述评

  • 慢性乙型肝炎功能性治愈生物标志物的过去、现状与未来

    朱丽芬;周佩;蔡海奕;关玉娟;王亚萍;李锋;

    我国乙肝病毒携带者人数约7500万,乙肝病毒感染是引起终末期肝病的主要原因,是我国卫生健康方面主要负担之一。实现慢乙肝功能性治愈可有效避免相关肝病发生,延长患者的生存期,目前已成为乙肝领域研究热点。相当比例慢乙肝优势人群经干扰素治疗后可实现安全停药,然而,停药判断缺少简便、可靠、易操作的生物标志物。随着乙肝新药或新药联合治疗方案不断出现,越来越多患者有望实现功能性治愈,迫切需要解决慢乙肝功能性治愈的可靠生物标志物的问题。本文综述了基于乙型肝炎病毒本身的病毒学标志物(如乙肝两对半、HBV DNA/RNA、HBcrAg、HBV cccDNA),以及宿主相关免疫学生物标志物(如乙肝病毒特异性抗体、免疫细胞等)的发展历程与各评价指标的特色,并针对目前存在的问题,提出我们的观点与展望。

    2025年02期 v.41 279-290页 [查看摘要][在线阅读][下载 1663K]
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手足口病相关肠道病毒研究专题_论著

  • 埃可病毒11型不同基因型间交叉中和效应及抗原性变异的初步研究

    刘莹;李冀琛;王蕊;李慧洁;梁钰材;段伟;肖金波;孙强;张勇;

    埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)是一种常被检出的肠道病毒,近年来在亚洲与欧洲地区多次报道由E11引发新生儿重症病例甚至导致死亡。自1994年E11在我国被首次检出后,其基因型历经多次更替。为探究基因型更替与型间交叉中和能力是否存在相关性,本研究选取了曾经在中国流行的A1、A2、C1、C3、D5以及E基因型的代表性毒株,依次进行噬斑试验、浓缩、纯化和灭活,随后与铝佐剂混合,于第0周、第2周、第4周,分三次对6周龄雌性BALB/c小鼠进行免疫。在末次免疫1周后,采集小鼠抗血清进行交叉中和效果评估。中和实验结果表明,不同基因型间的交叉中和能力存在显著差异。部分毒株能够突破前代毒株所形成的免疫保护屏障,这一现象与E11流行基因型转换的规律相契合。其中,D5基因型毒株展现出较高的免疫原性以及较为广谱的交叉保护特性,具备作为理想疫苗候选株的特征。同时,当前流行的D5基因型毒株抗血清对C1和C3基因型毒株提供的交叉保护作用有限,提示未来有可能出现新的基因型更替。此外,通过序列分析发现,VP1-BC loop和VP2-EF loop区域的差异可能对E11毒株的抗原性产生影响,进一步揭示了E11免疫逃逸的潜在机制。本研究系统地探讨了E11的交叉免疫效应及其对基因型更替的影响,为制订E11感染的防控策略和开展疫苗研发提供了重要的参考依据。

    2025年02期 v.41 291-300页 [查看摘要][在线阅读][下载 1782K]
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  • 2023年福建省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析

    周蕾;朱颖;冀天娇;杨倩;刘娜;祝双利;肖金波;于力恒;郭琴;刘莹;李冀琛;栗凡;肖梦怡;张勇;何文祥;严冬梅;

    本研究利用国家疾病监测信息管理系统,对2023年福建省急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)的暴发进行了描述性流行病学分析,并采集40份AHC患者眼结膜拭子进行病原学鉴定和基因进化分析。结果显示,福建省2023年AHC报告病例数6024例,发病率14.38/10万。5-14岁的发病儿童占发病总数的59.8%,学生、农民和幼托儿童为主要发病人群占比84.7%。40份拭子分离到26株柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CVA24v)。基于3C和VP1区域的基因进化树表明福建26株CVA24v属于GⅣ基因型。3株福建CVA24v的全基因组序列结果显示其在5’UTR区和3C区与EV-C96存在重组。

    2025年02期 v.41 301-309页 [查看摘要][在线阅读][下载 1925K]
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  • EV-A71疫苗上市前后河北地区EV-A71流行株VP1区基因特征分析

    王泽宇;刘莹莹;赵文娜;苏通;谢赟;于秋丽;付天宝;韩旭;李琦;

    了解河北地区EV-A71(Enterovirus A71)疫苗上市前后EV-A71遗传变异情况。在NCBI网站上获得疫苗株及EV-A71各亚型参考株序列。A亚型参考株为1969年加利福尼亚州分离株,NCBI编号为U22521。B1亚型参考株NCBI编号为AF135871;B2亚型参考株为AF009534;B3亚型参考株为AF376105;B4亚型参考株为AF376111;B5亚型参考株为AY258307;C1亚型参考株为AF376081;C2亚型参考株为AB213614;C3亚型参考株为AY125966;C4a亚型参考株为EU024958/AY905614;C4b亚型参考株为AY547499/AF302996;C5亚型参考株为EF063152;阜阳株为EU703813;疫苗株为HQ328793/EU812515/JX025561。对2011-2019年手足口病患者样本分离的EV-A71 VP1区核苷酸序列进行测定,对获得的序列进行遗传进化、相似性及位点变异等分析。测序成功的196条VP1区序列均属于EV-A71 C4a亚型,相同年份以及相近年份的分离株在进化树中存在聚集现象,各序列之间相似性较高。中和表位PEP27(site142-156)整体受到负向选择压力作用,其中VP1-145位点常出现VP1-145Q与VP1-145G突变;VP1区序列整体处于负向选择压力中。EV-A71疫苗上市前后河北地区EV-A71 VP1区遗传特征相对稳定,未出现较大的变异。

    2025年02期 v.41 310-316页 [查看摘要][在线阅读][下载 1523K]
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  • EV-A71或CV-A16灭活疫苗通过两种不同接种途径免疫小鼠诱导的BCR重链可变区基因特征比较

    陈可琪;廖芸;蒋国润;赵恒;于丽;孔美军;王晶晶;李丹丹;赵鑫;刘龙丁;郑惠文;

    本研究使用EV-A71灭活疫苗或CV-A16灭活疫苗免疫BALB/c小鼠,每种疫苗通过肌肉注射和皮内注射的方式分别两针免疫小鼠后14d,检测动物体内的中和抗体和细胞免疫应答水平。随后我们筛选CD19~+EV-A71~+B细胞或CD19~+CV-A16~+B细胞,对分选获得的特异性B细胞的BCR抗体重链基因进行巢式PCR扩增。随后对获取的抗体基因打靶,获得重链IGHV、IGHD、IGHJ基因的胚系来源,并对抗体IGH基因分类,对可变区CDR3区域氨基酸长度进行分析。结果表明,EV-A71实验性疫苗和CV-A16实验性疫苗两次免疫后,均能诱导较好的中和抗体水平,但是皮内免疫效果优于肌肉注射效果。EV-A71实验性疫苗或CV-A16实验性疫苗皮内注射小鼠与肌肉注射小鼠相比,IGHV基因谱系更加丰富。其中EV-A71疫苗通过两种接种方式产生的共有基因谱系为IGHV1-63*02,CV-A16疫苗通过两种接种方式产生的共有基因谱系为IGHV3-8*02。皮内注射比肌肉注射诱导的抗体重链可变区CDR3结构域的氨基酸长度变化更为明显,特别是CV-A16皮内注射小鼠重链可变区的CDR3区域长度主要集中在13个氨基酸,最长达到17个氨基酸。综上,皮内注射和肌肉注射诱导产生的特异性中和抗体滴度不同,CVA16通过皮内免疫诱导的中和抗体滴度高于肌肉注射诱导的抗体滴度,后续的BCR重链基因进化特征也存在明显的差异,这些发现为后续的联合疫苗设计提供参考。

    2025年02期 v.41 317-325页 [查看摘要][在线阅读][下载 1784K]
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手足口病相关肠道病毒研究专题_短篇论著

  • 2018-2022年南京市引起手足口病的柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

    梅唐林;董晓庆;乔梦凯;丁洁;

    为了解南京市2018-2022年引起手足口病的重要病原体柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)的基因特征及重组规律,为由CVA6引起的手足口病疫情防控提供一定的科学数据。收集2018-2022年南京市各区疾控中心上送的手足口病监测标本,用实时荧光定量PCR检测肠道病毒并分型,CVA6阳性标本通过一步法RTPCR对肠道病毒结构蛋白VP1区(915bp)和非结构蛋白3D区(812bp)进行扩增并测定序列,选取两个片段均测定成功的CVA6进行生物信息学分析。2018-2022年共收集疑似手足口标本2609份,肠道病毒阳性标本数1433份,阳性率54.93%(1433/2609)。肠道病毒阳性病例中,男女比例1.40∶1,0~3岁为高发年龄段,占肠道病毒总阳性数的61.34%(879/1433)。受新冠疫情影响,手足口病肠道病毒阳性病例的季节性在各个年份有较大差异。121株南京CVA6 VP1区核苷酸相似性为89.5%~100.0%,氨基酸相似性为97.0%~100.0%。基于VP1区序列系统发育分析表明,2018-2022年南京CVA6株均属于D3亚基因型,120株属于D3a分支,2019年仅有一株属于D3b分支。非结构蛋白3D区序列的分子系统发育分析显示,2018-2022年南京CVA6株3D型别以重组形式(Recombinant form,RF)A为主,2022年出现了与本研究的其他南京株及常见的各谱系代表株遗传距离较远的新谱系。2018-2022年南京市引起手足口病的CVA6以D3a基因亚型为主,3D型别以RF-A为主,2022年可能出现了新的重组型别。

    2025年02期 v.41 326-333页 [查看摘要][在线阅读][下载 1698K]
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人兽共患病毒病—痘病毒研究专题_论著

  • 缺失F1L对重组复制缺陷痘苗病毒天坛株在小鼠中免疫原性与免疫保护效果的影响

    刘士元;任皎;赵莉;吴依依;刘冠雅;韩一泽;黄保英;王文玲;田厚文;谭文杰;

    痘苗病毒(Vaccinia virus,VACV)广泛用于疫苗与重组病毒载体。国内拥有自主知识产权的复制缺陷型痘苗病毒天坛株(Non-replicating Tiantan strain Vaccinia virus,NTV)作为新型猴痘疫苗近期已获得临床试验批准。前期研究中,本课题组通过回插基因C7L获得了重组病毒NTV-C7L(J),然而该重组病毒的免疫原性未得到明显改善,迫切需要进一步改进。本研究利用同源重组技术对NTV-C7L(J)进行了二次基因改造,构建了缺失F1L基因的重组病毒NTV-ΔF1L-C7L(J)。BALB/c小鼠免疫结果表明,105 PFU免疫剂量二次肌肉注射,NTV-ΔF1L-C7L(J)可诱导出较强体液免疫反应和CD8+T细胞反应,其水平明显高于NTV与NTV-C7L(J)免疫组。与2×105 PFU剂量复制型痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)组尾部划痕单剂免疫组相比,NTV-ΔF1L-C7L(J)抗体应答低但细胞免疫反应强。初次免疫后第42d采用致死剂量(107 PFU)VACV WR株进行小鼠滴鼻攻毒,NTV-ΔF1L-C7L(J)加强免疫组与VTT单剂免疫组均可提供完全保护,且攻毒后前者小鼠体重保护明显优于后者;但NTV与NTV-C7L(J)免疫组仅呈现部分保护(分别为60%和90%)。研究结果表明∶F1L基因的缺失明显提高了NTV及NTV-C7L(J)的免疫原性与免疫保护效果,且安全性优于VTT。本研究为开发新型痘苗病毒载体及更加安全高效阻断猴痘的疫苗提供了新思路和实验依据。

    2025年02期 v.41 334-343页 [查看摘要][在线阅读][下载 1553K]
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  • C3L敲除改变痘苗病毒天坛株生物学特性并降低小鼠体内致病性

    韩一泽;翟玉倩;吴长城;刘士元;任皎;赵莉;陈思研;田厚文;王文玲;谭文杰;

    痘苗病毒C3L编码的补体控制蛋白(Vaccinia virus complement control protein,VCP)具有抑制补体系统激活等生物学功能,但其对病毒复制扩散及致病性的影响及具体机制尚不明确。本研究利用CRISPR/Cas9技术将痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)C3L缺失构建了重组病毒rVTT-mCherryΔC3L,并通过细胞和小鼠模型系统评估其生物学特性。结果显示:在HeLa、Vero和BHK-21细胞中,rVTT-mCherryΔC3L(MOI=0.01)的复制效率与VTT无显著差异,但感染48h后形成的免疫噬斑面积显著增大(分别为VTT的1.3倍、2.1倍和1.6倍,P <0.01);滴鼻感染BALB/c小鼠后,5×10~4 PFU rVTT-mCherryΔC3L感染的小鼠,体重下降幅度减轻且恢复时间提前,5×10~5 PFU感染时存活率显著高于VTT组(100%vs 16.7%)。研究结果表明,C3L缺失虽未显著影响病毒复制能力,但细胞间扩散能力增强,而小鼠体内毒力降低。该研究为痘苗病毒减毒疫苗设计及抗正痘病毒策略提供了重要理论依据。

    2025年02期 v.41 344-353页 [查看摘要][在线阅读][下载 1937K]
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人兽共患病毒病—痘病毒研究专题_短篇论著

  • 甘肃省前3例猴痘病例流行病学特点和基因组序列特征分析

    张慧;王彪;张晓曙;董茂星;梁舒;赵哲;陈建华;魏孔福;魏欢;王淼;

    了解甘肃省前3例猴痘病例流行病学特征和基因组特征及遗传变异情况,为甘肃省猴痘的防控提供科学依据。对甘肃省报告的前3例猴痘病例开展流行病学调查并采集相应样本,利用Illumina mini-seq二代测序仪完成猴痘病毒全基因组测序和数据处理,采用生物信息学软件对病毒全基因组序列进行遗传特征、谱系分型和进化树溯源分析。甘肃省报告的前3例猴痘病例均症状较轻,主要为疱疹伴瘙痒和神经疼痛,无发热等全身症状,主要传播途径为男男性行为密切接触,但使用安全套可能无法有效阻断传播;测序获得的全基因组序列全长分别为病例1(GanSu-JC)197 199bp;病例2(GanSu-LZ)197 200bp;病例3(GanSu-BY)197 199bp,基因组覆盖度分别为97.12%、99.37%、99.38%,与参考序列(NC_063383.1)相比3例病例猴痘病毒基因组序列分别存在78、88、87处核苷酸突变,分别有38、42、42个氨基酸发生突变,涉及宿主免疫调控、病毒致病性等生物特性发生改变;系统遗传进化分析显示,GanSu-JC序列与韩国提交的序列遗传进化亲缘关系较近;GanSu-LZ和GanSu-BY序列与中国深圳、云南提交的序列遗传进化亲缘关系较近,均属于Ⅱb C.1谱系。甘肃省报告的前3例猴痘病例均为西非亚型Ⅱb C.1谱系,兰州市2023年底之前很可能已存在猴痘病例,提示甘肃应加强猴痘防控宣教、鉴别诊断和防治工作。

    2025年02期 v.41 354-360页 [查看摘要][在线阅读][下载 1377K]
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人兽共患病毒病—痘病毒研究专题_综述

  • 猴痘病毒感染动物模型及传播途径研究综述

    陈召亮;张磊;李林芝;赵宗正;宋思慧;李秀博;刘聚祥;郭振东;

    猴痘是一种由猴痘病毒引起的人兽共患疾病,已在全球蔓延。加快猴痘病毒传播途径、传播效率等相关研究的速度,建立各种动物感染模型与传播模型十分必要。因此,本文旨在综述国内外已经建立的猴痘病毒动物感染模型以及已知的猴痘病毒传播途径。目前,许多易感动物的猴痘病毒感染模型已经建立,涵盖不同动物种类、不同感染途径以及不同毒株类型等,并已经成功应用于解析猴痘病毒生物学特点的相关研究中。猴痘病毒可通过多种途径传播,如通过接触患者或患病动物,接触污染物传播,还可以通过飞沫、气溶胶等呼吸道途径传播,也可以通过性行为、母婴途径传播。考虑到猴痘病毒传播方式的多样性,我们需要采取多种应对措施才能减少疾病的传播,同时,应进一步建立更多能够模拟各种自然感染途径的动物模型,为猴痘病毒疫苗、药物研发和防控措施的制定提供技术支撑。

    2025年02期 v.41 361-373页 [查看摘要][在线阅读][下载 1453K]
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呼吸道病毒研究专题论著

  • 海洋益生菌Paraliobacillus zengyii CGMCC1.16464抗流感病毒的研究

    范前进;李贝杰;卢思敏;岳坤;罗雪莲;徐建国;

    流感病毒是引起急性呼吸道传染病,导致严重公共卫生问题的主要病原体之一。益生菌可有效治疗或预防病毒性感染,尤其是呼吸道病毒感染。海洋益生菌可以提高水生动植物的存活率、免疫力和改善人类健康。本研究旨在评估海洋益生菌Paraliobacillus zengyii CGMCC1.16464(P. zengyii)对流感病毒抗感染的效果。通过乳酸脱氢酶(LDH)释放法检测了P. zengyii对A549细胞的毒性作用;采用ELISA方法测定了P. zengyii对poly(I:C)刺激产生IFN-β的影响;利用体外细胞模型和小鼠感染模型,通过RT-qPCR和TCID_(50)方法检测流感病毒的复制,评估P.zengyii的抗流感病毒作用。结果显示,P. zengyii在不影响A549细胞活力的情况下促进poly(I:C)诱导产生IFN-β,降低了流感病毒对A549细胞的感染。本研究在流感病毒感染小鼠的模型中也证实了P. zengyii抗感染作用,并且Hematoxylin and eosin(HE)染色表明P. zengyii改善了流感病毒引起肺脏组织的病理损伤。该研究首次报道了海洋益生菌P. zengyii抗流感病毒的活性,为防控流感病毒感染提供了新策略。

    2025年02期 v.41 374-382页 [查看摘要][在线阅读][下载 1637K]
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  • 人冠状病毒229E体外感染与复制特征研究

    刘冠雅;吴依依;刘士元;王梦微;张越;李兆卿;高尚卿;叶飞;陆柔剑;黄保英;谭文杰;

    本研究旨在明确HCoV-229E在多种细胞中的感染特征与复制动力学。首先比较了33℃和37℃下HCoV-229E在MRC-5中的致细胞病变效应、核酸增殖与感染活性等特征,确定病毒培养温度;通过RT-PCR(Real-time reverse transcription,rRT-PCR)比较了HCo -229E在不同种属与组织来源的13种细胞系(Huh7.5、He La、MRC-5、A549、RD、Hep-2、Calu3、Ha Cat-WT、Vero、LLC-MK2、MDCK、BHK-21、Mv1Lu)中的病毒RNA复制水平,评估了上述细胞对病毒的易感性;进一步探究其在易感细胞系中的致细胞病变效应(Cytopathic effect,CPE)、半数组织感染剂量(50%of tissue culture infectious dose,TCID_(50))复制动力学和噬斑形成特性。研究发现,HCoV-229E以同等MOI感染MRC-5后,病毒RNA与TCID_(50)的复制增殖均表现为33℃优于37℃。病毒RNA复制动力学结果显示,13种细胞中的6种人源细胞(Huh7.5、HeLa、MRC-5、RD、A549、Hep-2)对HCo V-229E易感,但在Hep-2中的复制较差。CPE结果表明,Huh7.5与He La均在感染后48h观察到CPE,并于72h出现细胞变圆脱落,与MRC-5趋势一致;而A549和RD分别于72h和96h观察到CPE,但细胞脱落死亡情况较轻。病毒活性复制动力学显示,0.01与0.001MOI感染剂量下,HCo V-229E在Huh7.5中分别于24h和48h达到复制高峰(10~(6.96) TCID_(50)/m L和10~(6.65) TCID_(50)/mL,P<0.05);在HeLa中分别于48h与72h达到复制高峰(10~(6.8) TCID_(50)/mL和10~(6.56) TCID_(50)/mL,P<0.05);在A549中均在96h到达复制高峰(约10~(6.3) TCID_(50)/mL,P>0.05);在RD细胞中均在72h到达复制高峰(10~(6.58) TCID_(50)/m L和10~(6.65) TCID_(50)/mL,P>0.05)。HCoV-229E可在Huh7.5、HeLa、A549、RD细胞中产生不同形态的空斑,其中He La细胞时间短(96h)、噬斑清晰易于计数,是HCoV-229E空斑实验的良好选择。本研究通过RT-PCR、CPE、病毒活性和噬斑特性系统展示了HCoV-229E在13种细胞中表现出不同感染特征与复制动力学,为深入研究HCoV-229E病原生物学和抗病毒药物筛选等提供了参考。

    2025年02期 v.41 383-394页 [查看摘要][在线阅读][下载 2287K]
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  • 生活污水中新冠病毒检测方法的研究及应用

    王国强;曹静;王维娜;张娟娟;张媛媛;张琦;从金龙;高景云;李翠;

    随着全球COVID-19疾病负担的降低和新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)检测频率的降低,生活污水中新冠病毒的监测已成为了解新冠病毒感染情况的关键工具。本研究通过对污水中新冠病毒富集浓缩方法的应用研究,筛选最佳检测方法,用于监测分析德州市2023年1月至2024年10月污水中新冠病毒阳性检出率、浓度、变异株变化趋势,同时对同期社会面人群中新冠病毒感染情况进行监测。结果显示铝盐混凝沉淀法为最优检测方法,污水中新冠病毒阳性检出率、病毒浓度和变异株的变化趋势同社会面人群监测情况相一致。通过建立预警模型,可为疫情研判和评估提供科学依据。

    2025年02期 v.41 395-406页 [查看摘要][在线阅读][下载 1613K]
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  • 云南地区28株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因的序列分析

    刘照生;周洁楠;伏晓庆;赵晓南;张美玲;孙艳红;韩晓宇;倪瑞泽;陈瑶瑶;

    为了解云南地区流行的H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传变异情况,并为进一步研究和防控提供依据,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术对2020-2023年云南省部分地区采集的环境标本进行H9N2亚型AIV核酸检测,对阳性标本进行鸡胚病毒分离实验,对分离获得的28株H9N2亚型阳性AIV的血凝素(HA)基因片段进行扩增和测序,利用生物信息软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析,受体结合位点、抗原位点、潜在糖基化等关键位点分析,并构建系统进化树。分析结果显示,28株分离株的HA基因属于欧亚分支Y280为代表的第Ⅰ群,与疫苗株A/chicken/Jiangsu/WJ57/2012在同一分支,核苷酸同源性为90.63%~100%,氨基酸同源性为92.45%~100%,与中国最早分离的疫苗株A/chicken/Beijing/1/1994(H9N2)核苷酸同源性整体较低,为84.18%~85.68%,氨基酸同源性为85.73%~88.72%;28株分离株HA蛋白裂解位点均为PSRSSR↓GLF,受体结合位点存在A198T/V、T163N、N232H、Q234L、Q235M突变,其中Q234L突变具有和人流感受体受体结合的特性;抗原位点仅在234、285、334位点存在变异,其他位点相对保守;分离株存在7~8潜在糖基化位点,主要变异表现在218、492位点的缺失和313、491位点的增加。28株H9N2亚型AIV分离株均为低致病性禽流感病毒,存在人易感位点,与参考株比较发生了一定程度的变异,应加强H9N2亚型AIV病毒的监测,密切关注其变异情况。

    2025年02期 v.41 407-416页 [查看摘要][在线阅读][下载 1418K]
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  • 北京市朝阳区2023-2024年SARS-CoV-2基因特征分析

    韩桃利;卢盼;赵嘉欣;刘宽宽;刘玉洁;樊茹;路冉;李欢欢;任兴梅;陈紫曼;徐则超;郑姗;孔怡铭;王梦楠;王海滨;赵剑虹;张士尧;田甜;焦洋;高艳;齐啸;许志远;郝瑞祺;孙灵利;

    为了解北京市朝阳区新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)本土变异株基因型构成及关键基因特征,本文通过纳米孔测序获取2023年6月至2024年3月期间北京市朝阳区新冠病毒感染病例的全基因组序列,采用Pangolin v4.3在线分型平台和Nextclade v3.3.1在线分析工具,获取基因分型、氨基酸变异等信息,并通过TBtools-II v2.070绘制氨基酸变异热图。同时,利用VarEPS在线系统(https://nmdc.cn/ncovn/lineage)评估氨基酸变异对本地区新冠病毒S蛋白编码基因的血管紧张素转化酶2(Angiotensin converting enzyme 2,ACE2)受体结合能力及稳定性、抗体亲和力和蛋白质功能的影响等进行分析。结果显示185例(质量评估≥mediocre)SARS-CoV-2序列均为奥密克戎变异株,按照Pangolin分型法可分为8个分支,JN.1(BA.2.86.1.1/B.1.1.529.2.86.1.1)及其亚分支占比最高(42.16%,78/185),与系统进化树显示结果一致。从2023年6月至8月以EG.5.1及其亚分支为主(40.00%~68.00%),再以HK.3及其亚分支为优势毒株(9月至11月,76.09%),继而转换为JN.1及其亚分支为绝对优势分支。EG.5.1和HK.3及其亚分支分别在20岁~39岁年龄组(52.94%)和20岁~49岁人群占比最高(62.50%),而JN.1及其亚分支在60岁~89岁年龄组占比较高(56.41%)。氨基酸变异分析显示,本研究SARS-CoV-2序列平均发生113个(95个~128个)核苷酸变异,其中由于非同义突变引起平均80个(65个~91个)氨基酸突变,其中S蛋白编码基因变异最为频繁(1.02%~1.36%)。进一步分析发现,相较EG.5.1和HK.3及其亚分支,JN.1及其亚分支在NTD等多个区域均发生氨基酸变异位点数量新增/减少。同时,JN.1及其分支增加的P1143L、L452R和N450D等氨基酸变异位点可能会降低S蛋白与中和抗体的结合稳定性和/或降低S蛋白与ACE2受体之间的结合稳定性。并且,本研究所有序列在NSP1、蛋白酶木瓜样蛋白酶(PLpro,NSP3)、3-胰凝乳蛋白酶样蛋白酶(3CLpro,NSP5)编码基因以及其他结构蛋白等关键编码基因亦发生突变。本研究结果提示JN.1及其亚分支关键位点氨基酸变异频繁,相较EG.5.1和HK.3及其亚分支可能具有更强的传播能力和免疫逃逸能力,应持续并继续加强新冠病毒病原学监测。

    2025年02期 v.41 417-427页 [查看摘要][在线阅读][下载 1518K]
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人类病毒研究论著

  • 基孔肯雅病毒感染性克隆的构建与鉴定

    林启晗;郑张琦;顾天梦;李川;杜珊珊;朱武洋;王世文;李建东;

    基孔肯雅病毒(Chikungunya virus, CHIKV)主要经伊蚊叮咬可在人间快速传播,引发大范围规模性疫情,此外,病毒适应性突变可对病毒传播特征造成显著影响。本研究通过分步克隆的方法,以我国本地传播病毒分离株(CHIKV-GD133)基因组为模板,以商业化质粒pSMART为载体骨架,分4步利用TOP10F、和EPI300两种感受态细胞构建了分别在T7和CMV启动子驱动下的CHIKV的全长感染性克隆,分别转染表达有T7聚合酶的BHK细胞系(BHK/T7-9)和Vero细胞后,通过显微镜观察、RT-PCR、IFA和噬斑滴定等方法,检测细胞病变效应、结构蛋白的表达、子代病毒粒子基因组序列、病毒基因组复制水平等,确认所构建2种感染性克隆在转染相应细胞系后,能够有效复制、装配形成有感染性的病毒颗粒,且该病毒颗粒可在Vero细胞内传代增殖,其感染复制特征与亲本野毒株无显著性差异。本研究为进一步探索影响CHIKV感染、复制、传播和致病等关键机制研究奠定了基础。

    2025年02期 v.41 428-436页 [查看摘要][在线阅读][下载 1527K]
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  • 经禽CELO病毒fiber替换构建靶向型第三代腺病毒载体

    李润茁;程莉;侯文哲;郭小娟;黄文荣;鲁茁壮;

    第三代腺病毒载体较第一、第二代具有优势,本研究拟建立一种第三代腺病毒载体靶向性改造的技术方案。扩增纯化辅助病毒H14,制备其基因组DNA;PCR扩增含有质粒骨架的DNA片段,二者通过Gibson组装得到含有H14基因组的质粒pKH14。再利用前期建立的限制性酶切-组装(Restriction-assembly)方法,将pKH14质粒中的人5型腺病毒(HAdV-5)fiber knob编码序列替换为禽1型腺病毒CELO的fiber1对应序列,得到腺病毒质粒pKH14-CF1K。Pac I酶切线性化pKH14-CF1K,转染293细胞,拯救、扩增并纯化新的辅助病毒H14-CF1K。Pac I酶切线性化第三代腺病毒载体质粒pK4HSU-GFP,转染293Cre4细胞,在转染后5 h,添加H14-CF1K辅助病毒,拯救获得第三代腺病毒载体CF1K-GFP。利用H14-CF1K辅助病毒和293Cre4包装细胞,传代扩增CF1K-GFP,采用氯化铯密度梯度离心法进行纯化。对纯化的CF1K-GFP进行了鉴定,并检测了其对禽LMH细胞和人293细胞的基因转导能力。本研究建立了第三代腺病毒载体靶向性改造的技术平台,并获得能够有效转导禽LMH细胞的第三代腺病毒载体。

    2025年02期 v.41 437-445页 [查看摘要][在线阅读][下载 1727K]
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  • 基于多种机器学习算法鉴定四个靶基因作为儿童急性轮状病毒感染的分子生物标志物的研究

    王雪琪;黄龙;张锦华;郑港;王怡鹏;何文俊;刁美;庞立丽;黄涛;

    轮状病毒引起的儿童腹泻通常表现为严重的腹泻、呕吐和脱水,尤其对免疫系统尚未完全成熟的儿童构成较大健康威胁。尽管现有的诊断方法如PCR和ELISA在临床实践中被广泛应用,但仍面临准确性、时效性和成本等方面的挑战。因此,本研究提出了一种结合生物信息学和机器学习技术的创新分析框架。通过整合来自多个队列的基因表达数据,识别出了与急性轮状病毒感染高度相关的分子生物标志物,并验证了其在不同临床组中的特异性。研究发现,四个基因(CD1C、IFI27、IFI44和IFI44L)的组合在急性轮状病毒感染组与健康组之间表现出显著的差异表达,与其他常见病原引起的腹泻相比,这一组合具有更高的特异性。这些发现为儿童轮状病毒腹泻的早期诊断提供了重要的见解,并为开发快速、灵敏且经济高效的临床诊断工具奠定了基础。此外,通过功能富集分析和免疫细胞浸润分析,揭示了这些基因在免疫反应中的潜在作用,特别是在免疫调节和细胞修复中的关键角色。本研究的结果为急性轮状病毒感染的早期诊断和个性化治疗提供了重要的依据和参考。

    2025年02期 v.41 446-461页 [查看摘要][在线阅读][下载 2228K]
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  • 中国两株罕见G9P[4]-N1基因型轮状病毒重配株全基因组序列分析

    唐晓苹;范佳欣;熊光萍;魏宇航;董梦洁;车如意;张无敌;李楚楚;沙比热木·托合塔木;王宏;章青;孔翔羽;庞立丽;李丹地;

    为研究中国两株罕见G9P[4]-N1型RVA重配株的全基因组特征,采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,对2022年收集的两份G9P[4]-N1型RVA标本进行全基因组扩增。应用MEGA11.0、Geneious Prime2023.2.1、Geneious9.0.2和DNASTAR等软件对RVA毒株进行全序列及遗传变异和进化分析,成功获取两株G9P[4]-N1型RVA的全基因组序列。结果显示两株RVA毒株的全基因组基因型均为G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2,两株RVA毒株所有节段核苷酸序列的相似性为:98.5%~99.5%。系统进化树显示VP7、VP4和NSP2基因分别为G9-Ⅲ、P[4]-Ⅴ、NSP2-N1。中国两株G9P[4]型RVA毒株为罕见的G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2型,VP7、VP4、NSP2等关键基因节段与美国、俄罗斯、捷克等国外G9P[4]型RVA相似度高,且与本国G9型流行株亲缘关系相对较远,推测该罕见G9P[4]-N1型RVA重配株可能由境外输入。中国两株G9P[4]基因型JS97、XJ1109毒株与疫苗株RotaTeq~(TM)(G1~G4、P[8])和疫苗株RotarixTM、疫苗Rotavac原始株116E及LLR原始毒株核苷酸相似性为81.2%~91.3%,在关键中和抗原表位存在较多氨基酸位点差异,该差异是否会影响疫苗针对中国G9P[4]-N1基因型的保护效果需要进一步研究。

    2025年02期 v.41 462-472页 [查看摘要][在线阅读][下载 1445K]
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  • 基于重组杆状病毒表达系统的诺如病毒衣壳蛋白VP1表达及组装分析

    霍玉奇;马杰;王超;刘金瑾;

    探讨基于重组杆状病毒表达系统的不同亚型诺如病毒衣壳蛋白VP1表达及组装情况。将来源于13个(GI.1、GI.2、GI.3、GI.4、GI.5、GI.6、GI.8、GII.1、GII.4、GII.6、GII.9、GII.12和GII.13)不同亚型的诺如病毒VP1蛋白序列根据Sf9昆虫细胞密码子使用频率进行优化,合成并连接到pFastBac-Dual载体的Pph启动子下游制备穿梭质粒,转化DH10Bac E.coli感受态细胞制备杆粒,最后转染Sf9细胞制备重组杆状病毒。利用制备的重组杆状病毒感染Sf9细胞后收获培养液,采用超高速离心和氯化铯密度梯度离心的方法对蛋白进行纯化,SDS-PAGE和Western blot方法对蛋白表达情况进行鉴定,透射电子显微镜分析蛋白组装情况。成功制备表达13个诺如病毒不同亚型VP1蛋白的重组杆状病毒,感染Sf9细胞后经SDS-PAGE和Western blot分析显示,GI.1、GI.2、GI.5、GI.6、GI.8、GII.1、GII.4、GII.6、GII.12和GII.13 VP1蛋白中高度水平表达,GI.3、GI.4、和GII.9 VP1蛋白低水平表达。氯化铯密度梯度离心后,GI.1、GI.5、GI.8、GII.4、GII.6、GII.12和GII.13 VP1蛋白可见明显蛋白富集条带,但GI.2、GI.6和GII.1 VP1蛋白未观察到蛋白富集条带。透射电子显微镜显示GI.1、GI.5、GI.8、GII.4、GII.6、GII.12和GII.13 VP1蛋白成功组装成病毒样颗粒(virus-like particles, VLPs)。透射电子显微镜(Transmission Electron Microscopy, TEM)下GI.2和GI.6沉淀复溶蛋白未观察到或者只观察到少量VLPs,而GII.1 VP1观察到大量VLPs。利用重组杆状病毒表达系统表达诺如病毒VP1蛋白,个别VP1蛋白高水平表达但不能有效组装成VLPs,表明VP1蛋白的有效组装可能有赖于其它因素或者因子的协同作用。

    2025年02期 v.41 473-478页 [查看摘要][在线阅读][下载 1460K]
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  • 重组腺相关病毒调控间充质干细胞成骨分化的作用机制

    蒋晓伟;王强;缪逸鸣;钱志渊;许岳;应璞;罗斌;

    间充质细胞又称为间充质干细胞(Mesenchymal stem cells,MSC)、间质干细胞、间叶干细胞,泛指一类具有一定分化潜能、可以分化成多种细胞类型、具有组织修复功能的多能基质细胞群。骨髓间充质细胞分化为成骨细胞是骨形成的关键步骤。然而成骨分化早期阶段所涉及的机制尚不清楚。前期研究发现FHL2是LIM蛋白超家族中LIM-only亚类的成员,在小鼠和人类MSCs中地塞米松诱导的早期成骨细胞分化过程中该亚类显著上调。此外,FHL2可促进成骨细胞转录因子Runx2、碱性磷酸酶(Alkaline phosphatase,ALP)、I型胶原蛋白A1 (Collagen type I alpha 1 chain,COL1A1)的表达以及间充质细胞的细胞外基质矿化(Extracellular matrix mineralization)。本研究使用sh-RNA敲除FHL2观察MSCs中重组腺相关病毒(Recombination adeno-associated virus, rAAV)诱导的成骨细胞标志基因表达情况。结果发现FHL2与β-catenin相互作用,后者是Wnt信号诱导的骨形成中的关键参与者。FHL2-β-catenin相互作用增强了β-catenin核转位和TCF/LEF转录,导致Runx2和ALP表达增加,而Wnt抑制剂DKK1可抑制这种表达。这些结果表明,FHL2是间充质细胞分化成成骨细胞的内源性激活剂,它通过激活Wnt/β-catenin信号依赖性Runx2的表达,介导重组腺相关病毒诱导的间充质干细胞成骨分化。

    2025年02期 v.41 479-487页 [查看摘要][在线阅读][下载 1529K]
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  • 人间传染的高致病性病毒感染动物模型在传染病防控中的应用研究探讨

    卢子薇;陈晚月;徐雪芳;鹿双双;卢选成;

    分析人间传染的高致病性病毒感染的动物模型应用情况,探讨人间传染的高致病性病毒在建立感染性动物模型中遇到的问题,为传染病防控科研和临床研究中动物模型选择和使用提供参考和依据。通过检索中国知网、万方数据库及PubMed数据库中人间传染的高致病性病毒感染动物模型的文献,对人间传染的高致病性病毒常用的感染性动物模型进行分析探讨。危害程度为第一类的高致病性病毒中,使用小鼠、猴及豚鼠为感染性动物模型的分别占95.83%、79.17%及62.50%;危害程度为第二类的高致病性病毒中,使用小鼠、猴及兔为感染性动物模型的分别占91.17%、55.88%及24.32%。使用实验小鼠作为感染性动物模型中,BALB/c小鼠和C57BL/6小鼠的比例分别占17.33%和13.33%。基因修饰小鼠归于其他小鼠类型,在其他类型占68.83%。使用实验猴作为感染性动物模型中,恒河猴和食蟹猴比例分别占37.18%和26.92%。相同科属的病毒使用的动物模型大致相同;其中还有16种高致病性病毒未检索到感染性动物模型的相关文章,包括类天花病毒、希普尔病毒、萨比亚病毒等。目前人间传染的高致病性病毒感染性动物模型使用最多的是小鼠,其次是猴;在使用的感染性小鼠动物模型中,BALB/c小鼠和C57BL/6小鼠的使用较多,基因修饰小鼠也被广泛使用;在使用的感染性猴动物模型中,食蟹猴及恒河猴使用最为广泛。对未检索到感染性动物模型的16种病毒,如类天花病毒、希普尔病毒、戈尔迪病毒等应提高关注,需探索建立以上病毒感染性动物模型的方法,为传染病的防控提前做好技术储备。

    2025年02期 v.41 488-499页 [查看摘要][在线阅读][下载 1521K]
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  • 非疫苗防控策略下山东麻疹防控实践与启示

    吴宗震;高婉莹;相强宇;张璐;刘欢;

    麻疹是一种由麻疹病毒引起的急性高传染性疾病,对儿童群体构成严重威胁。1949年至1967年,在疫苗及冷链技术尚未普及、医疗资源极度匮乏的背景下,山东省曾多次遭遇麻疹流行高峰,公共卫生体系面临严峻挑战。本文系统回顾了该时期山东地区在卫生宣传与社会动员、易感人群隔离与保护、成人血清注射与中西医结合治疗,以及基层卫生网络建设与资源分配等方面的防控实践。研究表明,这些措施在降低病死率、遏制疫情扩散以及完善疫情监测、优化社会动员机制和提升基层医疗资源调配能力等方面发挥了积极作用。本文总结了山东麻疹防控的历史经验,为现代公共卫生治理提供了宝贵借鉴,尤其在资源有限条件下的综合防控策略与社会动员模式方面具有重要启示。

    2025年02期 v.41 500-506页 [查看摘要][在线阅读][下载 1347K]
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短篇论著

  • 2023年宁夏回族自治区6种蚊媒病毒调查

    郁丽琴;韩坤;陈汉;王瑞晨;张术斌;马江涛;殷启凯;崔倩倩;聂凯;付士红;李樊;王环宇;许松涛;

    为了调查宁夏地区蚊虫携带主要蚊媒病毒的种类及其流行情况,本研究于2023年在宁夏采集蚊虫样本,采用实时荧光定量逆转录PCR(Reverse transcription-quantitative real-time PCR, RT-qPCR)筛查6种蚊媒病毒核酸,包括塔希纳病毒(Tahyna virus, TAHV)、乙脑病毒(Japanese encephalitis virus, JEV)、辛德毕斯病毒(Sindbis virus,SINV)、西尼罗病毒(West Nile virus, WNV)、库蚊黄病毒(Culex flavivirus, CxFV)和盖塔病毒(Getah virus,GETV)。对阳性样本进行病毒基因扩增、序列测定及系统进化分析。结果共采集5540只蚊虫标本,包含伊蚊、按蚊和库蚊,其中伊蚊数量最多为3350只(60.47%)。按采集时间、地点和蚊种共分装为185批标本。RT-qPCR检测结果显示,1批蚊虫JEV阳性,1批蚊虫TAHV阳性,55批蚊虫CxFv阳性。经Sanger测序获得1株TAHV的S、M和L段基因序列,长度分别为767 nt、3836 nt、6814 nt。1株JEV全基因组序列,长度为10967 nt。36株CxFv E基因序列,长度约为1450 nt。同源性及系统发育分析结果显示,新测序的TAHV S、M、L段基因序列分别与内蒙古分离株HQ541823.1、盘锦分离株OP727995.1和捷克斯洛伐克分离株KF361881.1亲缘关系最近,核苷酸(氨基酸)相似性分别为99.29%(100%)、94.76%(98.47%)、95.22%(99.25%);新测序的JEV全基因组序列与2020年四川毒株JEV-SC-2020-1亲缘关系较近,核苷酸(氨基酸)相似性为99.83%(99.97%),同属于GIb型;2批CxFv(NX23176、NX23182)属于GIB型,34批CxFv属于GIA型。本研究于2023年在宁夏采集的蚊虫中检测到3种蚊媒病毒,并首次在宁夏获得1株TAHV S、M、L段完整编码区基因组序列,为当地蚊媒病毒监测和防控提供了重要的基础数据。

    2025年02期 v.41 507-514页 [查看摘要][在线阅读][下载 1782K]
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  • 北京市丰台区3-9岁儿童札如病毒无症状感染特征分析

    尉秀霞;刘晓玲;杨霄星;秦萌;罗梦欣;武庆锐;严寒秋;

    对丰台区460名无急性胃肠炎症状的3~9岁儿童进行札如病毒的感染情况调查和基因特征分析,为控制无症状感染者可能作为急性胃肠炎传染源的防控提供支持。采集460名健康儿童的粪便样本,进行实时荧光定量RTPCR核酸检测,结果显示该人群的札如病毒无症状感染率为1.74%(8/460);不同性别、社区和机构之间的儿童无症状感染率差异无统计学意义;8份札如病毒核酸阳性样本病毒载量较高,平均Ct值为27.16。使用RT-PCR方法扩增札如病毒VP1区基因,共检出GI.2型(5株)和GII.3型(3株)2个基因型别。在3~9岁儿童中感染常见型别的札如病毒率较高,应关注其是否为传染源带来的公共卫生问题。

    2025年02期 v.41 515-520页 [查看摘要][在线阅读][下载 1360K]
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  • EBV感染类风湿关节炎患者激素治疗后临床转归分析

    王嘉豪;赵露;杨也;苗鑫;杨家福;

    为了分析类风湿关节炎人疱疹病毒(Epstein-Barr virus,EBV)4型病毒感染患者激素治疗后临床转归,本研究选取2019年2月至2024年3月医院收治的127例行激素治疗的类风湿关节炎EBV感染患者,根据临床转归将其分为未缓解组(35例)和缓解组(92例)。对比两组类风湿关节炎EBV感染患者血清免疫球蛋白A(IgA)、血小板压积(PCT)水平差异,采用皮尔森(Pearson)相关系数分析血清IgA、PCT与类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归的相关性,采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积评估血清IgA、PCT对类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归的诊断效能。结果发现,与缓解组比较,未缓解组血清IgA、PCT表达水平明显增加,差异有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析结果显示,血清IgA、PCT与类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归呈正相关(r=0.651、0.673,均P<0.05);ROC曲线分析结果显示,血清IgA、PCT各指标单独及联合检测类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归的AUC分别是0.887、0.906和0.959,与各指标单独检测相比,血清IgA、PCT联合检测的AUC最高(Z=2.373、2.683,均P<0.05)。IgA、PCT与类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归相关,且二者联合检测可提高对类风湿关节炎EBV感染患者激素治疗后临床转归的诊断效能。

    2025年02期 v.41 521-526页 [查看摘要][在线阅读][下载 1372K]
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  • 妊娠合并乙型肝炎病毒感染患者血清25-羟维生素D与病毒载量的关系

    杨婧淇;范徐妃;范俊霞;

    探讨妊娠合并乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)感染患者的血清25-羟维生素D[25-(OH)D]表达与乙型肝炎病毒-脱氧核糖核酸(HBV-DNA)载量和妊娠结局的关系,本研究选择2022年4月-2024年1月收治的141例妊娠合并HBV感染患者作为研究组,另同期选择100名健康体检孕妇为对照组。根据妊娠合并HBV感染患者的HBV-DNA病毒载量将141例患者分为阳性组(n=39)和阴性组(n=102);根据妊娠结局将其分为妊娠结局良好组和妊娠结局不良组。检测所有研究对象的血清25-(OH)D表达水平,并分析血清25-(OH)D表达水平与HBVDNA载量和妊娠结局的相关性,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清25-(OH)D表达水平对不良妊娠结局的诊断价值。结果发现,研究组患者血清25-(OH)D表达水平明显低于对照组(P<0.05);HBV-DNA病毒阳性组低于阴性组(P<0.05);不同妊娠结局患者HBV-DNA病毒载量、HBV感染孕周以及25-(OH)D水平存在显著差异(P<0.05);血清25-(OH)D表达水平降低与HBV-DNA病毒阳性和妊娠结局不良呈负相关(r=0.566、r=0.590,均P<0.001);当血清25-(OH)D水平≤20.31ng/ml时预测妊娠结局不良的AUC为0.862。妊娠合并HBV感染者血清25-(OH)D水平降低与HBV-DNA病毒阳性和妊娠结局不良密切相关。

    2025年02期 v.41 527-532页 [查看摘要][在线阅读][下载 1370K]
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动物病毒研究论著

  • 猪急性腹泻综合征冠状病毒链特异性SYBR Green实时荧光定量PCR方法的建立及应用

    黄拓欣;李程;李汶洁;吴珺;陈凝雪;孙媛;

    为对猪急性腹泻综合征冠状病毒(Swine acute diarrhea syndrome coronavirus,SADS-CoV)复制过程中基因组正负链RNA进行定量检测,以实现更好地了解SADS-CoV的复制和转录机制。本研究根据SADS-CoV N基因序列,通过生物学软件SnapGene和Primer Premier 6.0设计含有非病毒核苷酸标签序列的链特异性引物,建立了针对SADS-CoV N基因不同链RNA的链特异性实时荧光定量PCR(Strand-specific real-time fluorescence quantitative PCR,ssRT-qPCR)检测方法,并对其敏感性、重复性、特异性进行评估,同时对不同剂量SADS-CoV感染细胞后病毒复制过程中N基因的正负链RNA的拷贝数进行了定量检测。结果表明,以重组质粒标准品构建的标准曲线在10~2拷贝/μL~10~8拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,对正负链的检测下限为10拷贝/μL,能够特异性的区分病毒复制过程中产生的正负链,具有较高的特异性、灵敏性和重复性。SADS-CoV感染IPI-2I细胞后,其病毒正负链含量水平呈现持续增加。以MOI=1感染细胞48h后,其病毒正负链拷贝数可分别达到1.8×10~8拷贝/μL和5.6×10~4拷贝/μL。本研究成功建立了SADS-CoV N基因链特异性SYBR Green实时荧光定量检测法,可区分和定量SADS-CoV在复制过程中产生的不同链RNA,为后续病毒的复制转录调控机理和相关抗病毒机制的研究提供了有效检测手段。

    2025年02期 v.41 533-540页 [查看摘要][在线阅读][下载 1738K]
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  • 猫泛白细胞减少症病毒单克隆抗体的制备及双抗体夹心酶联检测方法的建立

    杨贝妮;张漫;董春娜;肖进;张蕾;王自力;

    为了建立一种能够检测猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus, FPV)的双抗体夹心酶联检测(ELISA)方法,本研究首先构建了FPV VP2蛋白的原核表达载体并进行了VP2蛋白的原核表达。经SDS-PAGE实验验证及反应原性检测后,以VP2重组蛋白作为免疫原,通过间接ELISA方法筛选出2株能特异性识别VP2蛋白的高亲和力单克隆抗体,分别命名为2F10和3D2。通过对捕获抗体包被浓度、酶标检测抗体使用浓度等最适反应条件进行摸索,建立了FPV的双抗体夹心ELISA检测方法,并对方法的敏感性、特异性及与PCR方法的符合率进行验证。结果显示该方法的最低检测限为10~(3.2) TCID_50/mL,高于市售商品化试纸条,且与猫杯状病毒(Feline calici virus,FCV)和猫疱疹病毒1型(Feline herpesvirus type 1, FHV-Ι)均无交叉反应,特异性较好,与FPV标准检测方法 PCR的符合率为98.9%,且操作简便、检测快速,为FPV的检测提供了一种有效的工具,为进一步开发FPV检测试剂盒奠定了基础。

    2025年02期 v.41 541-549页 [查看摘要][在线阅读][下载 1432K]
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  • NZ7型羊口疮病毒与细菌混合感染的病理学特征

    艾书晴;张帆;何鑫;杨超群;黄欣;宋佰芬;于永忠;

    羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)具有高度的上皮嗜性,通常导致动物皮肤或黏膜上皮增生性、炎性损伤,并易诱发致病微生物的继发性感染。近年来,国内外对羊口疮继发细菌感染问题给予了广泛关注。经调查,NZ7型ORFV流行株引起的羊口疮在我国北方较为普遍。而ORFV与细菌协同致病,对患羊造成的病理损伤的一般性病理学特征,至今尚不清楚,给疾病诊断、临床防制的建立和病原净化工作带来了一定困难。本研究通过两个混合感染的病例S-6、S-7和两个单纯感染的病例S-8、S-9,采用一整套实验室的鉴定方案,包括血清学、免疫组化、基因组学、分子病原学和分子病理学等方法技术,针对黑龙江省区流行株NZ7型ORFV与金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)混合感染致病的病理特征,进行了综合分析、研判。依据病灶大小(lz)、炎症表现(im)、溃疡程度(um)、化脓程度(ps)、结痂情况(ss)、恢复期限(rt)、全身状况(cc)和生产性能(pp)等8项指标,确立了羊口疮继发性细菌感染的局部病理特征,不仅有利于此类疾病的早期排查和预警,还有利于深入研究NZ7型ORFV与细菌协同致病的分子机制。

    2025年02期 v.41 550-560页 [查看摘要][在线阅读][下载 2042K]
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  • 米尔贝肟抑制非洲猪瘟病毒体外复制作用的研究

    齐传翔;张永强;王振忠;郑龙三;李金明;王志亮;吴晓东;钱莺娟;

    非洲猪瘟(African swine fever, ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)引起的一种急性、烈性猪传染病,感染猪死亡率可达100%,目前尚无有效的商品化疫苗或治疗药物。本研究发现,米尔贝肟(Milbemycin Oxime,MO)可在体外抑制ASFV复制,进一步通过CCK-8、细胞ELISA、Western blot和时间-添加(Time-of-addition)实验,探究了MO对ASFV的抑制作用。结果表明,MO在猪肺泡巨噬细胞(PAMs)中的半数细胞毒性浓度(CC50)为9.356μM,半数病毒抑制浓度(IC50)为1.935μM;Western blot及RT-qPCR实验结果表明,MO能够显著抑制PAMs内ASFV-p72蛋白和mRNA表达;转录组测序分析发现,ASFV感染显著激活PAMs中IFIT2等免疫反应相关基因表达;MO单独处理则可显著下调PAMs内IL-1β、IL-1α等NOD样受体信号通路基因;而MO与ASFV共同处理后,PAMs内IFIT2、IFIT3等免疫反应相关基因被显著上调,而IL-1β、IL-18等NOD样受体信号通路中部分基因表达均被显著下调。进一步使用RT-qPCR实验验证发现,MO可显著下调ASFV感染PAMs中的IL-1β、Caspase-1等基因的mRNA表达水平,提示MO可能通过促进细胞免疫反应应答启动,延缓ASFV诱导炎症导致的细胞死亡,最终发挥抑制ASFV复制效果。本研究为ASF疫情防控药物提供了候选靶标和理论研究基础。

    2025年02期 v.41 561-570页 [查看摘要][在线阅读][下载 1960K]
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  • 大黄鱼虹彩病毒的流行情况初步调查及组织分布研究

    王巧煌;林楠;张杰;张杰鑫;陈小强;谢友佺;黄光亮;

    为初步了解近年来大黄鱼虹彩病毒(Large yellow croaker iridovirus,LYCIV)的流行现状和流行特点及其组织分布情况,于2022年3月至2023年2月,随机监测了宁德地区45家大黄鱼养殖场及重点监测了15家正发生“大黄鱼虹彩病毒病(Large yellow croaker iridovirus disease,LYCIVD)”的养殖场,并对患病大黄鱼组织进行透射电镜观察;同时,采用实时荧光定量PCR(Quantitative real time PCR,qPCR)法对上述重点监测养殖场的15份经检测为肿大细胞病毒阳性的自然发病大黄鱼样品不同组织中的病毒含量进行了测定,并克隆病毒主要衣壳蛋白基因(Major capsid protein,MCP),测序后与GenBank中的虹彩病毒进行比对分析。结果显示,随机调查的45家养殖场中有10家为LYCIV阳性,阳性率为22.2%;15家重点调查的养殖场均为LYCIV阳性;感染LYCIV的大黄鱼临床症状普遍表现为肝脏出血、脾脏和肾脏肿大等病症;检出LYCIV阳性的样品,采样水温为25℃~30℃、鱼规格为10 cm~32 cm;透射电镜下可见脾脏和肾脏等组织细胞内存在病毒包涵体结构以及病毒粒子,直径约为130 nm~150nm;MCP序列分析发现,15株大黄鱼虹彩病毒MCP序列均与肿大细胞病毒属的真鲷虹彩病毒聚类。此外,采用qPCR法测定患病大黄鱼不同组织中的LYCIV含量发现,鳃、脾脏和眼的病毒含量相对较高,肝脏中的病毒含量相对较低,故鳃、脾脏和眼可作为该病诊断、监测及研究的“优先”采样组织。

    2025年02期 v.41 571-579页 [查看摘要][在线阅读][下载 1741K]
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人类病毒综述

  • 登革热疫苗研究进展

    刘铁柱;李建东;王世文;

    登革热是全球流行范围最广、经济负担最重的虫媒传染病,2024年至今全球登革热报告病例数已经超过1200万,达历史最高纪录2倍多。目前,登革热治疗主要对症治疗,尚无特效药物,最好的防制手段为预防感染。尽管存在多种限制性技术瓶颈,登革热疫苗研发近年来取得了明显进展,本文对登革热疫苗的种类、效果评估、接种人群和接种策略等方面的进展进行了归纳总结。

    2025年02期 v.41 580-586页 [查看摘要][在线阅读][下载 1374K]
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  • 戊型肝炎疫苗上市后研究及真实世界应用

    卢姣汐;黄兴成;蓝林晨;徐唯卓;廖梦俊;庄春兰;吴婷;

    戊型肝炎(简称“戊肝”)是一种由戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,简称“HEV”)引起的病毒性肝脏炎症,在孕妇、患有基础性肝病、免疫缺陷等人群中可导致严重疾病,卫生资源欠佳的地区常发生暴发流行。目前尚缺乏针对戊肝的特效治疗方法,因此,接种戊肝疫苗成为戊肝防控的关键措施。全球唯一的戊肝疫苗HEV 239安全性良好,且具有可持续至少十年的高效保护性。2022年,HEV 239疫苗被无国界医生组织成功用于南苏丹的戊肝疫情控制,2024年该疫苗被纳入全球疫苗免疫联盟的战略储备,这均为戊肝疫苗未来更加广泛的真实世界应用奠定了基础。本文对HEV 239疫苗上市后的临床研究进展及真实世界应用情况进行综述。

    2025年02期 v.41 587-593页 [查看摘要][在线阅读][下载 1359K]
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  • 细胞自噬与柯萨奇病毒相互作用的研究进展

    郭丽芳;冉茂华;谢丹;

    自噬是细胞的保守降解机制,通过自噬可实现受损细胞器、聚集蛋白质的降解,清除不利细胞质,获取机体运行能量,并维持稳态。自噬为细胞保护机制,对病原体产生抵御、免疫作用。但有研究认为肠道病毒可借助细胞自噬强化自我复制。柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)归类于肠道病毒,可引起心肌炎手足口病(Hand foot and mouth disease,HFMD)及神经发育相关疾病。本文总结了近期对细胞自噬与CV病毒相互作用的研究,概述了不同类型的CV病毒与自噬的相互作用,有助于进一步探讨CV病毒引起疾病的治疗新思路。

    2025年02期 v.41 594-599页 [查看摘要][在线阅读][下载 1346K]
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  • 大别班达病毒的传播途径研究进展

    牛文静;吴泓晓;陈志海;

    大别班达病毒(Bandavirus dabieense,DBV)是一种人畜共感染的蜱媒病毒,可引起以发热、血小板减少和多器官功能障碍为主要临床表现的发热伴血小板减少综合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)。近十余年来,我国累计报告SFTS病例的省、市、自治区从5个增加到25个,病死率在5.2%~30%。此外,其他国家如泰国、日本、韩国、越南等也陆续报道了DBV感染。由于DBV的高病死率和传播途径多样性,SFTS对人类和动物的健康构成了严重威胁,增加了防控的复杂性。本文对DBV传播途径进行总结,以期为DBV的预防和控制提供新的方法和思路。

    2025年02期 v.41 600-607页 [查看摘要][在线阅读][下载 1527K]
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  • 液-液相分离在病毒感染中的研究进展

    刘雅琪;刘茜;岑山;

    液-液相分离(Liquid-liquid phase separation,LLPS)是真核细胞中无膜细胞器形成的基础,这一过程促进了生物组分与化学反应在时间与空间上的精细分隔,是真核细胞生物学的一项核心特征。这些由LLPS驱动的无膜细胞器,在调控基因表达、应对环境压力、修复染色质损伤以及介导免疫反应等生物学途径中扮演着不可或缺的角色。值得注意的是,LLPS相关蛋白的功能异常与病毒感染之间存在深刻的联系,多种病毒复制的不同环节均有相分离结构的参与,且宿主在应激状态下会形成相分离结构抵抗病毒感染。本文从LLPS参与病毒感染的机制及宿主基于LLPS衍生的抗病毒策略两方面阐述相分离在病毒感染中的调控作用,深入了解相分离在病毒感染过程中发挥的作用。

    2025年02期 v.41 608-617页 [查看摘要][在线阅读][下载 1510K]
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  • 非酒精性脂肪肝对慢性乙型肝炎预后的影响研究进展

    厉彬杰;刘寿荣;

    慢性乙型肝炎(Chronic hepatitis B,CHB)是全球的公共卫生难题,近来年非酒精性脂肪肝(Non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)负担持续增加,两者并发现象是当前肝病领域的一大特点与趋势。众所周知,乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染和NAFLD是导致肝硬化、肝细胞癌(Hepatic cell carcinoma,HCC)发生的主要原因。然而,对于CHB患者,并发NAFLD对于肝纤维化的进展、HCC的发生以及抗病毒治疗效果的影响,目前的证据仍然模糊不清。因此,本文将介绍慢性乙型肝炎患者并发非酒精性脂肪肝的流行病学,并重点阐述非酒精性脂肪肝对慢性乙型肝炎患者预后以及抗病毒治疗的影响,为临床治疗提供参考。

    2025年02期 v.41 618-624页 [查看摘要][在线阅读][下载 1365K]
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信息

  • 《中文核心期刊要目总览》2023年版入编通知

    <正>《病毒学报》主编先生/女士:我们谨此郑重通知:依据文献计量学的原理和方法,经研究人员对相关文献的检索、统计和分析,以及学科专家评审,贵刊《病毒学报》入编《中文核心期刊要目总览》2023年版(即第10版)之基础医学类的核心期刊。《中文核心期刊要目总览》2023年版从2021年10月开始研究,研究工作由北京大学图书馆主持,共32个单位的148位专家和工作人员参加了本项研究工作,全国各地9473位学科专家参加了核心期刊表的评审工作。经过定量筛选和专家定性评审,从我国正在出版的中文期刊中评选出1987种核心期刊。

    2025年02期 v.41 625页 [查看摘要][在线阅读][下载 486K]
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  • 中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术·2024版)

    <正>~~

    2025年02期 v.41 630页 [查看摘要][在线阅读][下载 345K]
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  • 2025年中国微生物学会及各专业委员会学术活动计划表

    <正>~~

    2025年02期 v.41 631-632页 [查看摘要][在线阅读][下载 142K]
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  • 《病毒学报》征稿简则(2018年12月25日修订)

    <正>《病毒学报》是病毒学专业学术刊物,创刊于1985年,国际标准连续出版物号:ISSN 1000-8721,国内统一连续出版物号:CN 11-1865/R,国内邮发代号:82-227,国外发行代号:BM 6448。主管单位是中国科学技术协会,主办单位是中国微生物学会,承办单位是中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,出版单位是《病毒学报》编辑部。《病毒学报》是中国精品科技期刊、中国科技核心期刊、北京大学基础医学核心期刊《中文核心期刊要目总览》、武汉大学RCCSE(中国科学评价研究中心)中国核心学术期刊。刊载人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体、类病毒、朊病毒以及新病毒等的基础理论研究和应用研究的新成果与新进展。栏目有论著、研究快报(短篇论著)、评述、综述以及简讯等。

    2025年02期 v.41 633页 [查看摘要][在线阅读][下载 934K]
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