人类病毒研究论著

  • 三带喙库蚊中分离的西藏环状病毒全基因序列测定及分析

    范娜;曹玉玺;付士红;程睿;何英;雷雯雯;王环宇;鲁晓晴;梁国栋;

    西藏环状病毒(Tibet orbivirus,TIBOV)是环状病毒属中的新成员,首次分离自中国西藏自治区的圆斑按蚊,本研究首次对从三带喙库蚊标本中分离到的西藏环状病毒(HN11121株)进行全基因组序列测定和分子遗传进化分析。结果显示除第2节段以外,三带喙库蚊分离的HN11121病毒株与从圆斑按蚊分离的西藏环状病毒原始分离株(XZ0906)第1~10节段核苷酸和其编码的氨基酸序列长度相同,核苷酸和氨基酸同源性分别为70.3%(S6)~98.7%(S5)和79.8%(S6)~99.8%(S10);而HN11121病毒株与XZ0906病毒株第2节段核苷酸长度分别为2 850bp和2 838bp,分别编码950和946个氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分别为55.8%和47.1%。病毒VP2蛋白氨基酸位点差异结果显示从三带喙库蚊分离的HN11121病毒与从圆斑按蚊分离的XZ0906相比存在390个氨基酸差异位点。基于HN11121病毒株VP1基因和VP3基因核苷酸序列的系统进化分析结果显示HN11121属于环状病毒属西藏环状病毒,但是从三带喙库蚊分离的HN11121病毒与在圆斑按蚊分离的西藏环状病毒原始分离株(XZ0906)处在不同的进化分支。以上结果提示,从三带喙库蚊分离的西藏环状病毒(HN11121)与从圆斑按蚊分离的西藏环状病毒在病毒基因组和病毒基因组分子遗传进化均存在较大差异,鉴于三带喙库蚊是我国乙脑病毒的主要传播媒介,同时该蚊种也是我国南方广泛存在的蚊虫种类,因此加强三带喙库蚊中西藏环状病毒监测对于了解西藏环状病毒的生物多态性具有重要意义。

    2018年05期 v.34 461-473页 [查看摘要][在线阅读][下载 5245K]
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  • 广东省10株乙型脑炎病毒的分子特征研究

    吴德;谈琦琪;张欢;张欣;周惠琼;孙九峰;梁国栋;

    了解广东省目前流行的乙型脑炎病毒的基因型别,以及新分离毒株与P3和SA14-14-2疫苗株E蛋白的氨基酸差异,推测疫苗株的可能保护效果。本研究对广东省2017年从蚊虫和蠓虫标本分离的10株乙型脑炎病毒基因组序列测定,利用MEGA软件登录GenBank下载乙型脑炎病毒代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与疫苗株进行氨基酸同源性比对和E蛋白的序列分析。10株乙型脑炎病毒均属基因I型GI-b组,但分别位于2个不同的、小的进化分枝中。10株新分离病毒与P3和SA14-14-2疫苗株的E蛋白氨基酸同源性分别位于97.40%~97.60%和97.20%~97.40%之间。E基因区段500个氨基酸中,P3株与新分离乙型脑炎病毒株之间共存在17个氨基酸位点的差异(包括12个共同氨基酸的改变),略高于SA14-14-2疫苗株的16个氨基酸位点变异(包括11个共同氨基酸的改变)。其中在DI区的P3和SA14-14-2株分别有1个和3个共同氨基酸变异,DⅡ区各有5个共同氨基酸改变,DⅢ区分别有5个和2个共同氨基酸改变,结构域之外各有1个共同氨基酸的变异。绝大多数变异发生在非关键位点,只在E306和E388处观察到的氨基酸位点变异与疫苗P3株关键位点的改变有关,这两个位点(G306E,E388G)均发生在DⅢ区,而疫苗SA14-14-2未观察到关键位点的改变。总之,广东省流行的乙型脑炎病毒基因型别可能已由Ⅲ型变为I型;疫苗SA14-14-2株及P3株与新分离毒株均具有很高的同源性,绝大多数关键氨基酸位点未发生变异,对新分离病毒均具有良好的免疫保护价值。

    2018年05期 v.34 474-481页 [查看摘要][在线阅读][下载 683K]
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  • 基于RT-HDA等温扩增技术快捷检测H7N9禽流感病毒的方法研究

    方斌;刘琳琳;李翔;余晓;叶国军;江永忠;

    常规PCR方法不适宜于实验条件不足的基层现场检测H7N9禽流感病毒,不利于疑似病例的及时诊治。本研究旨在建立一种快速简便、高灵敏度、低成本的H7N9禽流感病毒快速核酸检测技术。选用H7N9禽流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)基因作为靶标区域设计引物,采用FITC和Biotin标记上下游引物,通过逆转录解旋酶依赖性等温扩增(Reverse transcription helicase-dependent isothermal amplification,RT-HDA)技术扩增病毒RNA,辅以胶体金免疫层析试纸检测核酸扩增产物,建立H7N9禽流感病毒等温扩增检测方法。采用H7N9禽流感病毒质粒和病毒培养物对该方法的灵敏性、特异性和重复性进行评价,结果显示:病毒最低检测限20个拷贝数/μL,与常规PCR方法相比较无明显差异,重复性试验一致,与其他型别的禽流感、流感病毒无交叉反应。本研究建立的RT-HDA联合胶体金免疫层析试纸检测H7N9禽病毒检测方法具有较好的灵敏度、特异性和重复性,特别适用于现场条件下检测H7N9禽流感病毒快速简便的检测。

    2018年05期 v.34 482-488页 [查看摘要][在线阅读][下载 1132K]
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  • 重组甲型流感病毒基质蛋白1和2通过ERK信号因子诱导小鼠气管上皮细胞产生IFN-γ

    祝洁;朱颜鑫;曹慧军;罗红;兰露莎;江滟;

    探讨重组甲型流感病毒基质蛋白1和2(rM1和rM2)通过细胞外信号调节蛋白激酶(Extracellular signal regulated kinase,ERK)诱导小鼠气管上皮细胞产生γ-干扰素(Interferon-γ,IFN-γ)作用及机制。以原代小鼠气管上皮细胞为实验模型,实验分为6组(rM1组、rM2组、甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)组、rM1+IAV组、rM2+IAV组和正常对照组)。在各组分干预细胞4h、8h、24h时,采用半定量RT-PCR法检测各组细胞中IFN-γmRNA的表达和免疫印迹法检测各组细胞中IFN-γ、ERK、磷酸化ERK(phospho-ERK,p-ERK)蛋白的表达;用抑制剂阻断ERK信号因子信号传导,观察对各组分诱导小鼠气管上皮细胞产生IFN-γ的影响。各组分干预细胞4h、8h、24h,rM1组、rM2组、IAV组、rM1+IAV组、rM2+IAV组细胞的IFN-γmRNA和IFN-γ蛋白表达水平高于正常对照组(P<0.01或P<0.05);rM1+IAV组、rM2+IAV组细胞的IFN-γmRNA和IFN-γ蛋白表达水平高于IAV组(P<0.01或P<0.05)。在干预细胞4h,仅rM2组细胞中ERK磷酸化水平显著高于正常对照组(P<0.01),在干预细胞8h、24h,rM1组、rM2组、IAV组、rM1+IAV组、rM2+IAV组细胞中ERK磷酸化水平均显著高于正常对照组(P<0.01或P<0.05)。加入ERK抑制剂,rM1组、rM2组、rM1+IAV组、rM2+IAV组细胞的IFN-γmRNA和IFN-γ蛋白表达水平显著低于非抑制剂组。本研究数据表明rM1和rM2可通过上调ERK信号因子的磷酸化水平诱导小鼠气管上皮细胞中产生IFN-γ,该诱导作用在干预4h即显著表现,并维持至少24h。

    2018年05期 v.34 489-496页 [查看摘要][在线阅读][下载 2066K]
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  • Gibson组装技术简化腺病毒载体反向遗传改造

    李萌;刘淑慧;邹小辉;张尊;牛国宇;鲁茁壮;

    重组腺病毒是常用的基因转移载体,本文介绍一种对腺病毒基因组进行反向遗传改造的策略。拟在维持基因编码蛋白氨基酸序列不变的前提下,突变去除重组人5型腺病毒Ad5GFP基因组的PmeI酶切位点。软件分析腺病毒质粒pAd5GFP序列,选择限制性内切酶BamHI将pAd5GFP切割为大小11.7和24.6kb两个片段,24.6kb大片段自身环化形成一个质粒pAd5GB,PmeI位于其上。PmeI/AscI双酶切pAd5GB质粒,产生2.4kb和22.2kb两个片段;在引物部位引入突变的PmeI位点(由gtttaaac突变为gtttaaaT),PCR扩增得到两端各延长30bp的上述2.4kb片段,与22.2kb片段进行Gibson组装,转化E.coli TOP10感受态细胞,得到pAd5GBXP质粒。BamHI酶切pAd5GBXP,碱性磷酸酶处理,与11.7kb片段连接,还原得到腺病毒质粒pAd5GXP。PacI线性化pAd5GXP质粒,转染293细胞,拯救得到Ad5GXP病毒;酶切分析证明Ad5GXP基因组不含有PmeI位点。研究结果说明将酶切连接与DNA组装技术相结合,能够方便灵活地对腺病毒基因组进行突变改造。

    2018年05期 v.34 497-503页 [查看摘要][在线阅读][下载 2388K]
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  • 狂犬病病毒TaqMan qRT-PCR检测方法的建立

    高鑫;刘佳佳;宋云;卢学新;朱武洋;

    建立狂犬病病毒TaqMan qRT-PCR检测方法,并进行评价和初步应用。针对狂犬病病毒L基因保守区域设计特异性引物、探针,建立PCR反应体系并评价检测体系的扩增效率、灵敏度、特异性和准确性等指标,灵敏度评价结果与现有巢式RT-PCR和基于N基因qRT-PCR检测方法相比较。结果显示本研究建立的基于L基因qRTPCR检测体系扩增效率高于90%;最小检测病毒滴度为2.7×10~(-3)FFU/mL,灵敏度高于基于N基因qRT-PCR和巢式RT-PCR 100倍;最小检测核酸拷贝数为100拷贝,建立了基于目的基因RNA标准品的标准曲线,可用于定量检测;对于我国的狂犬病病毒流行毒株检测范围较广,动物样本检测结果与金标准DFA检测结果相一致,准确性较高。本研究建立的狂犬病病毒qRT-PCR可用于狂犬病病毒实验室检测。

    2018年05期 v.34 504-511页 [查看摘要][在线阅读][下载 1888K]
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手足口病相关病毒研究专题论著

  • 柯萨奇病毒A组2型江苏分离株(JS16-80)全基因组序列分析

    杨倩;严冬梅;张勇;樊欢;嵇红;冀天娇;宋洋;许文波;

    柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS16-80在非结构蛋白P2和P3多区段均有出现重组现象,并且多个A组肠道病毒血清型参与了非结构蛋白的重组。本研究可帮助了解CV-A2的全基因组特征和重组特点,进一步为CV-A2重组对其进化和潜在致病力的影响提供基础数据。

    2018年05期 v.34 512-518页 [查看摘要][在线阅读][下载 3377K]
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  • 基于RIVEM的人肠道病毒衣壳表面结构绘制流程

    高柳莺;戎浩;祝苗;董长征;

    RIVEM是一款通过球面投射的方式在平面上绘制二十面体病毒衣壳结构的软件工具,因为开发时间较早,目前无法直接识别RCSB PDB数据库中绝大多数肠道病毒的三维结构文件。为此本研究发展了将RCSB PDB坐标体系转换到RIVEM PDB坐标体系的算法,开发了基于RIVEM的人肠道病毒衣壳表面结构绘制流程,并将该流程应用到PSGL-1和SCARB2这两个重要的肠道病毒受体的研究中。结果显示:构建的流程成功的绘制了RCSB PDB数据库中人肠道病毒的衣壳表面结构。与PyMol相比,RIVEM绘制的衣壳表面结构具有信息量更大,更便于研究衣壳与受体和抗体之间的相互作用关系等优点。对于广大非结构生物学专业的病毒学研究者来说,该流程能够促进RIVEM在衣壳与受体、抗体和抗病毒药物的相互作用、抗原表位、结构蛋白变异的监测以及肠道病毒致病机制等研究领域中的应用。该流程也能直接推广到包括脊髓灰质炎病毒、甲肝病毒和口蹄疫病毒在内的其他小RNA病毒的研究中。

    2018年05期 v.34 519-527页 [查看摘要][在线阅读][下载 6787K]
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  • 改进的GM(1,1)模型对内蒙古自治区手足口病高峰期发病率预测

    洪志敏;王艳娟;郝慧;房祥忠;李春阳;魏利东;

    以内蒙古自治区2009~2016年手足口病每年的高发月5~7月的发病数据为研究数据,分别建立自回归移动平均求和(Autoregressive Integrated Moving Average Model,ARIMA)模型与GM(1,1)灰色模型,对内蒙古自治区手足口病的高发月9岁以下儿童发病率进行拟合与预测,两种单一模型预测结果显示,GM(1,1)模型的预测精度高于ARIMA模型。为降低数据波动性对GM(1,1)模型预测效果的影响,文中基于弱化缓冲算子对GM(1,1)模型进行了改进,改进的GM(1,1)模型具有较大的灵活性且提高了传统GM(1,1)模型的预测精度。

    2018年05期 v.34 528-533页 [查看摘要][在线阅读][下载 371K]
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  • 2008~2017年中国大陆手足口病空间聚集性分析

    韩桃利;郭悦;许文波;王英;

    探讨中国大陆2008~2017年手足口病空间聚集性及其演化过程。分别利用ArcGIS10.3、GeoDa进行全局和局部空间自相关分析,GeoDa绘制手足口病Moran散点图和空间关联局域指标显著水平图,呈现手足口病聚集性演化路径。自2009年起,手足口病报告发病率隔年增高,在2014年达到阶段性高点,手足口病重症率和死亡率呈总体下降趋势。空间聚集性分析结果显示:手足口病发病率在2008~2017年、重症率在2008~2009年、死亡率在2010年、2012年、2015~2017年呈聚集性分布;Moran散点图显示,手足口病发病率持续或多数时间处于第1象限(高高)的地区为海南、广东、广西、湖南、浙江、福建、上海;重症率处于第1象限(高高)或第4象限(高低)的是海南、广东、云南、贵州、湖南、河南;手足口病死亡率处于第1象限(高高)的是海南、广东、重庆、贵州、湖南;三种率在第3象限(低低)具有相似性,以西南的四川、西藏,西北(不包括陕西)、东北地区为主。2008~2017年手足口病报告发病率、重症率、死亡率总的空间分布模式不完全相同,局部自相关提示,海南、广东、湖南三种率均处于高高聚集区,贵州手足口病重症率和死亡率处于高高聚集区,以上省份是防控的重中之重。采用空间统计分析有助于进一步了解手足口病流行规律和防控工作,稳定的空间分布模式仍有待后续数据的积累和追踪。

    2018年05期 v.34 534-542页 [查看摘要][在线阅读][下载 1152K]
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人乳头瘤病毒研究专题论著

  • 云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析

    席珏敏;陈俊英;潘玥;文送娇;林垚;王晓丹;叶超;管娇琼;洪珊;孙强明;

    研究云南地区人乳头瘤病毒18型LCR基因在宫颈癌组织中的变异特点,通过系统发生分析探讨HPV-18变异株的分子流行特征,并通过转录因子结合位点的预测分析LCR变异对病毒感染可能造成的影响。本研究提取了云南地区74例女性宫颈癌组织样本中的DNA,通过PCR、测序、序列比对,分析了9个HPV-18LCR完整DNA序列的基因变异信息,并用Mega 7.0软件使用邻接法进行进化分析,使用JASPAR数据库对可能的转录因子结合位点进行预测。HPV-18LCR序列中发现T7258A、C7529A、G7563A、A7567C、T7592C、A7670T、T7736G、C7764T、C7857T、A41G、C54T、A89C和T104C13个核苷酸点突变,其中最常见变异位点是T7592C,其次是C7857T,突变频率分别为100%和44.4%。9个HPV-18LCR完整DNA序列分属于4个HPV-18LCR变异体,进化树分析显示云南地区流行的HPV-18主要为A系变异体(8个A1亚系,1个A4亚系),HPV-18LCR中T7592C、C7857T变异位于转录因子TBP、HOXA5的结合区域内。云南地区宫颈癌组织中主要流行的HPV-18为A系变异体,T7592C、C7857T是HPV-18LCR中主要变异位点。

    2018年05期 v.34 543-548页 [查看摘要][在线阅读][下载 329K]
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  • 不同介质标本中人乳头瘤病毒E6癌蛋白检测效果对比研究

    热米拉·热扎克;朱之恺;张倩;徐小倩;韦梦娜;胡尚英;王岩;张莉;赵雪莲;乔友林;赵方辉;

    高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)E6癌蛋白在宫颈癌发生发展中起重要作用。本研究旨在评估一种新型、快速、低成本的HPV E6癌蛋白检测技术(OncoE6TM,AVC,Sunnyvale,CA,USA)在棉签和液基细胞学(Liquidbased cytology,ThinPrep)两种不同采样和储存介质宫颈标本中对HPV E6癌蛋白检测结果的一致性和对宫颈上皮内瘤变2/3(CIN2/3)及以上病变检出准确性。依托于1999年在山西省建立的宫颈癌筛查队列,对2014年随访中HPV DNA检测(第二代杂交捕获技术,HC2)阳性妇女的棉签和ThinPrep标本均进行E6癌蛋白检测,并用线性反向探针杂交技术(LiPA,Innogenetics)进行HPV基因分型。在294例HPV阳性妇女的棉签和ThinPrep标本中,E6癌蛋白阳性率相当(11.2%vs 7.8%,P=0.16);两者一致率为96.6%、Kappa值0.8。E6癌蛋白检测和LiPA基因分型对HPV16和HPV18型别的检测结果在两种标本中的一致性均较高(>90%)。E6癌蛋白检测对CIN2+的检出效果如下:在棉签标本中,其灵敏度50.0%、特异度93.9%、阳性预测值51.6%;而ThinPrep标本中,灵敏度46.9%、特异度97.1%、阳性预测值68.2%;两者ROC曲线下面积同样为0.72;各项指标间无统计学差异(P>0.05)。同样,对CIN3+的检出效果也相当,各指标间无统计学差异(P>0.05)。E6蛋白检测在不同检测条件下可重复性较好,且两种标本有其不同的优势,应当根据不同地区卫生资源,适当选择标本类型,进行宫颈癌筛查。

    2018年05期 v.34 549-554页 [查看摘要][在线阅读][下载 147K]
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动物病毒研究论著

  • A型塞尼卡病毒的分离鉴定及生物学特性研究

    郭笑然;韩世充;张小丽;孙世琪;马小军;郭慧琛;

    本文报道了对分离自湖北地区的A型塞尼卡病毒(Senecavirus A,SVA)CH-HB-2017毒株进行鉴定和生物学特性研究。全基因序列分析显示,该分离株与国内毒株CH-HN-2017、CH-HNSL-2017、CH-FJ-2017和美国毒株USA-IA44952-2015、USA-IA44662-2015和USA-SD41901-2015的同源性高。该SVA可在猪肾传代细胞(IBRS-2)和猪睾丸细胞(Swine testis cells,ST)中复制增殖,感染后都能产生CPE,通过病毒一步生长曲线、蚀斑试验和定量PCR等试验表明,该毒株对IBRS-2细胞更易感,病毒滴度更高。本实验成功分离到1株SVA流行毒株,并研究了该毒株的生物学特性,为深入研究该病毒奠定基础。

    2018年05期 v.34 555-563页 [查看摘要][在线阅读][下载 2813K]
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  • 一株抗猪流行性腹泻病毒N蛋白单克隆抗体抗原表位的鉴定

    林莹;龚奕乐;钱晓宇;张芸;薛春宜;曹永长;

    PEDV N蛋白为高度保守性蛋白,具有极强的免疫原性,因此在临床诊断中具有重要作用。本文对实验室前期制备的针对N蛋白的单克隆抗体9G11的抗原表位进行精确定位。通过与N蛋白进行免疫印迹反应证明9G11所识别的表位是N蛋白的线性表位。利用NEB十二随机肽库进一步定位9G11核心表位氨基酸,结果显示位于N蛋白75~78位的氨基酸FYYL为9G11所识别的关键氨基酸。对20株PEDV不同亚群代表毒株的对应区域进行同源性分析表明此表位高度保守。确定该抗体识别的抗原表位有助于了解N蛋白的结构与功能,同时也为以表位为基础的快速、准确并具临床应用价值的PEDV诊断方法的建立打下良好基础。

    2018年05期 v.34 564-570页 [查看摘要][在线阅读][下载 2919K]
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  • 基于双探针杂交的AIV、NDV和FAV-4三重环介导PCR鉴别检测方法的建立及应用

    郑鸣;郭宏伟;李华玮;王老七;魏露露;王艺颖;王永芬;

    本研究目的是建立禽流感病毒(AIV)、新城疫病毒(NDV)和禽腺病毒4型(FAV-4)三重环介导PCR检测方法,用于3种病毒混合感染的鉴别诊断。根据GenBank数据库中AIV的HA基因、NDV的F基因和FAV-4的Hexon基因序列保守性,分别设计两条序列相邻的特异性探针,标记于不同大小的拟南芥TOC1基因片段两端,作为报告基因,用于环介导PCR检测,成功建立了AIV、NDV和FAV-4三重环介导PCR鉴别诊断方法,扩增片段大小分别为200bp、270bp和360bp。特异性试验结果表明,环介导PCR对含有AIV、NDV和FAV-4核酸的样品可扩增出特异性目的片段,而含有IBDV、IVB、FPV和MDV核酸的样品则未见明显扩增,特异性良好;灵敏性试验结果表明,环介导PCR对AIV、NDV和FAV-4的最低极限浓度分别为25pg/μL、12.5pg/μL和12.5pg/μL的核酸样品,检测灵敏度高;多病原同时检测不影响环介导PCR检测特异性和灵敏性。利用该方法对117份临床样本进行检测,结果显示,环介导PCR对AIV、NDV和FAV-4阳性检出率分别为15.4%,27.4%和34.2%,分别高于常规PCR 12.8%,23.9%和32.5%,接近于SybrGreen实时PCR 15.4%,28.2%和35%;kappa一致性检验显示,环介导PCR、SybrGreen实时PCR两种方法对AIV、NDV和FAV-4检测结果高度符合,Kappa值分别为κ=0.93、κ=0.89和κ=0.94。本研究成功建立了AIV、NDV和FAV-4三重环介导PCR检测方法,适用于临床上3种病原的快速鉴别诊断。

    2018年05期 v.34 571-579页 [查看摘要][在线阅读][下载 493K]
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  • 北京地区猫疱疹病毒Ⅰ型的分离及鉴定

    王吉;付瑞;冯育芳;李晓波;王淑菁;王莎莎;李威;秦骁;巩薇;岳秉飞;贺争鸣;

    了解北京地区猫疱疹病毒Ⅰ型(FHV-1)毒株特点,为猫疱疹病毒Ⅰ型的进一步研究及对猫的感染预防控制奠定基础。经特异性PCR检测为FHV-1阳性临床猫眼鼻拭子,经过处理,接种CRFK细胞,通过细胞培养分离病毒。通过间接免疫荧光试验、电镜形态观察、病毒毒力测定及基因序列分析等对分离株进行鉴定。PCR检测FHV-1阳性的14只猫眼鼻拭子接种CRFK细胞,有6只猫样本能使CRFK细胞发生圆缩、拉网集聚等病变;6个样本接种的CRFK病变细胞滴片进行免疫荧光试验,均产生绿色荧光反应;经传代培养,有5株分离株能够稳定传代,其中有2株弱毒,3株强毒;电镜下5株分离株均可见直径100~160nm的球型病毒粒子;5株分离株与FHV-1标准株C-27及2个不同公司来源疫苗株gB、gD基因核苷酸比较同源性均为99%以上。实验室成功分离保存5株能稳定传代的FHV-1毒株,5株分离株与FHV-1标准株及2个疫苗株亲缘关系很近。

    2018年05期 v.34 580-590页 [查看摘要][在线阅读][下载 7387K]
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  • 马赛病毒上海分离株的分离和全基因组分析

    夏宇程;钟江;

    马赛病毒是一种感染棘阿米巴的大型双链DNA病毒,在世界各地都有这类病毒的分离报道。本研究从上海地区环境土壤样品中分离了一株马赛病毒。该病毒可以高效地感染棘阿米巴,病毒颗粒呈典型的二十面体结构,直径大约在0.25μm,基因组为368kb。病毒基因组DNA序列分析结果表明,该病毒属马赛病毒科的A系马赛病毒,与欧洲、澳大利亚等地报道的病毒株相似度极高。通过与分离自全球不同地区的另外四株马赛病毒比较发现大部分病毒基因都处于负选择,说明马赛病毒的核心基因非常保守并且足以支持病毒在不同地区的适应性。

    2018年05期 v.34 591-598页 [查看摘要][在线阅读][下载 1366K]
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综述

  • 中东呼吸综合征抗病毒治疗研究进展

    牛培华;谭文杰;

    中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)目前在全球传播至20多个国家,病死率高达35%左右。目前尚无特异有效的临床救治手段,针对MERS-CoV感染的治疗策略的研发和应用是世界范围内迫切需要解决的重要问题。本文针对MERS-CoV感染抗病毒治疗策略从药物治疗(包括临床批准药物、蛋白酶抑制剂、抗病毒肽及核酸类药物)和免疫治疗(包括恢复期血浆治疗和特异性单/多克隆抗体)两方面的研究进展进行综述。

    2018年05期 v.34 599-605页 [查看摘要][在线阅读][下载 175K]
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  • Neddylation修饰与病毒感染调控研究进展

    孙海伟;姚威;汪凯;陈鸿军;

    Nedd8是一类结构上与泛素相似的分子,广泛参与蛋白质翻译后修饰,这一过程被称为Neddylation。Neddylation修饰已经被证实参与几乎所有细胞内的调控过程,并在病毒感染过程有着重要的调控作用,但对于其具体的调控机制研究还十分匮乏。深入开展Neddylation修饰与病毒感染之间的分子调控机制研究将有助于阐明病毒的致病机理。

    2018年05期 v.34 606-612页 [查看摘要][在线阅读][下载 602K]
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  • 病毒基因组中m~6A甲基化修饰调控机制及研究进展

    巩沅鑫;王超;李晋涛;

    腺苷酸N6甲基化作用(m~6 A)广泛存在于真核生物以及细菌和病毒的基因组中,在进化上具有高度保守性,并能影响RNA的结构、定位和功能。病毒m~6 A修饰发生在宿主细胞内的感染阶段,主要依赖于宿主细胞内的甲基转移酶和脱甲基酶系统的调节。m~6 A功能的实现一定程度上通过与读码器蛋白(YT521-B homology domain family,YTHDF)结合而发挥作用。在不同种类的病毒中,m~6 A修饰执行两种完全相反的调节功能。本文通过对目前关于病毒m~6 A修饰的研究进行总结,旨在为mRNA水平表观转录组学研究提供一定的参考。

    2018年05期 v.34 613-618页 [查看摘要][在线阅读][下载 151K]
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  • 人偏肺病毒F蛋白与细胞融合机制研究进展

    张弛;王志玉;

    人偏肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV)是一种新发呼吸道病毒。hMPV感染可引起广泛的呼吸道疾病,目前已越来越受到人们的重视。多数副粘病毒与宿主细胞膜的融合过程依赖吸附蛋白和融合蛋白的共同参与。hMPV的特别之处在于其融合蛋白(F)既可以结合受体,又可以介导膜融合。本文从hMPV包膜表面具有双重功能的F蛋白入手,简要介绍F蛋白的结构和生理功能,重点阐述F蛋白介导的细胞融合机制和特性,对近几年来国内外研究进展进行了回顾与展望。

    2018年05期 v.34 619-624页 [查看摘要][在线阅读][下载 203K]
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