人类病毒研究论著

  • 甲型流感病毒H1N1血凝素茎部亚单位疫苗与不同佐剂组合在小鼠中诱导的免疫应答与保护

    王瑭琪;韩瑞雯;程雪婷;邴佳洛;李佳;孙树才;郭俊佳;翟程程;郭晓炎;王东红;王文玲;周剑芳;邓瑶;谭文杰;

    通过真核表达系统表达并纯化流感病毒H1N1血凝素(Haemagglutinin,HA)茎部,将其与不同佐剂联合免疫小鼠,评价其免疫原性及攻毒保护效果。本研究以密码子优化且结构修饰的甲型流感病毒A/Brisbane/59/2007(H1N1)的HA茎部为目的基因构建真核表达质粒pcDNA3.1‐MiniHA(H1),转染HEK‐293T细胞,通过镍离子亲和层析柱纯化Mini‐HA。将Mini‐HA分别与Al(OH)_3、Al(OH)_3+CPG ODN、AddaS03?三种佐剂联合免疫小鼠,通过ELISA、ELISPOT和细胞内因子染色进行体液与细胞免疫检测,以H1N1‐PR8进行攻毒保护试验,监测小鼠存活率、体重变化、肺病毒载量以及肺组织病理变化,评估其保护效果。结果显示,Mini‐HA表达形成三聚体结构,Mini‐HA各组初次免疫后即可检测到针对HA茎部及全长HA的特异性IgG,加强免疫后抗体滴度显著增高;Mini‐HA联合Al(OH)_3+CPG ODN佐剂可以刺激Th1型细胞因子分泌,联合AddaS03?佐剂可以刺激Th1/Th2型细胞因子分泌;攻毒保护试验中,Mini‐HA联合Al(OH)_3+CPG ODN或AddaS03?佐剂组小鼠存活率达100%,体重下降低于5%,其中Mini‐HA联合AddaS03?佐剂组肺组织结构完整,仅见小部分肺泡腔代偿性扩张以及少量淋巴细胞浸润。本研究成功纯化了HA茎部蛋白Mini‐HA,联合佐剂免疫小鼠具有良好的免疫原性,以AddaS03?佐剂效果最好,可以诱导产生特异性体液与细胞免疫应答,保护小鼠抵御H1N1‐PR8流感病毒的攻击,有效抑制病毒复制、减少肺组织病理损伤。

    2024年01期 v.40 1-12页 [查看摘要][在线阅读][下载 2717K]
    [下载次数:160 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 急性呼吸道感染病例中人冠状病毒229E感染情况及病毒基因特征分析

    李丰辰;蒋豪然;夏百成;马洪滨;朱汝南;许晶;黄艳智;郜振国;胡孔新;李岩;向星宇;吴巨龙;许红梅;张凤;王文慧;张燕;崔爱利;

    为阐明我国全人群急性呼吸道感染(Acute respiratory infection,ARI)病例中人冠状病毒229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)感染情况及病毒基因特征,本研究对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例进行描述性流行病学分析,同时对HCoV-229E阳性病例的临床标本进行S基因扩增和测序,阳性序列用于病毒系统发育和进化分析。本研究中共检测出316例HCoV阳性病例,其中38例为HCoV-229E阳性。HCoV-229E检出率在不同季节中差异无统计学意义(χ~2=2.345,P=0.504);男性检出率高于女性(χ~2=4.546,P<0.05);不同年龄组中,除了5~17岁青少年组未检测到HCoV-229E,其他年龄组间HCoV-229E检出率差异无统计学意义(χ~2=1.927,P=0.588)。在38例HCoV-229E阳性病例中有23例(60.53%)为混合感染病例,和HCoV-229E单一感染病例相比,包括肺炎病例在内的下呼吸道感染病例在混合感染病例中比例增高。本研究共获得9条2019-2021年HCoV-229E刺突蛋白(Spike protein,S)基因序列,结合从GenBank中下载的90条HCoV-229E S基因代表性序列共同构建系统发育树。结果表明,全球HCoV-229E序列可划分为Genogroup1~6共6个组,具有明显的时间聚集性。Genogroup 6是目前全球流行的主要优势谱系,位于HCoV-229E系统发育树的末端。本研究所获得的9条HCoV-229E序列均隶属于Genogroup 6,但位于不同分支。S基因分子进化速率约为7.32×10~(-4)替换/位点/年,S蛋白处于负向选择压力下(ω<1),但仍有个别正向选择位点存在,S蛋白多个位点上发生氨基酸突变和N-糖基化位点突变,其中部分突变发生在S蛋白受体结合结构域的3个受体结合环中。本研究通过开展中国大陆部分地区ARI病例中HCoV-229E感染情况和病毒基因特征分析,阐述了我国HCoV-229E流行病学特征和病毒分子进化特点,为我国HCoV-229E感染的控制与预防提供基线数据。

    2024年01期 v.40 13-26页 [查看摘要][在线阅读][下载 1446K]
    [下载次数:79 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 中国中南部G8P[8]型A组轮状病毒全基因组遗传特征研究

    熊光萍;田毅;范佳欣;唐晓苹;董梦洁;车如意;李伟红;唐梅荣;周珺;刘颂;王铭月;李丹地;段招军;

    G8基因型轮状病毒已在我国出现并迅速增加。本研究拟对采集于中国中南部5岁以下急性胃肠炎患儿的7例G8P[8]型RVA毒株进行全基因组分子特征分析。对轮状病毒特异性扩增结合高通量测序方法对中国中南部14株G8P[8]型RVA毒株进行全基因组测序。利用MEGA11.0、Geneious Prime、Geneious9.0.2和DNASTAR软件对RVA毒株进行全序列及遗传变异和进化分析。7株G8P[8]型RVA的基因分型为G8-P[8]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E1-H2,显示为DS-1样基因型。系统进化树结果显示,本研究中国中南部7株G8P[8]分为两大谱系G8-I(13株)和谱系G8-Ⅱ(1株),VP7的最大分支可信度(MCC)树表明,G8的平均进化率估计为1.4×10-3替换/位点/年。G8P[8]基因型RVA在我国包括两个谱系,从该病毒在中国的出现到该病毒在中国的流行传播将经过1~2年,持续的全国RVA监测至关重要。

    2024年01期 v.40 27-37页 [查看摘要][在线阅读][下载 1678K]
    [下载次数:48 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 朊病毒感染的仓鼠脑组织中NLRP3介导的炎症反应机制的初步探索

    周冬花;武月章;王远;梁冬林;肖康;董小平;石琦;

    神经炎症主要由活化的胶质细胞介导,是大多数神经退行性疾病的共同特征。为了探究朊病毒感染后的大脑神经炎症反应与核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NOD-like receptor protein 3, NLRP3)炎症小体形成是否相关,本研究以朊病毒感染的仓鼠脑组织为研究对象,通过Western blot、免疫组织荧光方法检测了脑组织中NLRP3的生成和分布;同时借助免疫共沉淀方法检测了NLRP3炎症小体的形成情况。结果显示:朊病毒感染后,仓鼠脑组织中大脑皮层和海马区NLRP3的合成均明显增加,海马区的含量明显高于大脑皮层;NLRP3与星形胶质细胞存在明显共定位的现象,与小胶质细胞及神经元细胞几乎不存在共定位;感染后的仓鼠脑组织中炎症小体的另外两种组成成分半胱氨酸蛋白酶前体(Procaspase1,proCas1)和凋亡相关颗粒样蛋白(Apoptosis-associated granuloid proteins, ASC)也明显高于正常仓鼠。这些结果表明:朊病毒感染后,仓鼠脑组织中NLRP3及炎症小体合成明显增多,NLRP3炎症小体的组装主要发生在星形胶质细胞中。

    2024年01期 v.40 38-44页 [查看摘要][在线阅读][下载 2831K]
    [下载次数:61 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 雾化吸入给药BD-77对呼吸道合胞病毒感染及LPS致小鼠肺炎的治疗作用

    孙静;赵荣华;孙建辉;郭姗姗;高双荣;包蕾;耿子涵;李舒冉;孙绮悦;徐洲;潘玉杰;陈运琴;孙田甜;陈红羽;黄成钢;崔晓兰;

    评价BD‐77雾化吸入给药对呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)及脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)致小鼠肺炎的治疗作用,为BD‐77的进一步开发提供实验依据。建立RSV及LPS滴鼻感染致小鼠肺炎模型,采用肺指数、肺指数抑制率、病毒载量、肺组织炎症因子等指标评价BD‐77的药理作用。BD‐77雾化吸入给药75 mg·mL~(‐1)、37.5 mg·mL~(‐1)两个剂量组可显著降低RSV感染小鼠肺指数、病毒载量和炎症因子释放。BD‐77静脉注射150 mg/(kg·d)、75 mg/(kg·d)两个剂量组对LPS引起的小鼠肺炎具有保护作用。BD‐77对RSV及LPS致小鼠肺炎均具有显著的保护作用。

    2024年01期 v.40 45-50页 [查看摘要][在线阅读][下载 1137K]
    [下载次数:171 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 小檗碱通过铁死亡途径的对RSV感染小鼠病毒载量及肺部炎症反应的调节作用

    高莹;邢军;苗红;

    为了基于核因子E2相关因子2(Nuclear factor E2 related factor 2, Nrf2)-谷胱甘肽过氧化物酶4(Glutathione peroxidase 4,Gpx4)通路介导的铁死亡途径,探讨小檗碱对呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)诱导的肺炎小鼠模型体内病毒载量和肺部炎症反应的影响及其作用机制,本研究利用雄性BALB/c幼龄小鼠建立RSV诱导的肺炎动物模型,并随机分为空白组、模型组、低浓度小檗碱组(30mg/kg)、中浓度小檗碱组(45mg/kg)、高浓度小檗碱组(60mg/kg)和阳性药(利巴韦林)组,每组10只。除空白组外,均采用RSV滴鼻的方法制备肺炎小鼠模型,造模后各组分别予相应的药物干预,空白组和模型组给予生理盐水。给药4d后处死小鼠,摘取肺组织并称重计算肺指数;RT-PCR检测肺组织核因子E2相关因子2(Nuclear factor E2 related factor 2,Nrf2)、谷胱甘肽过氧化物酶4(Glutathione Peroxidase 4,Gpx4)和RSV-F的mRNA表达水平;Western blot法检测肺组织Nrf2和Gpx4蛋白表达水平;ELISA法检测肺泡灌洗液中白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)和肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平;HE染色观察小鼠肺组织病理变化。实验数据显示,与空白组相比,模型组肺指数升高,肺部Nrf2、Gpx4的mRNA表达水平降低、RSV-F的mRNA表达水平升高,肺部Nrf2和Gpx4的蛋白表达水平降低,肺泡灌洗液中IL-6、TNF-α的含量升高,数据均具有统计学意义(P<0.05),且模型组小鼠肺组织明显充血,并伴有大量炎症性细胞浸润;与模型组相比,低、中、高浓度小檗碱组肺指数均下降,肺部Nrf2、Gpx4的mRNA表达水平均降低、肺部Nrf2和Gpx4的蛋白表达水平均降低,肺泡灌洗液中IL-6、TNF-α的含量均升高,且小鼠肺组织病理损伤得到不同程度改善;与阳性药组相比,高浓度小檗碱组肺指数、肺部Nrf2和Gpx4的mRNA表达水平及蛋白表达水平、肺泡灌洗液中IL-6和TNF-α的含量都无显著差异。根据以上实验结果,推测小檗碱可以通过铁死亡途径发挥抗RSV病毒和减轻肺部炎症的作用,其主要作用机制涉及到上调Nrf2和Gpx4基因的表达水平,以及下调IL-6、TNF-α等炎症因子的表达水平,降低肺部RSV病毒载量。

    2024年01期 v.40 51-57页 [查看摘要][在线阅读][下载 1359K]
    [下载次数:159 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 巨细胞病毒感染通过p38MAPK途径对冠状动脉内皮细胞的损伤作用

    李玲;梁霄;杨茂;蒲盛蓝;

    巨细胞病毒(Cytomegalovirus,CMV)感染、冠状动脉内皮细胞(Human coronary artery endothelial cells,HCAEC)损伤与冠状动脉粥样硬化心脏病发生相关。CMV感染可引起细胞损伤及p38MAPK磷酸化,但对HCAEC的损伤作用及机制尚不明确。因此,为研究CMV通过p38MAPK途径对HCAEC的损伤作用,本研究培养HCAEC并分组,对照组用不含病毒及药物的培养基处理,CMV组感染HCMV AD169病毒株,SB203580组用30μmol/Lp38MAPK抑制剂SB203580处理,CMV+SB203580组感染HCMVAD169病毒株并用30μmol/L SB203580处理。检测细胞活力,凋亡率,乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)、丙二醛(Malondialdehyde,MDA)、超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)、总抗氧化力(Total antioxidant capacity,T-AOC)、白介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)、细胞间黏附分子-1(Intercellular cell adhesion molecule-1,ICAM-1)、肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor-α,TNF-α)含量,p-p38MAPK、裂解型caspase-3(cleaved caspase-3)表达水平。结果显示,与对照组比较,CMV组的细胞活力、SOD、T-AOC含量降低,凋亡率、LDH、MDA、IL-1β、ICAM-1、TNF-α含量、p-p38MAPK、cleaved caspase-3表达水平增加(P<0.05),SB203580组的p-p38MAPK表达水平降低(P<0.05),其与指标无统计学差异(P>0.05);与CMV组比较,CMV+SB203580组的细胞活力、SOD、T-AOC含量增加,凋亡率、LDH、MDA、IL-1β、ICAM-1、TNF-α含量、p-p38MAPK、cleaved caspase-3表达水平降低(P<0.05)。以上结果表明CMV感染引起HCAEC损伤及凋亡、氧化应激反应、炎症反应激活,这一作用与促进p38MAPK磷酸化有关。

    2024年01期 v.40 58-64页 [查看摘要][在线阅读][下载 1230K]
    [下载次数:69 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 新型冠状病毒感染与2型糖尿病共病联系的生物信息学分析

    黄泰;于琦;穆俊芳;刘格良;薛丹阳;陈浩然;常敏静;贺培风;

    本文基于转录组数据研究了新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019,COVID-19)和2型糖尿病(Type 2diabetes,T2D)的相互作用机制,寻找疾病的潜在功能模块,为其治疗提供新思路。本文收集了来自GEO(Gene expression omnibus)数据库的10个COVID-19和T2D基因表达谱数据集,并按照4:6的比例分为训练集和验证集,并进行差异表达基因(Differential expression genes,DEGs)的富集分析和构建蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络进行模块化分析,找到了与COVID-19和T2D最紧密相关的关键基因和蛋白质特征模块。基于各组织的DEGs交集结果,本文发现43个共有DEGs,并确定了5个关键基因(HSP90AA1、SRC、EGFR、MAPK3、CDK1),其中CDK1表现出最高的网络连接性。通过XGBoost等6种机器学习算法进行性能检验显示了关键基因对诊断COVID-19和T2D的潜在价值,并通过qPCR实验证实了关键基因在COVID-19患者和正常对照组PBMC中的表达差异。此外,本文基于模块划分算法得到了PPI网络的6个潜在功能模块,这些模块主要与糖类、脂类代谢和细胞复制相关联。最后,本文建立了miRNA-TF-mRNA调控网络,并筛选出TP53和NFIC作为调节共有基因转录的枢纽转录因子(Transcription factor,TF)。总之,本文分析了COVID-19和T2D之间共有的表达特征、生物学通路和调控因子,并探索了基因在转录和翻译中的复杂相互作用,为未来COVID-19和T2D的治疗提供了新思路。

    2024年01期 v.40 65-79页 [查看摘要][在线阅读][下载 1916K]
    [下载次数:193 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 广西桂林市急性呼吸道感染住院儿童人博卡病毒流行特征及基因特征分析

    朱人和;王璐璐;程迁;宫悦;宗可鑫;宋娟;宋芹芹;梅国勇;夏志强;韩俊;高晨;

    本研究旨在分析广西壮族自治区桂林市急性呼吸道感染住院儿童病例中人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)的流行特征及病毒基因特征。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对2021年9月至2022年10月收集的638名因急性呼吸道感染住院儿童的鼻咽拭子样本进行了15种常见呼吸道病毒的检测。对HBoV核酸阳性的样本进行VP1基因巢式PCR扩增和序列测定,并与不同国家和地区HBoV1的VP1序列进行病毒基因特征分析。结果表明,在638例ARI病例样本中,有50例(7.84%)为HBoV阳性,96%(48/50)HBoV阳性病例均为5岁以下的儿童,其中以1~2岁患儿的占比最高(40%,20/50)。HBoV阳性病例主要集中在夏、秋、冬3个季节,但三者间差异无统计学意义(P>0.05)。在50例HBoV阳性病例中有29例(58.00%)为混合感染病例,HBoV的单一感染和混合感染均可引起上呼吸道或下呼吸道感染,但差异无统计学意义(P>0.05)。本研究所获得的16条HBoV序列均属于HBoV1,Ⅰa和Ⅰc分支中各分布有1条,其余14条均属于Ⅰb分支。HBoV是2021-2022年桂林地区导致儿童,尤其是2岁以下的婴幼儿呼吸道感染住院的主要病原体之一,存在Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc三种型别共同流行的特点,其中Ⅰb分支为2021-2022年广西桂林市HBoV的主要优势流行株。

    2024年01期 v.40 80-87页 [查看摘要][在线阅读][下载 1279K]
    [下载次数:60 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:1 ]
  • 徐州市本土新冠病毒流行趋势及基因组特征分析

    魏丹;杜阳光;杜昱;邢菲菲;冯欢欢;童晶;

    为了解徐州市新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的型别流行趋势,从基因组水平分析其分子学特征及氨基酸突变差异,本文选取了徐州市2023年1-5月共117份本土COVID-19患者标本进行全基因组测序。测序标本中“≥80”年龄组患者所占比例最高,男性患病比例总体高于女性,患病群体呈现年轻化趋势。将测序结果上传Pangolin和Nextclade网站得到病毒型别及变异位点信息。测序分型均为奥密克戎变异株:BA.5.2及其亚分支30株,BF.7及其亚分支58株,XBB及其亚分支29株。BF.7及其亚分支为1-3月徐州市主导流行株,XBB及其亚分支为4-5月徐州市主导流行株。17株不同型别的SARS-CoV-2共检测到125处氨基酸突变位点,S蛋白区氨基酸突变位点数量最多(52处)。XBB及其亚分支与其它分支比较,存在着3处不同方向的氨基酸突变,13处独有氨基酸突变,7处氨基酸突变缺失。系统进化树显示:BA.5.2及其亚分支、BF.7.14及其亚分支、XBB及其亚分支分成了三簇,与Pangolin网站分型结果基本吻合。使用高通量测序技术对SARS-CoV-2进行追踪溯源及分子特征分析,对徐州市疫情研判、防疫政策的制定和变异株的监测意义重大。

    2024年01期 v.40 88-96页 [查看摘要][在线阅读][下载 2861K]
    [下载次数:84 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 泉州市2022-2023年新冠病毒Omicron变异株基因组特征及S蛋白突变位点动态分析

    陈晓玲;郑丹凤;龚彩婷;陈韵妍;郑友限;林满芳;陈霖霖;王伟明;

    本研究旨在了解泉州市新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)流行株的基因型别分布及全基因组特征,动态研究S蛋白关键结构域的突变规律。采用纳米孔测序获取2022年3月至2023年6月泉州市新冠病毒监测病例毒株的全基因组序列,对数据过滤后的641条优质序列进行基因型别鉴定、序列比对及突变位点统计,通过聚类热图动态分析S蛋白关键结构域的氨基酸突变规律,借助VarEPS系统完成变异对病毒传播和适应性影响评估。监测期间泉州地区流行株均为Omicron变异株,总体呈BA.2-BA.5-XBB谱系顺序更替,与同期全国流行趋势基本一致;核苷酸与氨基酸突变位点数分别为81个(79~84个)、57个(55~62个)且逐步增加;S蛋白RBM区有氨基酸变异更替现象,如G446V到G446S、T478K到T478R/N、F486I/V到F486S/P;近期在非BA.2.75流行期间频繁检出BA.2.75于NTD区的高频突变位点,如W152R、F157L、I210V且有上升趋势;不同时期在Furin裂解点或S2亚基区可检出不同的氨基酸突变,与同期流行株基因型别更替相关。这些氨基酸突变均可一定程度上降低S蛋白与中和抗体的稳定性,但对其与ACE2的结合状态改变不大,多为中性突变。从基因层面开展新冠病毒变异动态监测,可以帮助我们掌握区域基因型别特征及病毒变异进化规律,探索变异对病毒传播和适应性影响,及时预警关键变异。

    2024年01期 v.40 97-105页 [查看摘要][在线阅读][下载 1498K]
    [下载次数:79 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 2020-2022年深圳地区柯萨奇病毒A6的流行病学与分子特征分析

    黄小丽;陈龙;姚相杰;孟君;周莎;刘婉秋;张玉萍;何雅青;胡贵方;

    了解COVID-19流行期间(2020-2022年)深圳地区手足口病(Hand,food and mouth disease,HFMD)优势病原体柯萨奇病毒A6(Coxackieviurs A6, CVA6)的流行情况以及其VP1区的分子特征,为有效预防HFMD提供科学依据。2020-2022年深圳市疾病预防控制中心收集手足口病哨点监测病例样本共1 733份。采用实时荧光RT-PCR方法对标本进行肠道病毒核酸检测。随机挑选分布于不同月份经RT-PCR判定为CVA6阳性的样本共108例进行VP1全长基因序列扩增和测序。使用生物信息学软件对CVA6进行分子系统发育与氨基酸变异分析。1 733份手足口病病例标本中,检出EV阳性1 627份,总检出率为94.65%(1627/1733);检出CVA6阳性1 042份,CVA6检出率为60.13%(1 042/1 733)。2020-2022年各年度HFMD主要病原体均为CVA6,各年的检出率分别为84.62%(341/403)、46.70%(382/818)和62.30%(319/512)。基于VP1序列的分子系统发育分析表明,2020-2022深圳地区测定的77株CVA6毒株均属于D3a基因型,但处在两个明显不同的进化分支,两个不同进化分支的CVA6毒株之间存在L15P和V173I两个氨基酸差异位点。77株CVA6毒株之间,核苷酸相似性和氨基酸相似性分别为91.8%~100%和97.2%~100%,其VP1氨基酸序列出现了19个(7.20%, 19/264)氨基酸多态位点。CVA6是2020-2022年深圳市引起HFMD的主要病原体,在2020年是绝对优势型别。深圳地区流行的CVA6仍然是我国大陆地区主流基因亚型D3a,但是表现出了一定的遗传多样性。

    2024年01期 v.40 106-114页 [查看摘要][在线阅读][下载 1482K]
    [下载次数:178 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]

短篇论著

  • 广西地区凡纳滨对虾白斑综合征病毒同源重复区基因的比较分析

    童桂香;谭红连;杨明伟;陈福艳;吴铁军;黄婷;李莉萍;雷爱莹;韦信贤;

    为了解广西地区对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus, WSSV)分子变异特征,选取2010-2019年采自广西沿海地区的120份WSSV阳性凡纳滨对虾(Litopenarus vannamei)样品,进行同源重复区ORF75、ORF94和ORF125基因的扩增和测序,并比较分析其重复单元变化差异(Variable number of tandem repeats, VNTR)及单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs)。结果显示,ORF75的重复单元(Repeat units, RUs)是45bp(RUs-45 bp)和102 bp(RUs-102 bp),RUs数目存在3、4、6、7、8、9类型,最多的是6 RUs型;ORF94的RUs是54bp(RUs-54 bp),RUs数目有0、1、2、3、4、6、8、9、11、12类型,最多的是2 RUs型;ORF125的RUs前两个是72 bp(RUs-72 bp),第3个之后的RUs为69 bp(RUs-69 bp),RUs有3、5、6、8、9类型,最多的是6 RUs型。SNPs分析结果表明,ORF75的RUs-45 bp的第3、15、30、42、44位存在多态性,RUs-102 bp的第83位存在多态性;ORF94的RUs-54 bp的第48位具有多态性,为G、T或C;ORF125的RUs-72 bp不存在多态性,RUs-69 bp(从第1个到倒数第2个)的第2、12、19、22、37、40、48、53、60、63位具有多态性,第2位为T/C,12和22位为G/T,19位为G/A,37、40、48、53和63位为A/G,60位为C/T,出现较多的位点是第12、22、37、60、63位,其中第60、63位多态性最为普遍。结果表明,WSSV广西株同源重复区存在较大变异,序列的RUs数目和SNP存在多样性。

    2024年01期 v.40 115-124页 [查看摘要][在线阅读][下载 1319K]
    [下载次数:39 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 2015-2021年宁夏腹泻病例中人星状病毒分子流行病学特征分析

    袁芳;蒯文和;曹慜;马学平;魏新峰;马江涛;张薇;

    基于宁夏食源性疾病监测系统研究宁夏地区2015-2021年15家哨点医院腹泻病例中的人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)感染状况,流行病学特点和基因特征。对收集的粪便标本,采用Real-time PCR方法筛选出的HAstV阳性标本,进行了回顾性分析。通过逆转录PCR对保存的HAstV阳性样本进行测序和基因分型,确定宁夏地区HAstV流行的基因型别和遗传进化。2015-2021年共收集腹泻病例标本8586例,HAstV阳性率为5.9%(513例),其中单独HAstV感染293例(占57%),和其它病毒共同感染220例(占42%),共同感染中与轮状病毒和诺如病毒GII组感染最多见,其次是两种以上病毒感染。感染发生在所有年龄组,5岁以下儿童的阳性率最高(8.0%),11-20岁年龄组阳性率最低(1.9%)。感染全年发生,一月和六月高发。对保存的168份HAstV单独阳性标本进行测序分析,测序获得94条HAstV基因序列,经鉴定为5种基因型别,分别是HAstV-1、HAstV-2、HAstV-3、HAstV-4、 HAstV-5,其中HAstV-1型为最常见的基因型(占61.7%),其次是HAstV-5(占19.1%)和HAstV-4(占15.9%)。系统发育分析显示HAstV-1分别属于HAstV-1a和HAstV-1b亚型,HAstV-1a较常见。HAstV-5和HAstV-4分别属于HAstV-5c和HAstV-4c亚型。全人群均可感染星状病毒,但主要受影响为5岁以下儿童。HAstV-1型是宁夏地区流行的主要型别,同时存在HAstV-1a和HAstV-1b、HAstV-4c、HAstV-5c共循环。

    2024年01期 v.40 125-132页 [查看摘要][在线阅读][下载 1562K]
    [下载次数:64 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]

人类病毒综述

  • 人偏肺病毒感染研究进展

    麻粉莲;郑丽舒;

    人偏肺病毒(Human metapneumovirus,HMPV)是急性呼吸道感染的主要病原之一,可感染所有人群的上呼吸道和下呼吸道,感染后多引起咳嗽、发烧、鼻塞和呼吸短促等症状,在婴幼儿、老年人和免疫功能低下者等易感人群中可致支气管炎和肺炎等严重疾病。目前HMPV尚无疫苗和特效药物,治疗措施多为对症支持治疗。2023年1月至4月HMPV在美国检出率出现高峰,短时间内出现大量病例,引起了社会各界的广泛关注。本文将就HMPV病原学特点、流行特点、HMPV感染的临床特征及发病机制等方面的的研究现状进行简单综述,为HMPV感染的科学预防和控制提供参考。

    2024年01期 v.40 133-139页 [查看摘要][在线阅读][下载 1188K]
    [下载次数:137 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 人诺如病毒感染引起的急性胃肠炎流行特征及其影响因素的研究进展

    谢迪;何莲花;刘晖;李金松;

    人诺如病毒(Human norovirus, HuNoV)属于杯状病毒科诺如病毒属,为无包膜单股正链RNA病毒,易发生重组,变异快,传染性强,致病剂量低;人群普遍易感,是全球急性胃肠炎(Acute gastroenteritis, AGE)的主要病因之一。HuNoV感染后,≤5岁儿童和>65岁老年人群中少数人会因大量失水导致电解质紊乱等重症,甚至死亡。HuNoV还易在封闭和/或半封闭人群拥挤的场所引起AGE暴发;新的变异株或/和型别出现,会导致暴发事件大幅升高,甚至出现大流行。因此,HuNoV导致了沉重的疾病负担,是全球性的公共卫生问题。本文综述了全球HuNoV AGE的流行病学研究进展,还从宿主、病毒和环境等多个方面综述了当前影响HuNoV AGE流行特征的主要影响因素,为HuNoV AGE的防控提供支撑。

    2024年01期 v.40 140-150页 [查看摘要][在线阅读][下载 1315K]
    [下载次数:116 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 新冠RNA疫苗研究进展

    赵小蒙;尹一凡;林敏;汪晨;郑子峥;夏宁邵;张军;

    新冠疫情使得RNA疫苗得到了迅速的发展。本文依据RNA分子形式的不同将RNA疫苗分为三种类型:非复制型传统mRNA疫苗、环状RNA疫苗和自复制型RNA疫苗,并对其技术特点及在新冠病毒领域的研究进展进行综述。

    2024年01期 v.40 151-159页 [查看摘要][在线阅读][下载 1236K]
    [下载次数:1221 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 外泌体参与新冠病毒感染的机制及其应用的研究进展

    鲁丹;方一泰;罗德炎;王慧;

    COVID-19是一种广泛流行的烈性传染病,具有很高的病死率,给全球公共卫生系统造成了严重危机。外泌体是一种由活细胞分泌的纳米级囊泡,携带亲本细胞的脂质、蛋白质及遗传物质至受体细胞,参与机体的信号传递、信息交流。在SARS-CoV-2感染的病理过程中,外泌体通过内吞途径或在相关分子的作用下参与感染,进而调节机体的生理或病理状态。外泌体具有高稳定性、低免疫原性、高生物相容性以及能够顺利通过组织屏障等优点。作为“分子载体”,外泌体可以递送SARS-CoV-2病毒相关信息分子,用于COVID-19的疾病诊断;作为“递送载体”,外泌体能够携带脂质、核酸、蛋白及药物至体内。因此,外泌体常用于COVID-19治疗药物与疫苗的制备。现就外泌体如何参与SARS-CoV-2感染以及外泌体与COVID-19的诊断、治疗及预防作一综述。

    2024年01期 v.40 160-168页 [查看摘要][在线阅读][下载 1213K]
    [下载次数:104 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 猴痘病毒的研究进展概述

    王雪琛;李涛;王慧;王凤雪;

    猴痘是由猴痘病毒引起的一种人兽共患疾病。猴痘病毒因1958年从带有痘疹的食蟹猴体内分离出而得名。20世纪猴痘病毒多分布于非洲中、西部的热带雨林地区。进入21世纪后,随着世界贸易及人口流通的增加,猴痘在世界范围内日益流行并造成人际间快速传播,造成其他非流行猴痘国家迅速暴发猴痘疫情。猴痘对人类生命安全构成重大威胁,更对全球猴痘疫情的防控提出挑战。本文就猴痘病毒的流行病学、生物学特性、将猴痘病毒应用于不同动物模拟研究猴痘病毒学、免疫学与病理学机制而建立的实验动物模型及疫苗和药物的预防的研究现状进行介绍,为积极防范猴痘疫情、加快研发出特异性针对猴痘的疫苗或药物提供帮助。

    2024年01期 v.40 169-182页 [查看摘要][在线阅读][下载 1318K]
    [下载次数:290 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • SFTSV介导的固有免疫应答及其通过抑制宿主蛋白泛素化修饰实现免疫逃逸的调控机制

    王佳敏;时小双;杨诗寒;金宁一;李昌;杜寿文;

    发热伴血小板减少综合征病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)感染可造成发热伴血小板减少综合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)。SFTS重症患者大多与SFTSV引起非正常的固有固有免疫反应所导致的细胞因子风暴有关。这些早期固有固有免疫反应包括多种炎症和抗病毒基因的表达,并激活随后的固有固有免疫反应和适应性免疫。感染细胞的早期固有固有免疫反应是由模式识别受体(Pattern recognition receptors, PRRs)、接头蛋白、激酶和转录因子组成的细胞内信号通路所介导的。这些途径受复杂的翻译后修饰网络的严格调节,其中大量的泛素化酶和去泛素化酶使这些修饰可逆且高度动态。这些酶的调控作用可以增强固有免疫反应以抵抗病原体的入侵,也可以抑制其过度活化以避免病理性免疫反应。本文综述了SFTSV引起的早期固有免疫信号通路及其复杂调控机制,为后续针对SFTSV的药物开发和免疫病理学提供了基础。

    2024年01期 v.40 183-196页 [查看摘要][在线阅读][下载 1483K]
    [下载次数:95 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • 免疫PCR技术在微量非核酸分子检测方面的应用进展

    赵萌;申辛欣;冯志山;

    免疫PCR(Immuno-PCR,IPCR)技术是一种结合了酶联免疫吸附测定(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)的特异性和聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)的高灵敏度的检测方法。与ELISA相比,IPCR由于PCR技术指数扩增的能力,检测灵敏度可以达到fg/mL。由于具有高灵敏度,IPCR在微量非核酸分子检测方面有着广泛的应用前景。本文主要介绍了传统IPCR和改良IPCR的原理和优缺点,概述了IPCR技术在病毒、细菌、寄生虫、肿瘤标志物、真菌、食品等方面的应用进展,总结了影响IPCR技术检测的因素并展望了IPCR技术的发展趋势。

    2024年01期 v.40 197-205页 [查看摘要][在线阅读][下载 1537K]
    [下载次数:270 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]
  • CD4~+和CD8~+ T细胞在抗流感病毒免疫中的重要作用

    杨宣叶;胡欣妍;高明阳;吴玉湖;王进千;马忠仁;马晓霞;

    甲型和乙型流感病毒(Influenza A and B viruses, IAV, IBV)作为季节性流感的主要病原体,在人和动物中流行可造成较高的发病率和死亡率。目前,接种疫苗仍然是预防和控制流感最有效的方法。流感疫苗接种主要是诱导产生病毒中和抗体来抵抗流行毒株对机体的侵染。随着对流感病毒与机体免疫系统研究的不断深入,特异性T细胞免疫反应在预防流感病毒侵染机体过程中发挥的作用越来越被学者所关注。因此,明确机体特异性CD4~+和CD8~+T细胞抗流感病毒侵染的作用机制,并了解对其作用有影响的各种因素,这将有助于科研人员在流感疫苗设计过程中更加兼顾新型疫苗在激活特异性T细胞反应性能上的提升,为设计出可诱导强大、广谱而持久免疫活性的新型流感疫苗提供依据。

    2024年01期 v.40 206-214页 [查看摘要][在线阅读][下载 1289K]
    [下载次数:306 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]

动物病毒综述

  • α属冠状病毒入侵宿主所需宿主因子研究进展

    孙亚娟;张达;汤傲星;袁莉刚;刘光清;朱杰;

    属冠状病毒包含众多对畜牧业存在重大威胁的成员,如猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猫传染性腹膜炎病毒等。病毒识别细胞表面的受体是感染宿主的第一步。因此,探索冠状病毒感染机制对了解病毒的组织嗜性和宿主谱具有重要意义。本文系统总结了近年来α属冠状病毒入侵宿主所需的受体和其它辅助性宿主因子的作用机理。

    2024年01期 v.40 215-224页 [查看摘要][在线阅读][下载 1212K]
    [下载次数:114 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:0 ]

信息