- 曹润冬;冯晔囡;陈操;
2024年夏季以来,全球新冠病毒新变异株演化流行呈现明显地区差异,本文主要分析了全球主要国家和地区新冠病毒变异株流行趋势并研判其在我国的流行趋势。6月17日至7月28日,全球主要流行新冠变异株为KP.2及其亚分支、KP.3.1.1及其亚分支和KP.3其他进化分支。其中,KP.3.1.1及其亚分支占比显著上升;欧洲与北美洲国家整体呈现出的变异株流行趋势与全球相似;亚洲国家主要以KP.3及其亚分支为主,但KP.3.1.1的流行仍处于极低水平;大洋洲国家KP.3及其亚分支占比呈升高趋势,但KP.3.1.1的流行未见明显升高;南美洲国家的变异株流行占比与全球显著不同,具有明显的区域特色。因此,今冬明春KP.2和KP.3及其亚分支可能会在全球继续广泛流行,且KP.3.1.1及其亚分支可能会成为欧洲与北美地区的优势变异株,亚洲等其他地区不排除KP.3.1.1占比升高的可能性。虽然我国本土KP.3及其亚分支的流行仍处于极低水平,但占比也处于升高趋势,未来可能与占比逐渐升高的KP.2、LB.1及其亚分支同步或更持久的流行。
2025年01期 v.41 1-5页 [查看摘要][在线阅读][下载 1287K] [下载次数:136 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 汪雅婷;朱灿灿;尹雪儿;姚杰;王琴;
环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)与将成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR/Cas12a)技术相结合,建立一种快速、准确、无污染的甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)的单管式检测方法(LAMP-CRISPR/Cas12a),并探讨其在临床诊断中的应用价值。设计并筛选最佳crRNA和LAMP引物,优化反应缓冲液、ssDNA reporter浓度以及CRISPR/Cas12a反应温度,建立单管式LAMP-CRISPR/Cas12a检测体系,并对该方法的灵敏度、特异性和临床实用性进行了评估。LAMP-CRISPR/Cas12a单管一步法可在45min内实现IAV的检测,灵敏度为10拷贝/μL,检测常见呼吸道病原体RSV-A、RSV-B、PIV3、IBV和SARS-CoV-2结果均为阴性,特异性良好;10例临床样本检测结果均与临床诊断结果相符,且LAMP-CRISPR/Cas12a与PCR法均一致。LAMP-CRISPR/Cas12a单管法检测IAV简便、快速、灵敏度高,且特异性强,无须开盖操作,避免了气溶胶污染,有望成为快速检测IAV的新方法。
2025年01期 v.41 6-15页 [查看摘要][在线阅读][下载 1647K] [下载次数:197 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 曹卫华;王诗雨;张子昱;李鑫鑫;邓雯;蒋婷婷;张亚琴;路遥;张璐;谢尧;李明慧;
本研究旨在探索原发性胆汁性胆管炎(Primary biliary cholangitis, PBC)患者经熊去氧胆酸(Ursodeoxycholic acid, UDCA)治疗对新冠病毒感染及临床结局的影响。符合PBC诊断标准的患者入组,按照患者是否接受UDCA治疗分为两组:经UDCA治疗组和未经UDCA治疗组。收集患者PBC诊断相关资料、治疗信息等临床资料,观察新冠病毒感染患者感染率、发病及预后指标。共收集1137例自身免疫性肝病患者,筛选出569例PBC患者,其中56例患者在随访期间丢失,513例患者完成了随访,包括女性402例,男性111例,平均年龄58.17±11.03岁。UDCA治疗组和非UDCA治疗组分别406例、107例。UDCA治疗组中治疗PBC的激素使用率(11.08%)显著高于非UDCA治疗组(2.80%)(χ~2=6.845, P=0.009)。总人群新冠病毒感染率为80.90%,感染者的年龄(57.08±10.84)显著低于未感染者(62.78±10.69)(t=4.691, P<0.001),未感染者UDCA的使用率(87.76%)显著高于感染患者(77.11%)(χ~2=5.444, P=0.020),并且UDCA治疗者的新冠病毒感染率(80.79%)显著低于非UDCA治疗者(88.78%)(χ~2=5.444, P=0.020),单因素和多因素Logistic回归分析显示,年龄(OR=1.053,P<0.001,95%CI(1.029-1.077))和UDCA的使用率(OR=2.218,P=0.022,95%CI (1.115-4.059))与新冠病毒感染率较低有关。在新冠病毒感染患者中,UDCA治疗组中女性新冠病毒感染者的比例高于男性(82.81%vs. 17.19%, P<0.001),UDCA治疗组新冠病毒感染恢复时间显著长于非UDCA治疗组(9.63±6.80 vs. 7.46±3.58, P=0.003)。无论是否经UDCA治疗,所有新冠病毒感染患者均好转。PBC患者UDCA的使用与新冠病毒感染的低发生率相关,接受UDCA治疗的患者感染后的恢复时间更长。
2025年01期 v.41 16-22页 [查看摘要][在线阅读][下载 1286K] [下载次数:52 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 宋彦丽;孙誉芳;鲍春婷;王浇磊;权娅茹;李长贵;
比较新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)灭活疫苗(Inactivated vaccine, In)和腺病毒载体疫苗(Adenoviral vector vaccine, Ad)同源和异源免疫引起的B细胞抗原受体(B-cell receptor, BCR)差异,探究SARS-CoV-2疫苗异源加强引起的抗体应答增强的原因。分别给小鼠同源免疫灭活疫苗In~4In、异源免疫3InAd,并于每次免疫10 d后采外周血检测各组血清针对SARS-CoV-2原型株和XBB.1.16变异株的中和抗体水平;提取同源和异源免疫后小鼠脾脏RNA,逆转录为cDNA后,对BCR重链的CDR3区序列进行BCR免疫组库测序,分析同源和异源免疫策略中CDR3的氨基酸长度多样性、V基因使用频率、V-J基因配对频率、BCR克隆多样性和克隆扩增水平。结果显示,异源3InAd组引起的针对原型株和XBB.1.16毒株的中和抗体水平显著高于同源免疫组;3InAd组CDR3氨基酸长度分布与同源免疫In~4In组不同;3InAd组V基因IGHV11-1、IGHV4-2使用频率显著高于同源4In组,IGHV5-6基因的使用频率低于4In组,IGHV9-3基因的使用频率在同源和异源免疫组无差异;同源免疫In~4In后,BCR克隆种类逐渐丰富,但BCR top 50的频率逐渐降低;3InAd组BCR种类丰富性与4In组相比没有明显增加,BCR top 50的频率逐渐增加,表明异源免疫增加了主要BCR克隆的扩增。本研究发现SARS-CoV-2异源免疫改变了B细胞CDR3长度、V基因频率、V-J基因配对频率、BCR种类多样性和BCR克隆扩增水平。
2025年01期 v.41 23-32页 [查看摘要][在线阅读][下载 1542K] [下载次数:82 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:1 ] - 赵建平;李甜甜;孙健茹;陈震;王乃利;李文卿;曹萌萌;马超;李宏义;
新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019, COVID-19)急性感染导致心血管系统损伤的病理生理学机制尚不明确,揭示严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronary virus 2, SARS-CoV-2)病毒蛋白在人体心血管组织中的分布特征将有助于认识和理解心脏损伤的病理机制。本研究纳入COVID-19急性感染期死亡患者8例,其中6例男性,2例女性,平均年龄81.4岁(66~98)。通过病理尸检获取心脏组织,分别采用HE染色观察心血管组织病理变化,免疫组织化学染色观察SARS-CoV-2刺突蛋白(Spike S1、S2亚基)和核衣蛋白(Nucleocapsid,N蛋白)在心脏组织中的分布。在所有8例标本的心脏组织中发现,在心外膜脂肪细胞、心外膜浸润细胞、心血管内皮细胞以及心肌细胞中可见S1、S2和N蛋白的表达,在血管周围脂肪细胞中可见S2亚基和N蛋白的表达。但是,在心外膜、血管外膜等组织中广泛分布着S1亚基。本研究发现COVID-19急性感染期心血管组织细胞中存在S1、S2、N等蛋白的表达,在心外膜和血管外膜中存在S1蛋白的表达,这种外膜中广泛分布的S1导致心血管系统损伤的致病机制尚不清楚,值得进一步研究。
2025年01期 v.41 33-38页 [查看摘要][在线阅读][下载 1431K] [下载次数:24 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
- 尤娜;张梦萍;张苏晗;李东;陈致飞;张海荣;郑凝旋;杨秀惠;
麻疹病毒基因型流行数量在逐年下降,但B3和D8基因型病毒株却频频出现,并成为近年唯一发现在流行的两个野病毒基因型;我国本土H1基因型在2019年后未再检出。本研究从细胞水平分析了输入B3和D8基因型病毒株、本土H1基因型不同年代分离株及疫苗株在Vero/SLAM细胞上吸附力、复制力和致细胞病变能力的差异性。结果发现,不同分离株间存在不同程度表现型的差异,有可能影响其传播流行的强度。与S_(191)疫苗株相比,B3基因型代表株MV19-1144(B3)在Vero/SLAM细胞上虽具有较低的吸附能力,却有较强复制能力和致细胞病变能力,能快速地在较短时间内达到拷贝数和病毒量的高峰;另一代表株MV18-55(B3)细胞吸附力更强些,早期同样不存在下降期,就开始病毒较强的复制和增殖。MV19-1214(D8)具有较强的吸附能力,更容易感染宿主细胞,但是病毒复制力和致细胞病变能力则较弱;MV20-17(D8)却具有不一样的表现,其吸附力较MV19-1214(D8)弱些,但复制和致细胞病变能力更接近疫苗株病毒。福建省近期的H1基因型分离株MV15-278(H1a)和MV16-189(H1a)虽然在吸附力方面和早期H1分离株相比无统计学差别,但先后出现了复制力和致细胞病变能力的下降,提示在强大的免疫压力下,本土病毒株可能出现了突变,减缓了病毒传播和流行的速度,最终使得H1a基因型在福建的阻断。
2025年01期 v.41 39-47页 [查看摘要][在线阅读][下载 1390K] [下载次数:70 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 杨梦瑶;柴鹏弟;章青;宋敬东;裴银辉;段招军;
体外构建表达水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)糖蛋白E(Glycoprotein E,gE)的复制缺陷型人26型重组腺病毒疫苗,并进行重组病毒免疫原性的初步评价。利用同源重组的方法将gE原始信号肽序列替换成tPA组织纤溶酶原激活剂(Tissue plasminogen activator,tPA)信号序列(tPA-gE),将目的片段基因(tPA-gE)连接到腺病毒载体Ad26-empty得到重组腺病毒质粒Ad26-tPA-gE。线性化的重组腺病毒质粒转染至HEK293A细胞进行病毒包装与扩增,利用氯化铯密度梯度离心法纯化病毒,基于腺病毒六邻体蛋白质测定病毒滴度,Western blot验证重组腺病毒中tPA-gE表达情况,电镜检测重组病毒大小与形态。重组病毒(Ad26-tPA-gE)通过肌肉注射免疫C57BL/6N小鼠,第8周后下颌采血通过间接ELISA检测小鼠血清中特异性的抗gE的抗体效价评价体液免疫,ELISPOT检测小鼠脾淋巴细胞分泌IFN-γ及IL-2情况观察细胞免疫。纯化得到滴度为7.2×10~(10)ifu/mL的重组腺病Ad26-tPA-gE, Western blot验证重组病毒感染的细胞能够正常表达gE,电镜检测病毒大小均一,形态完整。重组腺病毒疫苗Ad26-tPA-gE可成功诱导小鼠产生抗gE特异性IgG、IgG1和IgG2a抗体,以及淋巴细胞分泌IFN-γ和IL-2。成功构建了表达VZV gE的复制缺陷型重组腺病毒,免疫C57BL/6N小鼠后有效激活体液及细胞免疫反应,为后续基于腺病毒载体的带状疱疹疫苗研究提供基础。
2025年01期 v.41 48-58页 [查看摘要][在线阅读][下载 1578K] [下载次数:246 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 杨泽;杨晨光;傅慧琴;袁洋;崔琪奇;赵冰;刘芳芳;杨敏娟;薛曹怡;沈奕峰;郝莉鹏;储强;潘丽峰;
了解上海市浦东新区不同来源样本中腺病毒的检出情况,初步探讨城市生活污水中腺病毒浓度与病例腺病毒感染的关系。收集2023年7月1日-2024年6月30日上海市浦东新区污水处理厂、监测哨点医院的急性呼吸道感染和急性胃肠道感染样本,用微流体芯片检测污水中的腺病毒和急性呼吸道感染样本中的呼吸道腺病毒,通过实时荧光PCR方法检测腹泻样本中的胃肠道腺病毒。利用不同浓度梯度腺病毒标准品检测结果制作浓度梯度曲线,计算污水样本中腺病毒浓度并与病例检出结果进行分析。研究期间共采集临床样本5097份,其中急性呼吸道感染样本3995份,检出呼吸道腺病毒阳性样本116份,检出率为2.90%(116/3995),急性胃肠道感染样本1102份,检出胃肠道腺病毒阳性样本21份,检出率为1.91%(21/1102)。污水样本357份,检出呼吸道腺病毒342份,检出率为95.80%(342/357),胃肠道腺病毒检出310份,检出率为86.83%(310/357)。城市生活污水中的呼吸道腺病毒和胃肠道腺病毒浓度范围分别在1.09×10~5拷贝/L~2.20×10~7拷贝/L和2.58×10~5拷贝/L~7.10×10~7拷贝/L。污水中胃肠道腺病毒的浓度与病例中胃肠道腺病毒检出率呈现正相关。城市生活污水中的腺病毒浓度与病例检出率之间存在相关性。可以利用污水监测对病例监测进行补充。
2025年01期 v.41 59-70页 [查看摘要][在线阅读][下载 1391K] [下载次数:109 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 林小嫚;潘倩瑜;何雅青;孟君;
研究RNF126在EV71感染炎症反应调控中的作用及相关机制。在THP-1诱导分化的巨噬细胞中,以特异性靶向RNF126的干扰RNA降低RNF126表达作为干扰组,以阴性对照干扰RNA作为对照组,以EV71感染不同时间,采用实时荧光定量PCR和ELISA分别检测IL-6、TNF-α、CCL3的mRNA和蛋白质水平表达变化;通过实时荧光定量PCR检测EV71-VP1表达变化;采用空斑形成试验检测病毒滴度变化;以Western blot检测天然免疫NF-κB信号通路相关蛋白的磷酸化和表达变化。通过免疫共沉淀检测RNF126相互作用靶蛋白;观察RNF126对靶蛋白泛素化修饰的影响。结果发现,在EV71感染时,干扰RNF126表达后与对照组相比:IL-6、TNF-α和CCL3的mRNA和蛋白质水平表达显著减少(P<0.05),EV71-VP1表达增强(P<0.05),病毒滴度增高;NF-κB信号通路中IKKα/β、IκBα和p65磷酸化水平下降,IKKγ、IKKα及p65总蛋白表达无明显变化,IκBα表达增加。RNF126与IKKγ相互作用并介导其K63位泛素化活化。以上结果说明,EV71感染时,RNF126与IKKγ相互作用并介导其K63位泛素化,促进NF-κB信号通路活化及其下游细胞炎症因子产生,抑制病毒复制。
2025年01期 v.41 71-78页 [查看摘要][在线阅读][下载 1398K] [下载次数:126 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:2 ] - 余俊杰;李杉;刘夏飞;魏潇;段招军;
轮状病毒(Rotavirus,RV)是引起全球婴幼儿急性胃肠炎的重要病因。目前我国使用的轮状病毒疫苗为兰州生物研究所研制的口服活疫苗LLR。LLR是由羊源G10P[15]轮状病毒制备的减毒毒株。疫苗株的深入研究对新型疫苗开发具有重要意义。本研究将荧光素酶(NanoLuc Luciferase, NLuc)报告基因插入LLR/NSP1基因的ORF C端,并利用反向遗传学技术进行重组病毒拯救。通过结合dsRNA-PAGE硝酸银染色和NSP1基因RT-PCR扩增,证明成功拯救出rLLR/NSP1-NLuc重组病毒,并进一步通过间接免疫荧光、qRT-PCR、荧光素酶活性检测及病毒传代后的dsRNA-PAGE硝酸银染色实验与本实验室前期获得的重组轮状病毒rLLR/NSP3-NLuc进行病毒滴度、生长动力学、NLuc表达活性及遗传稳定性进行比较。结果显示rLLR/NSP1-NLuc的基因组拷贝数及荧光素酶活性低于rLLR/NSP3-NLuc,且两株重组病毒的P1~P5代均可检测到插入的NLuc基因片段。表明LLR的NSP1和NSP3基因节段均可稳定插入和表达NLuc,但NSP3插入NLuc后获得的重组病毒活力较NSP1更好,其表达NLuc的能力更强。本研究为进一步开展以LLR轮状病毒为疫苗载体的研究奠定了基础。
2025年01期 v.41 79-88页 [查看摘要][在线阅读][下载 1381K] [下载次数:121 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 和玥辰;欧阳秋红;秦蒙;
对黄芪颗粒治疗病毒性心肌炎(Viral myocarditis,VMC)疗效及机制的文献进行数据分析,系统评价其疗效和对炎性因子、免疫细胞的影响。检索PubMed、Cochrane Library、Embase、知网、万方、维普和中国生物医学文献数据库建库至2024年4月关于黄芪颗粒治疗VMC的文献,根据本文纳入排除标准筛选;提取数据并进行质量评价;利用Rev Man 5.4.1软件进行数据分析分析。本文纳入16篇临床随机对照试验,包含1239例患者。数据分析显示:黄芪颗粒组有效率高于对照组[OR=4.28,95%CI(2.92~6.29)],降低CK‐MB指标[MD=‐10.59,95%CI(‐12.90~‐8.28)],降低CK指标[MD=‐57.25,95%CI(‐80.70~‐33.80)],降低LDH指标[MD=‐24.23,95%CI(‐44.74~‐3.73)],降低AST指标[MD=‐17.25,95%CI(‐25.16~‐9.33)];炎性因子方面,黄芪颗粒组TNF‐α指标低于对照组[MD=‐3.36,95%CI(‐6.18~‐0.53)]、IL‐17指标低于对照组[MD=‐8.90,95%CI(‐13.61~‐4.19)]、IFN‐γ指标两组间无差异[MD=‐6.35,95%CI(‐38.06~25.36)];免疫细胞方面,黄芪颗粒组CD3~+高于对照组[MD=7.52,95%CI(2.84~12.20)],CD4~+高于对照组[MD=5.54,95%CI(4.29~6.79)],且CD4~+/CD8~+比值高于对照组[MD=0.43,95%CI(0.13~0.73)],但CD8~+指标两组间无差异[MD=‐6.03,95%CI(‐16.77~0.73)]。黄芪颗粒能有效治疗VMC,降低CK‐MB、CK、LDH、AST指标,是可供临床选择的有效药物。其可能通过降低炎性因子TNF‐α、IL‐17,升高免疫细胞CD3~+、CD4~+、CD4~+/CD8~+发挥治疗作用。
2025年01期 v.41 89-98页 [查看摘要][在线阅读][下载 2043K] [下载次数:89 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 王文思;王樱槥;方兴;王艳;郭晋源;任毅;安淑一;费思平;
为研究辽宁省水痘-带状疱疹病毒(Varicella zoster virus,VZV)gK、gH、gM、gL四种糖蛋白基因特征,应用聚合酶链(Polymerase chain reaction,PCR)方法对辽宁省2017-2020年31株VZV gK、gH、gM、gL四种糖蛋白进行全基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,分析不同位点核苷酸及氨基酸的变异情况。辽宁省31株VZV与v-Oka疫苗株(AB097932)相比,LN-VZV gK、gH、gM、gL共有16个位点发生核苷酸突变,导致氨基酸发生同义突变12处,错义突变4处。导致氨基酸发生错义突变包括:1株在4490位点发生A→G的碱基突变,导致编码氨基酸由I→T;1株在4730位点发生C→T的碱基突变,导致编码氨基酸由R→K;3株在67528位点发生A→G的碱基突变,导致编码氨基酸由I→M;1株在101579位点发生A→C的碱基突变,导致编码氨基酸由L→R。与Dumas株(X04370)相比,31株LN-VZV和v-Oka疫苗株在gL的101623-101624位点发生ATC的碱基插入,导致VZV gL内插入一个甲硫氨酸。31株LN-VZV与GenBank中各基因型VZV代表株相比核苷酸和氨基酸的同源性均大于98.10%。辽宁省VZV gK、gH、gM、gL基因序列高度保守,抗原性稳定,本研究首次对辽宁地区VZV糖蛋白序列进行测序分析,为辽宁省VZV的监测、疫苗效果评估及VZV进一步研究提供实验室依据。
2025年01期 v.41 99-106页 [查看摘要][在线阅读][下载 1597K] [下载次数:36 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 董梦洁;熊光萍;范佳欣;车如意;唐晓苹;张无敌;庞立丽;章青;孔翔羽;李希希;王宏;李丹地;
为了解2021-2022年我国5岁以下儿童中病毒性急性胃肠炎患者HAstV的分子特征及遗传进化规律。对1236份5岁以下急性胃肠炎住院或门诊患儿粪便样本采用实时荧光法筛查HAstV,在HAstV阳性样本中随机选择30例用RT-PCR法扩增并送公司测序,测序成功的HAstV序列利用生物信息学分析软件GenBank、BioAider、MEGA11.0、DNASTAR和BEAST软件对其进行基因分型、遗传进化及贝叶斯分析。2021-2022年我国HAstV阳性率为4.05%(50/1 236),测序获得24条基因序列,鉴定结果显示,HAstV-1为主要基因型(66.67%),其次为HAstV-4(20.83%),HAstV-5(8.33%)和HAstV-2(4.16%)。HAstV-1平均进化率约为6.3×10~(-4)(HPD95%2.2×10~(-4)~1.1×10-3)替换/位点/年;HAstV-4平均进化率约为7.5×10~(-4)(HPD95%4.9×10~(-4)~1.0×10~(-3))替换/位点/年。本研究显示,2021-2022年我国HAstV基因型别多样,HAstV-1和HAstV-4占比较高且进化速率低。本研究了解我国HAstV的遗传变异情况,为今后病毒防控和疫苗的研发提供一定的基础数据。
2025年01期 v.41 107-116页 [查看摘要][在线阅读][下载 2109K] [下载次数:36 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 李倩兰;赵生仓;韩志萍;李崇亥;王晓彤;周蕾;于力恒;张华一;严冬梅;范丽霞;
为了解2019-2023年青海省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成以及柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)和肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)的基因特征,本研究对青海省2019-2023年实验室确诊的2028名HFMD病例的核酸检测结果进行统计分析,利用RT-PCR方法对CVA16和EV-A71病毒毒株扩增VP1编码区并进行基因序列测定,使用MEGA、BioEdit等软件对CVA16和EV-A71进行分型与进化关系分析。结果发现,2021年开始,青海省HFMD病原构成的优势血清型别由CVA16和EV-A71转变成其他肠道病毒,在每年检出的病原体中占比均超过50.0%。对2019-2023年全省上送的CVA16及EV-A71阳性标本进行病毒分离,共收获122株CVA16毒株和36株EV-A71毒株。122株CVA16毒株均属于B1基因亚型,其中B1b亚型100株,B1a亚型22株。B1b亚型毒株VP1区的核苷酸同源性为92.8%~100%,氨基酸同源性为97.9%~100%,B1a亚型毒株VP1区的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为97.9%~100%。36株EV-A71分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,VP1区核苷酸序列同源性为95.8%~100%,氨基酸序列同源性为97.6%~100%。氨基酸置换熵值分析发现,2019-2023年青海省CVA16分离株的VP1编码区无易突变氨基酸位点;EV-A71分离株的VP1编码区存在3个高度可变的氨基酸位点为VP1-164、VP1-241和VP1-262。VP1-164位点在2021年出现N突变,并在2023年取代D成为此位点优势氨基酸;VP1-241位点上,2020年开始出现T突变,并在2021年取代S成为优势突变(94.12%),2023年此位点又完全替换为S;VP1-262位点上,2020年开始I取代V成为此位点优势氨基酸(94.12%),2023年此位点又完全替换为V。本研究揭示了2019-2023年青海省HFMD病原谱的变化情况,探究了CVA16和EV-A71的分子遗传进化特征,为青海地区制定HFMD的预防控制策略提供了理论依据。
2025年01期 v.41 117-127页 [查看摘要][在线阅读][下载 1625K] [下载次数:87 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
- 孙睿;刘子然;刘思彤;梁荣香;朱顺昕;汪照国;
阐明2018-2024年青岛地区儿童呼吸道感染人类腺病毒(Human adenoviruses,HAdVs)流行病学特征及基因特征。采用荧光RT-PCR法对2018-2024年间青岛地区儿童急性呼吸道感染病例咽拭子标本进行HAdV通用型检测,对阳性样本进行hexon基因测序,同时对2023年10月-2024年6月HAdV暴发期间部分阳性样本fiber和penton base基因进行序列测定,采用Mega 11.0软件进行系统发育及分子特征分析。2018年至2023年9月共检出HAdV阳性样本140份,阳性率4.81%(140/2909)。5岁以下婴幼儿是主要感染人群,阳性占比为74.29%(104/140)。主要流行型别为HAdV-B3型(25.81%),HAdV-C2型(22.58%),HAdV-C1型(20.43%)和HAdV-B7型(10.75%)。2023年10月至2024年6月暴发期间共检出HAdV阳性样本133例,阳性率15.52%(133/857),主要流行型别是HAdV-B3型,占比达82.71%,6-12岁儿童为主要感染人群(51.13%)。2018到2023年9月,青岛地区儿童急性呼吸道感染中HAdV主要流行型别以HAdV-B3, HAdV-C1, HAdV-C2型为主,不同年份阳性占比有所不同,5岁以下婴幼儿为主要感染人群。2023年10月至2024年6月间,HAdV-B3暴发流行,6-12岁儿童为主要感染人群。
2025年01期 v.41 128-134页 [查看摘要][在线阅读][下载 1787K] [下载次数:56 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 刘嘉婧;张万菊;崔晓青;张靖翊;房方皓;陈敏;滕峥;
为了解上海市人腺病毒B亚属(Human adenovirus species B,HAdV-B)基因序列及遗传进化特征,为人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)相关疾病防控及疫苗研发提供科学依据,本研究选取了13例2018-2024年上海市HAdV-B感染病例样本进行全基因组序列测定并获得全基因组序列,利用生物信息学软件分析基因序列特征,解析HAdV-B基因突变情况及进化规律。基于主要抗原蛋白六邻体(Hexon)、五邻体(Penton)、纤维突蛋白(Fiber)基因及全基因组的进化关系树显示,13株HAdV-B中9株为HAdV-3型,4株为HAdV-7型,HAdV-3型与HAdV-7型型别内核苷酸相似度均高达99.9%。系统发育进化树显示本研究中9株HAdV-3型上海株与国内的参考毒株聚集于同一分支;4株HAdV-7型上海株与国内流行的HAdV-7d属于同一亚分支。选取代表株进行核苷酸相似度及重组分析,其中HAdV-3型与2018年北京株(MW748657)相似度最高为99.97%,HAdV-7型与2019年广州株(MT350344)相似度最高为99.95%,代表株中均未发现有明显重组现象。应对HAdV-B的进化和变异进行持续性监测研究。
2025年01期 v.41 135-140页 [查看摘要][在线阅读][下载 1414K] [下载次数:36 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 申园园;韦雪敏;张宇涵;张新宇;李超;宋丽;赛林涛;许一菲;
本研究旨在探究2022年山东省济南市某医院大别班达病毒(Dabie bandavirus,DBV)的基因组特征和遗传变异规律。在山东省某医院采集6例疑似发热伴血小板减少综合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)患者的血样,提取DBV RNA并进行全基因组测序,将新获得的DBV序列与GenBank中山东省的DBV序列组成数据集;使用BioEdit进行同源性分析,识别氨基酸变异;IQ-TREE构建系统发育树,发掘潜在的重配毒株;RDP4和SimPlot筛选可能的重组事件;Datamonkey在线服务器分析选择压力。结果表明,新获得的6条DBV全基因组序列包含96个氨基酸突变,与GenBank中山东省DBV全基因组序列相比,其中15个是新发现的突变;四种DBV基因型(C1-C4)在山东省流行;本研究共鉴定出3种DBV重配类型和7个DBV重组事件;山东省DBV的四个基因在进化过程中均受到阴性选择压力影响。山东省DBV遗传多样性不断提高且进化机制复杂,需持续监测。
2025年01期 v.41 141-147页 [查看摘要][在线阅读][下载 1661K] [下载次数:37 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 韩倩倩;苏玢;冯勇;
为了分析淋巴细胞计数与单核细胞计数比值(Monocyte to lymphocyte ratio,LMR)、超敏C反应蛋白(Hypersensitive C-reactive protein,hs-CRP)及基质金属蛋白酶-9(Matrix Metalloproteinase 9,MMP-9)与耳带状疱疹病毒感染并发面瘫的相关性,本研究选取2019年1月至2024年1月医院收治的116例耳带状疱疹病毒感染患者,根据面瘫情况将其分为面瘫组(39例)和无面瘫组(77例)。对比两组耳带状疱疹病毒感染患者血清LMR、hs-CRP及MMP-9水平差异,采用皮尔森(Pearson)相关系数分析血清LMR、hs-CRP及MMP-9与耳带状疱疹病毒感染并发面瘫的相关性,采用受试者工作特征(Receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积评估血清LMR、hs-CRP及MMP-9对耳带状疱疹病毒感染并发面瘫的诊断效能。结果发现,与无面瘫组比较,面瘫组血清LMR表达水平明显降低,hs-CRP、MMP-9表达水平明显增加(P<0.05);Pearson相关性分析结果显示,血清LMR与耳带状疱疹病毒感染并发面瘫呈负相关(r=-0.705,P<0.05),血清hs-CRP及MMP-9与耳带状疱疹病毒感染并发面瘫呈正相关(r=0.646、0.584,均P<0.05);ROC曲线分析结果显示,血清LMR、hs-CRP与MMP-9各指标单独及联合检测耳带状疱疹病毒感染并发面瘫的相关性的AUC分别是0.937、0.883、0.874和0.983,与各指标单独检测相比,血清LMR、hs-CRP与MMP-9联合检测的AUC最高(Z=2.292、3.095、3.599,均P<0.05)。血清LMR、hs-CRP及MMP-9与耳带状疱疹病毒感染并发面瘫相关,且三者联合检测可提高对耳带状疱疹病毒感染并发面瘫的诊断效能。
2025年01期 v.41 148-154页 [查看摘要][在线阅读][下载 1255K] [下载次数:313 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 杨铭锋;岑迪;楼宏立;
为了解慈溪市腹泻患者中诺如病毒的流行病学特征及相关食品暴露风险,为预防诺如病毒的感染提供科学依据。本文采集2017-2022年慈溪市食源性疾病监测哨点医院腹泻病人相关信息,描述性统计分析诺如病毒的流行病学特征、临床症状及食品暴露风险,利用χ~2检验或Fisher精确检验分析组间差异,在2017-2022年慈溪市食源性疾病监测哨点医院共收治的2322例腹泻患者中,检出诺如病毒283例,综合检出率为12.19%。各年检出率依次为7.94%、9.55%、23.29%、13.77%、11.72%、6.72%。基因型以GⅡ型为主,占比95.41%。1~4月和10~12月检出率高于其余月份,为13.61%~36.23%。性别(χ~2=2.81,P=0.094)、年龄(χ~2=4.71,P=0.194)、地区(χ~2=1.10,P=0.294)、职业(χ~2=11.59,P=0.094)间差异无统计学意义。临床症状主要以水样便、粘液便、呕吐为主;偶见血样便、稀状便、腹痛、恶心、发热等,多见于0~6岁儿童。检出率较高的前三位暴露食品种类为多种食品、混合食品和饮料与冷冻饮品类,分别为33.33%(2/6)、19.61%(10/51)和18.42%(7/38)。可疑暴露食品的加工及包装方式包括预包装、餐饮服务业、家庭自制、散装和其他(指母乳喂养)5种,检出率分别为14.37%(118/821)、15.15%(15/99)、12.66%(79/624)、7.63%(9/118)和9.39%(62/660),差异有统计学意义(χ~2=11.71,P=0.020)。2017-2022年慈溪市诺如病毒感染以GⅡ型为主。检出率各年份存在差异,其中2019年最高。一年中呈现1~4月和10~12月两个流行高峰。人群普遍易感,需加强饮食健康宣传教育。
2025年01期 v.41 155-159页 [查看摘要][在线阅读][下载 1238K] [下载次数:70 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 李心芸;张利;曾好;
研究感染2型单纯疱疹病毒(Herpes simplex virus type 2, HSV-2)与缺血性卒中复发的相关性。采用病例对照的研究方法,对2021年1月至2023年12月本院卒中中心接收的665例急性缺血性卒中患者进行了详尽的临床数据收集。其中,284例患者接受了血清HSV-2-IgG水平的检测,并依据其3个月内是否复发分为复发组(83例)与未复发组(201例)。对这两组患者的临床数据进行对比分析,并借助Logistic回归模型,对HSV-2感染是否为卒中复发的独立预测因素进行了评估。此外,利用ROC曲线分析法,确定了血清HSV-2-IgG水平与缺血性卒中复发风险的临界阈值。复发组患者的血清HSV-2-IgG水平显著高于未复发组,差异具有统计学显著性(P<0.001)。进一步的多因素Logistic回归分析揭示,HSV-2感染是缺血性卒中复发的独立风险因素,感染HSV-2的患者在3个月内复发的风险相较于未感染者高出约5.22倍(OR=5.22, 95%CI:2.32-13.54)。此外,ROC曲线分析表明,血清HSV-2-IgG水平的阈值为43.9 g/L时,对于预测缺血性卒中复发具有较高的准确性(AUC=0.76)。本研究表明,HSV-2感染显著增加了急性缺血性卒中患者在3个月内复发的风险,且血清HSV-2-IgG浓度为43.9 g/L可作为预测缺血性卒中复发的参考指标。
2025年01期 v.41 160-165页 [查看摘要][在线阅读][下载 1221K] [下载次数:54 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 徐巧霞;易辰阳;韩雨;姚蓉;胡帅;邓明勇;杨彦伟;金梅林;康超;
本研究针对四川地区鸽棚发病的赛鸽群开展了实验室诊断和病原的分离鉴定,通过PCR对病料中的病原开展了初步的鉴定,并对鸽I型副粘病毒阳性的组织开展了病原的分离、纯化和遗传进化分析。结果表明,新城疫疫苗免疫的赛鸽群暴发了鸽I型副粘病毒、鸽圆环病毒和大肠杆菌的混合感染,死亡率可达30%。从中分离纯化了一株鸽I型副粘病毒,对鸡胚有较强的致死率,属于基因Ⅵ型2.1.1.2.2分支,LaSota免疫两次的血清能够部分中和分离的鸽I型副粘病毒的血凝活性,HI平均值为6.40 log2;鸽圆环病毒属于A分支;这两株毒与国内流行的毒株均属于同一进化分支。本研究通过临床诊断和实验室检测对赛鸽混合感染的疫情做出了综合的判定,为鸽棚养殖的疾病监测、疫苗免疫和综合防控提供了参考。
2025年01期 v.41 166-172页 [查看摘要][在线阅读][下载 1761K] [下载次数:75 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
- 曾嘉锋;续芮;陈操;
新冠病毒通过其刺突蛋白的受体结合域与人细胞血管紧张素转换酶2结合是病毒感染的重要环节。本文围绕新冠病毒刺突蛋白的受体结合域,分析了五种关注变异株的刺突蛋白受体结合域氨基酸突变对与血管紧张素转换酶2结合力的影响,探讨了新冠病毒与血管紧张素转换酶2结合的主要机制,以及受体结合域突变对“病毒-宿主”结合的影响。总结了病毒与受体结合力的传统与新兴研究方法,如生物化学、晶体学等。这些技术有助于更好地理解病毒的入侵机制,预测病毒变异的传播趋势和防控策略,最终为防控新冠疫情提供科学依据。
2025年01期 v.41 193-201页 [查看摘要][在线阅读][下载 1317K] [下载次数:120 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 叶永丽;李梓暄;刘丽娟;孙秀兰;纪剑;
病毒感染性分析是病毒类生物医药、环境监测、食品安全监管等领域的重要内容,明确病毒感染性对于病毒污染水平与传播能力分析、污染预警、降低危害和损失至关重要。近年来,除传统的空斑形成单位法、终点稀释法和病灶形成单位测定法外,结合计算机和生物信息学等学科知识及技术开发了系列高性能的感染性病毒检测新方法,包括激光力细胞学法、细胞生物传感法、间接聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction, PCR)法、无细胞荧光原位杂交法以及基于传统方法的改良技术等。这些新方法、新技术在缩短试验周期、提高检测灵敏度、准确度和特异性、可实现自动化等方面具有显著的优势。本文对病毒感染宿主细胞系的选择以及感染性病毒分析方法的原理、应用、性能等方面进行综述,以期为病毒污染防控特别是食源性病毒的监管策略制定提供参考依据。
2025年01期 v.41 202-210页 [查看摘要][在线阅读][下载 1261K] [下载次数:153 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 董豹;陈月红;冯烨;姜涛;
新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019, COVID-19)是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的全球暴发性传染病,严重危害人类的生命安全。为了遏制新型冠状病毒感染,研究学者致力于研发抗病毒药物。为快速直接评价抗新冠病毒药物的有效性,研究构建了多种新冠病毒的新型报告系统。本文综述了基于目前新冠病毒两种蛋白酶(Mpro和PLpro)切割功能的报告系统相关研究进展,及其在抗病毒药物研发中的应用。
2025年01期 v.41 211-221页 [查看摘要][在线阅读][下载 1556K] [下载次数:150 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 张心悦;吴芳;聂晶;张瑶;虞念成;唐兰芳;
呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus, RSV)感染被认为是支气管哮喘(Bronchial asthma, BA)的一个重要病因。当RSV感染机体后,固有免疫、适应性免疫、肺气道上皮活化释放炎症介质、神经通路功能障碍等都可能发展为慢性病,影响气道发育,导致气管高反应性,诱发BA。本文简要介绍RSV的结构,RSV对固有免疫、适应性免疫、免疫系统、肺气道上皮活化及神经元等途径诱发BA的免疫致病机制,为防治RSV感染诱发BA提供参考。
2025年01期 v.41 222-231页 [查看摘要][在线阅读][下载 1293K] [下载次数:641 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 曹琳;池鑫;韩峰;俞海;李少伟;
宫颈癌是全球第四大常见的女性恶性肿瘤,人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)是已知导致宫颈癌的主要病原体,特别是高危型HPV16和HPV18。HPV入胞及胞内转运过程尚存在争论。近期,研究人员发现除了经典的逆转复合体(Retromer),寻回复合体(Retriever)也参与HPV的胞内转运。本文主要综述了近十年HPV16进入宿主细胞的早期过程,概述了病毒粒子如何从细胞外基质通过黏膜上皮进入宿主细胞,并描述了内化后所经历的一系列复杂信号转导和胞内转运过程。HPV16病毒粒子首先与硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(Heparan sulfate proteoglycan,HSPG)结合,经历构象变化形成入胞复合物进入内体,经逆转复合体和寻回复合体转运至高尔基体并在有丝分裂期G2/M期入核。深入理解该病毒的宿主侵染机制及其产生的免疫反应对设计针对HPV感染相关及其导致的宫颈癌等的治疗策略具有重要的意义,本综述将为HPV治疗性疫苗设计和宫颈癌的抗病毒药物开发提供基础的病毒学信息。
2025年01期 v.41 232-244页 [查看摘要][在线阅读][下载 1585K] [下载次数:132 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 陈子玉;李慧莹;张晓光;李淑英;
高危型人乳头瘤病毒(High-risk human papillomavirus,HR-HPV)持续感染可引起宫颈上皮内瘤样病变(Cervical intraepithelial neoplasia,CIN)和宫颈癌的发生。除细胞学检查外,HPV核酸检测是WHO推荐用于宫颈癌初筛的首选方法。HR-HPV核酸检测的引入可以提高CIN2+的检出率和宫颈癌筛查方案的效率。本文旨在对目前HPV核酸检测方法进行归纳总结,为宫颈癌筛查计划提供参考。
2025年01期 v.41 245-256页 [查看摘要][在线阅读][下载 1343K] [下载次数:243 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 李维丹;石小霞;何竞月;
妊娠期糖尿病(Gestational diabetes mellitus,GDM)是一种常见的妊娠期并发症,血糖控制不佳可导致早产、新生儿窒息等不良妊娠结局。乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染是临床常见的传染性疾病,越来越多研究证实HBV可影响肝脏对糖脂的代谢与调节,降低机体免疫力,参与GDM疾病的发生与发展,导致更严重的不良妊娠结局。因此对不良妊娠结局影响因素的把控有助于管理GDM合并HBV感染的疾病进程并改善妊娠结局。本研究综述了GDM合并HBV感染孕妇不良妊娠结局的影响因素及其免疫细胞因子表达的研究成果,以期为临床防治GDM合并HBV感染提供参考价值。
2025年01期 v.41 257-263页 [查看摘要][在线阅读][下载 1232K] [下载次数:91 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ] - 邓婕;钟春如;杨怡心;张开娜;李梅正;任莉;刘攀;
HPgV-2(Human pegivirus 2)是2015年在丙型肝炎病毒感染者和有多次输血史个体中新发现的一种人源性病毒,与HPgV-1及HCV同属于黄病毒科,三者是黄病毒科肝炎病毒属和Pegivirus属内仅有的三种人源性病毒。HPgV-2感染在普通人群中很少见,且在大多数健康人群中并不存在HPgV-2病毒血症,主要传播流行于HCV/HIV合并感染及注射吸毒者等高危人群。大量证据表明,HPgV-2在流行病学上与HCV密切相关,均可在患者体内产生病毒血症且稳定增殖,最终形成慢性感染。但对于HPgV-2是否具有致病性,目前尚无定论。HPgV-2的基因组特征与HPgV-1相似,均为单股正链RNA病毒。HPgV-2作为Pegivirus属内第二种人源病毒,其核苷酸序列间同一性高达92.1%~95.9%,与邻近进化分支的啮齿动物和蝙蝠Pegiviruses的氨基酸相似性却不到32%。由于包膜蛋白抗体的出现可作为HPgV-2感染消退的指标,因此可使用E2蛋白对HPgV-2进行检测。而HPgV-2的核酸检测则通常使用其5'非翻译区(Untranslated region,UTR)和NS3区域的一段序列作为引物进行定量PCR检测。本文旨在总结HPgV-2的患病率、传播、发病机制、基因组特征及病毒检测。
2025年01期 v.41 264-270页 [查看摘要][在线阅读][下载 1442K] [下载次数:51 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]