39 1832-1833页 [查看摘要][在线阅读][下载 191K]
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  • 《病毒学报》征稿简则(2018年12月25日修订)

    <正>《病毒学报》是病毒学专业学术刊物,创刊于1985年,国际标准连续出版物号:ISSN 1000-8721,国内统一连续出版物号:CN 11-1865/R,国内邮发代号:82-227,国外发行代号:BM 6448。主管单位是中国科学技术协会,主办单位是中国微生物学会,承办单位是中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,出版单位是《病毒学报》编辑部。《病毒学报》是中国精品科技期刊、中国科技核心期刊、北京大学基础医学核心期刊《中文核心期刊要目总览》、武汉大学RCCSE(中国科学评价研究中心)中国核心学术期刊。刊载人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体、类病毒、朊病毒以及新病毒等的基础理论研究和应用研究的新成果与新进展。栏目有论著、研究快报(短篇论著)、评述、综述以及简讯等。

    2023年06期 v.39 1834页 [查看摘要][在线阅读][下载 810K]
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