信息

  • 《病毒学报》征稿简则

    <正>(2011年11月25日修订)《病毒学报》是病毒学专业学术刊物,创刊于1985年,国际标准刊号:ISSN1000-8721,国内统一刊号:CN 11-1865/R国内邮发代号:82-227,国外发行代号:BM6448。主管单位是中国科学技术协会,主办单位是中国微生物学会,承办单位是中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所。本刊是自然科学期刊的核心期

    2012年02期 v.28 94页 [查看摘要][在线阅读][下载 54K]
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  • 《病毒学报》来稿需注意的一些常用规范

    <正>常用斜体规范:统计学符号:根据国家标准GB3358-82《统计名词及符号》的规定,样本的算术平均数用英文小写斜体x表示,标准差用英文小写斜体s表示,t检验用英文小写斜体t表示,F检验用英文大写斜体F表示,卡方检验用希腊字母小写斜体χ2表示,相关系数用英文小写斜体r表示,自由度用希腊字母小写斜体γ表示,概率用英文大写斜体Ρ表示,样本数用英文小写斜体n

    2012年02期 v.28 194页 [查看摘要][在线阅读][下载 53K]
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论著

  • 西藏地区儿童急性呼吸道感染中呼吸道合胞病毒的初步研究

    邓洁;朱汝南;钱渊;孙宇;赵林清;王芳;吴红;扇敏娜;德吉美朵;

    本研究为了解西藏地区儿童急性呼吸道感染中呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)及基因型别。首先采用直接免疫荧光法检测2011年4~7月西藏自治区人民医院儿科病房因急性呼吸道感染住院患儿的鼻咽分泌物标本中7种常见的呼吸道病毒及人类偏肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV)的抗原。然后对RSV抗原阳性的标本分别提取RNA,用逆转录-巢式聚合酶链反应法(Nest-PCR)确定RSV型别,同时用实时荧光PCR(Real-Time PCR)方法进行验证。再通过对G蛋白基因PCR扩增产物序列测定确定RSV的基因型。通过与GenBank中不同地区RSV分离株的G蛋白基因序列比对,了解西藏地区RSV G蛋白的结构特点及变异情况。结果表明,从167例标本中检测出呼吸道病毒抗原阳性的为65例,总阳性率为38.9%(65/167),其中RSV 45例,占阳性标本的69.2%(45/65),对其中42例RSV阳性标本进行了PCR分型,其中40例为A亚型,2例为B亚型。对7株A亚型RSV G蛋白基因PCR产物测序结果显示,全部为GA2基因型。西藏RSV与RSV原型株A2株核苷酸的同源性为90.7%~91.8%,氨基酸的同源性只有86.5%~87.2%。氨基酸的变异主要集中在胞外区一个高度保守序列的两端。7株西藏A亚型RSV G蛋白的核苷酸序列与GenBank中不同的RSV分离株相比同源性为90.7%~91.8%。西藏地区2011年春季小儿急性呼吸道感染的病毒病原主要为呼吸道合胞病毒,A亚型是2011年西藏地区的流行优势型别,其G蛋白胞外区基因具有较高的变异性。

    2012年02期 v.28 97-102页 [查看摘要][在线阅读][下载 802K]
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  • 小鼠对仙台病毒Tianjin株易感性研究

    赵桂金;李梅;

    研究129Sv、DBA/2、Kunming、BALB/c四种小鼠对仙台病毒Tianjin株的感染特点,并通过观察易感性的不同,确定适于研究此病毒致病性及疫苗的小型啮齿类实验动物。用9~11d龄鸡胚接种仙台病毒Tianjin株,72h后收集尿囊腔内效价为1:1 280病毒液,用5μl和6倍稀释的30μl病毒液分别接种129Sv、DBA/2、Kunming、BALB/c小鼠,观查12d小鼠体重变化,计算生存率。用6倍稀释的30μl病毒液接种Kunming、BALB/c小鼠,于接种前第1天以及接种后第4、7天断颈处死,取左肺制成切片,HE染色观察病理改变,综合判断仙台病毒Tianjin株对四种鼠感染的易感性的不同。129Sv、DBA/2小鼠在接种仙台病毒Tianjin株5μl后,最高平均体重下降分别为13.0%、4.7%,四种鼠12d生存率均为100%;接种稀释的30μl病毒液,129Sv、DBA/2、Kunming、BALB/c最高平均体重下降21.7%、30.3%、16.7%、9.6%;12d生存率分别为20%、0%、80%、100%。Kunming鼠在感染后第4、7d的肺组织病理改变较BALB/c严重,表现为大量炎细胞渗出,粘膜下层实质性增厚。以上实验结果表明DBA/2对仙台病毒Tianjin株感染最易感,BALB/c耐受性最强,易感顺序为DBA/2>129Sv>Kunming>BALB/c。DBA/2和129Sv小鼠可作为仙台病毒Tianjin株致病性及疫苗研究的首选实验动物。

    2012年02期 v.28 103-107页 [查看摘要][在线阅读][下载 528K]
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  • 2009年云南省2株肠道病毒71型分离株全基因组序列遗传特性分析

    李华;邵聪文;潘玥;柯华昕;马绍辉;

    对2009年云南省肠道病毒71型分离株KMM09和KM186-09进行全基因组序列测序,并与我国及其它国家流行的EV71基因型进行比较和进化分析。KMM09和KM186-09基因组长为7409bp,编码2193个氨基酸,VP1系统进化分析显示2009年云南分离株属于C4基因型的C4a亚型。在结构区,与其它基因型相比较,C基因型之间的核苷酸和氨基酸的同源性高于其它基因型;而在非结构区,C4与B基因型和CA16原型株G10同源性高于其它C基因亚型。通过RDP3重组软件和blast比对分析,发现EV71C4基因型与B3基因型,与CA16原型株G10的基因组在非结构区存在重组。EV71全基因组序列的比较和分析,对了解引起我国手足口病暴发或流行C4基因亚型EV71毒株的遗传特性具有重要意义。

    2012年02期 v.28 108-113页 [查看摘要][在线阅读][下载 287K]
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  • 2010年7~12月肠道病毒B组河南株的血清学分布

    卫海燕;许玉玲;黄学勇;马宏;陈豪敏;许汴利;

    本文对河南省2010年7~12月的HFMD监测标本进行了肠道病毒B组的血清型分布研究。来自HFMD病例的阳性病毒分离物进行分子分型方法鉴定并进行VP1完整编码区核苷酸序列测定和分析。所获VP1全序与其他B组各基因型代表株和中国大陆株进行比较并构建系统发生树。共获得14株HEV-B河南株,分为E1、E6、E11、E13、E25、E30共6个血清型。VP1系统进化分析显示2010年河南HEV-B分离株与原型株亲缘关系较远,E25、E11和E6均与山东株亲缘关系最近,E1和E13均与云南株亲缘关系最近,E30与2008年河南株亲缘关系最近。E6病毒存在两种基因型的共循环现象。

    2012年02期 v.28 114-117页 [查看摘要][在线阅读][下载 368K]
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  • 柯萨奇病毒A组16型河南省分离株基因组序列分析

    黄学勇;许玉玲;卫海燕;武景福;康锴;王彦霞;陈豪敏;许汴利;

    为了解河南省手足口病患者标本中分离柯萨奇A组的16型(CoxAl6)病毒基因组特征,对2010年采集的手足口病患者临床标本406份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过10对引物分段扩增和拼接CoxAl6分离株基因组序列,利用生物信息学软件对序列分析,构建序列遗传发育树。测序获得河南省CoxAl6分离株HN1162/HN/CHN/2010基因组全长序列7 411bp,5′非编码区(5′UTR)、P1、P2、P3、3′非编码区(3′UTR)区域核苷酸序列与GenBank公布的其它分离株相似性分别为87.0%~97.9%、77.0%~95.4%、80.3%~96.9%、77.9%~96.2%、80.5%~100%;VP1区核苷酸相似性为91.4%~96.4%,氨基酸相似性为99.3%~99.7%;遗传发育树分析表明与我国深圳、广州、福建分离株处于同一分支。河南省手足口病患者标本CoxAl6病毒分离株属于C2基因亚型/B-2基因亚型,对加强该病毒变异检测,预防控制手足口病疫情具有重要意义。

    2012年02期 v.28 118-123页 [查看摘要][在线阅读][下载 343K]
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  • 2001~2011年上海市风疹病毒分子流行病学研究

    李崇山;杨玉颖;王建国;朱贞;唐伟;李智;孙晓冬;许文波;

    本研究对2001~2011年本实验室保存的血清标本检测结果为麻疹IgM阴性,风疹IgM阳性病例相对应的咽拭子标本进行风疹病毒(Rubella virus,RV)分离,用RT-PCR方法对细胞培养产物鉴定后扩增病毒E1基因,扩增产物用于核苷酸序列测定,并进行分子流行病学分析。结果表明,60份咽拭子标本共分离到31株RV,获得27株RV的739nt(nt8731~nt9469)核苷酸序列,系统同源性分析表明,27株RV分离株分别属于两个不同的基因型,除分离自2011年的11009株、11052株和11106株为2B基因型外,其他分离株均为1E基因型。27株RV分离株大部分的核苷酸突变为无义突变,氨基酸序列高度保守。24株1E基因型分离株中大部分毒株氨基酸序列完全一致,自2001年以来可能有来自同一传播链的RV在持续传播。本研究首次监测到2B基因型RV2011年开始在上海流行,经GenBank核苷酸序列比对发现,其与越南、日本、阿根廷等国家近几年的RV分离株核苷酸序列同源性达99%。由于以前对风疹的监测较少,尚不能证明其来源。

    2012年02期 v.28 124-129页 [查看摘要][在线阅读][下载 630K]
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  • 中国大陆2010年非野毒Ⅱ型脊髓灰质炎病毒基因特征分析

    蒋华芳;严冬梅;祝双利;王东艳;张勇;朱晖;安洪秋;许文波;孔晓慧;

    为维持中国无脊髓灰质炎(脊灰)状态及疫苗免疫策略的转变提供科学依据,本文对中国(不包括港澳台地区,以下同)2010年从急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测系统分离的123株非野毒Ⅱ型脊灰病毒(Po-liovirus,PV)进行基因特征分析。利用逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增VP1编码区,并对扩增产物进行序列测定,测序结果经Sequencher 4.8、BioEdit 7.0.9和MEGA 5.0软件分析。结果显示2010年未发现脊灰野病毒(Wild poliovirus,WPV)。65株PV在VP1编码区nt2 909发生突变,同时该位点又是已知的神经毒力决定位点。从云南省分离到2株疫苗衍生脊灰病毒(Vaccine-derived poliovirus,VDPVs),经流行病学和实验室检测结果分析表明,这2株都不同于以往发现的VDPVs,是新发现的VDPVs。建议加强全国AFP病例的流行病学和实验室监测和检测,为及时发现VDPVs传播和WPV的输入性暴发提供科学依据。

    2012年02期 v.28 130-135页 [查看摘要][在线阅读][下载 323K]
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  • 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒TJ株致弱过程中遗传变异和致病性分析

    冷雪;李真光;李西玉;王凤雪;张秀华;武华;

    为了研制高致病性猪繁殖与呼吸综合征(HP-PRRS)弱毒疫苗,将高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)TJ株进行了致弱驯化,在Marc-145细胞上对其进行了连续传代,每5~10代进行噬斑克隆纯化病毒。对致弱过程中不同代次病毒进行遗传变异及致病性分析。结果表明,TJ株在致弱过程中各基因均存在不同程度的变异,至第140代,共有58个氨基酸发生突变,同时在非结构蛋白nsp2区域,在不连续的30个氨基酸缺失(481位和533~561位)之后又出现连续120个氨基酸的缺失,与VR-2332相比,该缺失位点位于推定氨基酸序列的628~747位。动物接种试验结果表明,TJ株经Marc-145细胞传至第20代时,病毒对猪的致病性明显减弱,推测TJ株在这一传代过程中非结构蛋白nsp2-nsp5、nsp7和结构蛋白GP5所发生的遗传变异对病毒毒力致弱起到一定作用。

    2012年02期 v.28 136-142页 [查看摘要][在线阅读][下载 274K]
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  • 三株新城疫病毒强毒株的生物学特性及全基因组序列分析

    杨少华;胡北侠;许传田;颜世敢;张琳;黄艳艳;张秀美;

    2009~2011年从北方发病鸡群和鸭群中分离出3株新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)。通过致病性指数测定及交叉血凝抑制试验初步分析了3个毒株的毒力和相互之间的同源性。选取鸡源分离株SDLY01与新城疫疫苗株(LaSota)进行了交叉保护试验,选取鸭源毒株SD03对樱桃谷鸭进行攻毒实验,同时设计引物对3个毒株进行了全基因组测序,并与36株NDV参考株进行了分子进化分析。结果表明3个分离株F蛋白裂解位点的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117符合强毒株的序列特征,并与致病性指数测定结果相符。交叉血凝抑制试验发现3个分离株与疫苗株LaSota的抗原同源性较低为82.5%~89.4%,两个鸡源分离株间的抗原同源性为90%,而鸭源毒株SD03与鸡源毒株SDSG01同源性为100%。交叉保护试验和攻毒实验结果显示传统的LaSota疫苗能对SDLY01流行株提供100%免疫保护,但第5天仍检测到排毒;鸭源毒株SD03对樱桃谷鸭不致病,但能检出排毒,排毒期最长为5d。全基因组测序与分析表明3个毒株基因组长度均为15 192bp,属于基因Ⅶd型毒株,与同期流行的鹅源及鸭源NDV毒株之间全基因组核苷酸序列具有高度的同源性,揭示鸭源、鹅源NDV与鸡源NDV在遗传学和流行病学上密切相关。

    2012年02期 v.28 143-150页 [查看摘要][在线阅读][下载 341K]
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  • HIV-1辅助蛋白Vpr多肽抗体的制备与鉴定

    孙俊;孟哲峰;徐建青;张晓燕;吕建新;

    预测Vpr蛋白的B细胞抗原表位,并利用合成的B细胞表位肽制备Vpr特异性抗体。应用生物信息学技术获得Vpr蛋白共享氨基酸序列并预测其潜在B细胞抗原表位,与载体蛋白血蓝蛋白(KLH)偶联合成多肽并免疫家兔,鉴定及纯化获得的多肽特异性抗体。软件预测显示,Vpr蛋白N端的第3~19位(N)和C端的第82~95位(C)氨基酸序列为潜在B细胞抗原表位;ELISA检测抗血清中多肽特异性抗体的效价都达到1:105以上;Western-Blotting结果显示,无论对HIV-1B亚型还是CRF07_BC重组型的Vpr蛋白,其多肽N抗体和C抗体均能特异性识别;免疫沉淀结果显示,Vpr多肽N和C抗体也能特异性结合未变性的野生型Vpr或GFP-Vpr融合蛋白。利用生物信息学技术能成功预测Vpr蛋白B细胞抗原表位,免疫所获得的抗体具有较好的特异性和应用性。

    2012年02期 v.28 151-157页 [查看摘要][在线阅读][下载 435K]
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  • 鸭源H9N2 AIV血凝素基因序列比较

    万春和;傅光华;程龙飞;施少华;陈红梅;彭春香;林芳;林建生;黄瑜;

    为明确国内外鸭源H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素基因(hemagglutinin,HA)的遗传进化关系、血凝素蛋白裂解位点的氨基酸结构特征和血凝素蛋白受体结合位点的氨基酸变异特征,本研究选取GenBank中登录鸭源H9N2亚型AIV HA基因,通过MEGA4.1进行比对和分析,并绘制其遗传进化树。结果表明,鸭源H9N2亚型AIV在遗传进化上分为2大谱系:即Ck-Bj-1-94-like和North-Ame-like,中国大陆鸭源H9N2亚型AIV和亚欧美其它国家鸭源H9N2亚型AIV在遗传进化上分居完全不同的谱系,相互之间遗传进化关系较远。从血凝素受体结合位点看,亚欧美国家鸭源H9N2亚型AIV在第183、190和226位点的氨基酸均为鸭源AIV经典H、E和Q,且高度保守。但中国大陆地区H9N2亚型AIV第183位为N;第190位为A or V or T,与中国大陆鸡源H9N2亚型AIV一致;第226位中国鸭源H9N2亚型AIV有相当一部分为L,且近年福建省H9N2亚型AIV分离株在此处均为L。提示我们,中国大陆地区H9N2亚型AIV鸭鸡和鸡鸭相互交叉感染较为普遍。

    2012年02期 v.28 158-164页 [查看摘要][在线阅读][下载 402K]
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  • 基于颜色判定的逆转录环介导等温扩增技术检测GII型诺如病毒基因

    罗剑鸣;吴希阳;徐子乾;罗乐;聂凯;杨梦婕;曾亚岚;段招军;马学军;

    建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的逆转录环介导等温扩增(Reverse transcription loop-mediatedisothermal amplification,RT-LAMP)方法应用于GII型诺如病毒基因检测。针对诺如病毒RNA依赖的RNA聚合酶和衣壳蛋白基因序列(RNA-dependant RNA polymerase and capsid protein gene)设计出6条特异引物,在等温条件下(65℃)进行扩增反应60min。在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为反应指示剂,以其颜色变化作为结果判断标准,并经琼脂糖凝胶电泳验证。本文利用此技术对不同腹泻病毒进行了特异性分析,对体外转录的GII型诺如病毒RNA的梯度稀释进行了灵敏度分析,同时与逆转录PCR(RT-PCR)方法进行比较,并对93份腹泻患者粪便中的病毒核酸进行了检测。结果显示,本研究建立的RT-LAMP方法特异性高,灵敏度达到1 000拷贝/μLRNA分子水平,与常规检测RT-PCR方法相当。对临床标本的阳性检出率也与常规RT-PCR相当。由于此方法特异性强,灵敏度较高,耗时短,结果直观,因此有望用于GII型诺如病毒的现场快速检测。

    2012年02期 v.28 165-171页 [查看摘要][在线阅读][下载 329K]
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  • AcMNPV肌动蛋白核定位基因的亚细胞定位

    王倩;陈继征;王云;王学军;陈新文;

    当前细胞核内肌动蛋白的功能是一个研究热点,核内存在肌动蛋白并参与细胞核内发生的许多生命活动。杆状病毒是迄今唯一报道的利用核内肌动蛋白进行复制增殖的病原微生物,为核内肌动蛋白的结构与功能的研究提供了独特的系统。有报道显示AcMNPV的ie-1,pe38,ac4,he65,ac102和ac152基因与肌动蛋白单体的核转运有关,然而关于这六个基因的亚细胞定位及其在肌动蛋白入核过程中的功能并没有深入的研究。本文首次揭示了这六个基因的亚细胞定位,IE1和AC152是全细胞分布,PE38和AC102也为核质分布,但主要分布在细胞核中,而AC4和HE65定位于细胞质。但AC102和IE1可以分别介导AC4和HE65入核。同时我们发现当使用外源强启动子OpIE2,在转染ie-1或pe38之后表达ac4和he65可以部分招募肌动蛋白单体入核,而时序性共转染这四个基因则可招募最多肌动蛋白单体入核。对肌动蛋白核定位基因在细胞中的定位分析为进一步了解杆状病毒介导肌动蛋白入核的分子机理提供支持。

    2012年02期 v.28 172-177页 [查看摘要][在线阅读][下载 324K]
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  • J亚群禽白血病病毒跨膜蛋白gp37基因克隆与表达

    王晓伟;刘青;徐晴晴;蔡黎明;王真真;王桂花;成子强;

    禽白血病病毒(ALV)跨膜蛋白(TM)在病毒-细胞融合过程中起关键作用,其蛋白内部存在的许多高度保守序列有可能成为抗病毒的重要靶点。对TM结构和功能的深入研究将为抗禽白血病病毒乃至其它反转录病毒相关制剂的研制提供科学的理论基础。本研究通过PCR从本实验室分离的ALV-J山东汶上毒株获得表达TM的gp37基因,克隆连接pMD18-T载体并测序,从已构建的质粒pMD18-T-gp37中酶切回收gp37基因,构建重组转移载体pFastBacHTb-gp37。利用昆虫杆状病毒表达系统对gp37基因进行表达,通过间接免疫荧光和Western blot检测gp37基因表达产物,间接免疫荧光显示,重组杆状病毒感染的sf9细胞呈现明显的强阳性反应;Western blot分析,重组病毒感染的sf9细胞蛋白显示出约21kD的阳性条带。结果表明,gp37基因在sf9细胞内表达成功。

    2012年02期 v.28 178-184页 [查看摘要][在线阅读][下载 331K]
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综述

  • COPI相关蛋白在病毒复制中作用的研究进展

    杨广博;张磊亮;

    COPI主要负责从高尔基体到内质网的蛋白囊泡运输。许多病毒包括RNA病毒和DNA病毒以及反转录病毒会劫持或借助COPI通路和(或)COPI相关蛋白如coatomer,ARF1和GBF1以利于其自身生命活动。本文就COPI相关蛋白在病毒复制中的作用的最新进展进行综述。

    2012年02期 v.28 185-189页 [查看摘要][在线阅读][下载 122K]
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  • 猪博卡病毒的研究进展

    翟少伦;陈胜男;魏文康;

    猪博卡病毒是细小病毒科细小病毒亚科博卡病毒属的新成员,2009年发现于患仔猪断奶后多系统衰竭综合征的瑞典猪群中。目前,猪博卡病毒作为新发现的病原,已是世界各国科研人员的研究热点。本文结合已发表的文献,对猪博卡病毒的发现、分类、基因组结构与复制、流行病学、与疾病的相关性、培养与检测等方面进行了阐述,为广大科研人员对猪博卡病毒的研究提供一定的理论依据。

    2012年02期 v.28 190-193页 [查看摘要][在线阅读][下载 114K]
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