2024 05 v.40 1010-1021
2023年广东省急性出血性结膜炎流行末期病原组成及基因进化分析
基金项目(Foundation):
邮箱(Email):
554710128@qq.com;
DOI:
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004583
中文作者单位:
广州市白云区疾病预防控制中心;清远市第二人民医院;广东省疾病预防控制中心;
摘要(Abstract):
分析2023年广东省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）疫情流行末期病原体组成及其分子特征情况，为AHC的防治提供科学依据。本研究采集AHC流行末期81份AHC患者眼结膜拭子，采用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)方法，对其进行人肠道病毒70型（Human enterovirus 70,HEV70）、柯萨奇病毒A组24型变异株（Coxsackievirus A24 variant,CVA24v）和腺病毒（Adenovirus,AdV）核酸检测。通过HEp-2细胞进行病毒分离。对分离株进行PCR扩增和基因测序。用Mega11和BioEdit软件进行基因进化分析，用SWISS-MODEL进行VP1蛋白三维结构分析，通过IEDB进行VP1蛋白的B细胞抗原表位预测。结果显示81份眼拭子样本荧光定量PCR检测，EV70全部阴性，20份样本CVA24v阳性，16份样本AdV阳性。使用HEp-2细胞成功分离到8株CVA24v毒株。基于分子测序分析发现，2023年AHC流行末期的CVA24v病毒株与5月份疫情初期病毒株相比，8株CVA24v毒株在3C区核苷酸共有7处突变，其中在第309位点共享同义突变C→T。在VP1区共有19处突变，除AHC705/GD/CHN/2023株外，其余7株在第30位点共享同义突变T→C。此外还获得一株CVA24v的全基因组序列，和流行初期病毒株全长序列相比有24个核苷酸突变，3个氨基酸突变。本研究通过分析VP1蛋白的三维结构预测，识别出了本次疫情流行末期相比早期出现三个变异位点，其中T98A和A146T两个位点位于蛋白表面，参与组成抗原决定簇。研究结果显示，与疫情初期由CVA24v独立引起的流行相比，流行末期出现了CVA24v与AdV共同流行的现象。这一发现对理解病毒变异与流行动态具有重要意义。
关键词(KeyWords):
急性出血性结膜炎;;柯萨奇病毒A组24型变异株;;腺病毒;;基因进化分析
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参考文献
[1]王晓芳，赵俊伟，张顺先，等.我国急性出血性结膜炎流行特征及暴发原因分析[J].疾病监测，2014, 29(2):92-97. DOI:10. 3784/j. issn. 1003-9961. 2014. 02. 004.
[2]吴家驹，李子华.急性出血性结膜炎病原体EV70与CA24V的起源与变异[J].国外医学（微生物学分册），1992(1):4-9.
[3] Chatterjee S, Quarcoopome CO, Apenteng A. Unusual type of epidemic conjunctivitis in Ghana[J]. Br J Ophthalmol, 1970, 54(9):628-630. DOI:10. 1136/bjo. 54. 9. 628.
[4] Lim KH, Yin-Murphy M. An epidemic of conjunctivitis in Singapore in 1970[J]. Singapore Med J, 1971, 12(5):247-249.
[5] Chang WK, Liu KC, Foo TC, et al. Acute haemorrhagic conjunctivitis in Hong Kong 1971-1975[J]. Southeast Asian J Trop Med Public Health, 1977,8(1):1-6.
[6]李质怀，董女，李培雄，等.一九八一年广州市急性出血性结膜炎临床分析及其病原研究二、病毒分离与鉴定[J].眼科研究，1985(01):4-5+16.
[7]沐桂藩，吕华. 1984年北京地区急性出血性结膜炎的病原学研究[J].中华眼科杂志，1989(1):20-22.
[8]陈美光，张保华，唐桂英，等.急性出血性结膜炎流行及肠道病毒70型的检出和鉴定[J].中国公共卫生学报，1989, 8(2):121-123.
[9]杨洋，龚甜，殷小龙，等. 2012年江西省儿童急性出血性结膜炎病原学特征分析[J].实验与检验医学，2016, 34(3):277-278, 326. DOI:10. 3969/j.issn. 1674-1129. 2016. 03. 006.
[10]丁丽新，张勇，李洁，等. 2007年北京市急性出血性结膜炎的病原与分子进化分析[J].病毒学报，2009, 25(4):251-256. DOI:10. 3321/j. issn:1000-8721. 2009. 04. 002.
[11]严冬梅，熊英，张勇，等. 2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析[J].病毒学报，2015, 31(3):251-257.
[12]Li J, Huang F, Zhang Y, et al. Molecular analysis of Coxsackievirus A24 variant isolates from three outbreaks of acute hemorrhagic conjunctivitis in 1988, 1994 and2007 in Beijing, China[J]. Virol Sin, 2022, 37(2):168-176. DOI:10. 1016/j. virs. 2022. 01. 024.
[13]沐桂藩. 1986年我国急性出血性结膜炎病人分离病毒的鉴定[J].中国医学科学院学报，1991, 000(002):21.
[14]De W, Huanying Z, Hui L, et al. Phylogenetic and molecular characterization of coxsackievirus A24 variant isolates from a 2010 acute hemorrhagic conjunctivitis outbreak in Guangdong, China[J]. Virol J, 2012, 9:41. DOI:10. 1186/1743-422x-9-41.
[15]Wu D, Ke CW, Mo YL, et al. Multiple outbreaks of acute hemorrhagic conjunctivitis due to a variant of coxsackievirus A24:Guangdong, China, 2007[J]. J Med Virol, 2008, 80(10):1762-1768. DOI:10. 1002/jmv. 21288.
[16]Enfissi A, Joffret ML, Delaune D, et al.Coxsackievirus A24 variant associated with acute haemorrhagic conjunctivitis cases, French Guiana, 2017[J]. Intervirology, 2017, 60(6):271-275. DOI:10. 1159/000489339.
[17]Fragoso-Fonseca DE, Escobar-Escamilla N, RodríguezMaldonado AP, et al. Complete genome sequence of a coxsackievirus type A24 variant causing an outbreak of acute haemorrhagic conjunctivitis in southeastern Mexico in 2017[J]. Arch Virol, 2020, 165(4):1015-1018.DOI:10. 1007/s00705-020-04552-3.
[18]Marguerite N, Brottet E, Pagès F, et al. A major outbreak of conjunctivitis caused by coxsackievirus A24,Reunion, January to April 2015[J]. Euro Surveill.2016; 21(26):10. 2807/1560-7917.ES. 2016. 21. 26. 30271. DOI:10. 2807/1560-7917.ES. 2016. 21. 26. 30271.
[19]徐俊贤，郑焕英，欧阳婷，等.一起急性出血性结膜炎暴发疫情病原学分子特征分析[J].中华实验和临床病毒学杂志，2023, 37(5):497-504. DOI:10. 3760/cma. j. cn112866-20230702-00070.
[20]Yan D, Zhu S, Zhang Y, et al. Outbreak of acute hemorrhagic conjunctivitis in Yunnan, People’ s Republic of China, 2007[J]. Virol J, 2010, 7:138.DOI:10. 1186/1743-422x-7-138.
[21]蔡小廷，曾双飞，郑焕英，等. 2017—2018年中山市急性出血性结膜炎病原学监测结果[J].热带医学杂志，2021, 21(8):1079-1082. DOI:10. 3969/j. issn. 1672-3619. 2021. 08. 030.
[22]Waterhouse A, Bertoni M, Bienert S, et al. SWISSMODEL:homology modelling of protein structures and complexes[J]. Nucleic Acids Res, 2018, 46(W1):W296-W303. DOI:10. 1093/nar/gky427.
[23]李俊含，张勇，冀天娇，等.江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析[J].病毒学报，2021, 37(1):89-96.
[24]李焕，徐昌平，严菊英，等.浙江省2002—2010年急性出血性结膜炎暴发疫情病原体CA24v的全基因组序列分析[J].中华流行病学杂志，2013, 34(5):496-502.DOI:10. 3760/cma. j. issn. 0254-6450. 2013. 05. 019.
[25]Harris KS, Reddigari SR, Nicklin MJ, et al.Purification and characterization of poliovirus polypeptide3CD, a proteinase and a precursor for RNA polymerase[J]. J Virol, 1992, 66(12):7481-7489. DOI:10. 1128/jvi. 66. 12. 7481-7489. 1992.
[26]阮旭琴，姚云芳，谈娟，等.筛选EV713C蛋白酶切割的宿主细胞蛋白[J].南开大学学报（自然科学版），2021, 54(6):23-29.
[27]Caine EA, Moncla LH, Ronderos MD, et al. A single mutation in the VP1 of enterovirus 71 is responsible for increased virulence and neurotropism in adult interferondeficient mice[J]. J Virol, 2016, 90(19):8592-8604.DOI:10. 1128/jvi. 01370-16.
[28]张凤娟，刘德辉，王晓倩，等. 2014—2019年山东省潍坊市流行的肠道病毒A组71型的VP1区基因特征分析[J].疾病监测，2023, 38(10):1229-1232. DOI:10. 3784/jbjc. 202302090030.
[29]Chen P, Lin XJ, Ji F, et al. Evolutionary phylogeography reveals novel genotypes of coxsackievirus A24 variant and updates the spatiotemporal dynamics in the population with acute hemorrhagic conjunctivitis[J]. Int J Infect Dis, 2022,124:227-239. DOI:10. 1016/j. ijid. 2022. 10. 007.
[30]Lynch JP III, Kajon AE. Adenovirus:epidemiology,global spread of novel types, and approach to treatment[J]. Semin Respir Crit Care Med, 2021, 42(6):800-821. DOI:10. 1055/s-0041-1733802.
[31]潘丽峰，刘辉，崔琪奇，等. 2014—2016年上海市浦东新区腺病毒感染引起的急性出血性结膜炎分子流行病学特征[J].中国病毒病杂志，2019, 9(1):39-44.
[32]赵锦铭，严岚，程红，等.急性结膜炎的腺病毒病原及其DNA基因型[J].中华流行病学杂志，2002, 23(S1):144. DOI:10. 3760/j. issn:0254-6450. 2002.z1. 064.
[33]Goh KT, Ooi PL, Miyamura K, et al. Acute haemorrhagic conjunctivitis:seroepidemiology of coxsackievirus A24 variant and enterovirus 70 in Singapore[J]. J Med Virol, 1990, 31(3):245-247.DOI:10. 1002/jmv. 1890310313.
[34]Filleul L, Pagès F, Wan GC, et al. Costs of conjunctivitis outbreak, réunion island, France[J].Emerg Infect Dis, 2018, 24(1):168-170. DOI:10. 3201/eid2401. 170916.
[2]吴家驹，李子华.急性出血性结膜炎病原体EV70与CA24V的起源与变异[J].国外医学（微生物学分册），1992(1):4-9.
[3] Chatterjee S, Quarcoopome CO, Apenteng A. Unusual type of epidemic conjunctivitis in Ghana[J]. Br J Ophthalmol, 1970, 54(9):628-630. DOI:10. 1136/bjo. 54. 9. 628.
[4] Lim KH, Yin-Murphy M. An epidemic of conjunctivitis in Singapore in 1970[J]. Singapore Med J, 1971, 12(5):247-249.
[5] Chang WK, Liu KC, Foo TC, et al. Acute haemorrhagic conjunctivitis in Hong Kong 1971-1975[J]. Southeast Asian J Trop Med Public Health, 1977,8(1):1-6.
[6]李质怀，董女，李培雄，等.一九八一年广州市急性出血性结膜炎临床分析及其病原研究二、病毒分离与鉴定[J].眼科研究，1985(01):4-5+16.
[7]沐桂藩，吕华. 1984年北京地区急性出血性结膜炎的病原学研究[J].中华眼科杂志，1989(1):20-22.
[8]陈美光，张保华，唐桂英，等.急性出血性结膜炎流行及肠道病毒70型的检出和鉴定[J].中国公共卫生学报，1989, 8(2):121-123.
[9]杨洋，龚甜，殷小龙，等. 2012年江西省儿童急性出血性结膜炎病原学特征分析[J].实验与检验医学，2016, 34(3):277-278, 326. DOI:10. 3969/j.issn. 1674-1129. 2016. 03. 006.
[10]丁丽新，张勇，李洁，等. 2007年北京市急性出血性结膜炎的病原与分子进化分析[J].病毒学报，2009, 25(4):251-256. DOI:10. 3321/j. issn:1000-8721. 2009. 04. 002.
[11]严冬梅，熊英，张勇，等. 2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析[J].病毒学报，2015, 31(3):251-257.
[12]Li J, Huang F, Zhang Y, et al. Molecular analysis of Coxsackievirus A24 variant isolates from three outbreaks of acute hemorrhagic conjunctivitis in 1988, 1994 and2007 in Beijing, China[J]. Virol Sin, 2022, 37(2):168-176. DOI:10. 1016/j. virs. 2022. 01. 024.
[13]沐桂藩. 1986年我国急性出血性结膜炎病人分离病毒的鉴定[J].中国医学科学院学报，1991, 000(002):21.
[14]De W, Huanying Z, Hui L, et al. Phylogenetic and molecular characterization of coxsackievirus A24 variant isolates from a 2010 acute hemorrhagic conjunctivitis outbreak in Guangdong, China[J]. Virol J, 2012, 9:41. DOI:10. 1186/1743-422x-9-41.
[15]Wu D, Ke CW, Mo YL, et al. Multiple outbreaks of acute hemorrhagic conjunctivitis due to a variant of coxsackievirus A24:Guangdong, China, 2007[J]. J Med Virol, 2008, 80(10):1762-1768. DOI:10. 1002/jmv. 21288.
[16]Enfissi A, Joffret ML, Delaune D, et al.Coxsackievirus A24 variant associated with acute haemorrhagic conjunctivitis cases, French Guiana, 2017[J]. Intervirology, 2017, 60(6):271-275. DOI:10. 1159/000489339.
[17]Fragoso-Fonseca DE, Escobar-Escamilla N, RodríguezMaldonado AP, et al. Complete genome sequence of a coxsackievirus type A24 variant causing an outbreak of acute haemorrhagic conjunctivitis in southeastern Mexico in 2017[J]. Arch Virol, 2020, 165(4):1015-1018.DOI:10. 1007/s00705-020-04552-3.
[18]Marguerite N, Brottet E, Pagès F, et al. A major outbreak of conjunctivitis caused by coxsackievirus A24,Reunion, January to April 2015[J]. Euro Surveill.2016; 21(26):10. 2807/1560-7917.ES. 2016. 21. 26. 30271. DOI:10. 2807/1560-7917.ES. 2016. 21. 26. 30271.
[19]徐俊贤，郑焕英，欧阳婷，等.一起急性出血性结膜炎暴发疫情病原学分子特征分析[J].中华实验和临床病毒学杂志，2023, 37(5):497-504. DOI:10. 3760/cma. j. cn112866-20230702-00070.
[20]Yan D, Zhu S, Zhang Y, et al. Outbreak of acute hemorrhagic conjunctivitis in Yunnan, People’ s Republic of China, 2007[J]. Virol J, 2010, 7:138.DOI:10. 1186/1743-422x-7-138.
[21]蔡小廷，曾双飞，郑焕英，等. 2017—2018年中山市急性出血性结膜炎病原学监测结果[J].热带医学杂志，2021, 21(8):1079-1082. DOI:10. 3969/j. issn. 1672-3619. 2021. 08. 030.
[22]Waterhouse A, Bertoni M, Bienert S, et al. SWISSMODEL:homology modelling of protein structures and complexes[J]. Nucleic Acids Res, 2018, 46(W1):W296-W303. DOI:10. 1093/nar/gky427.
[23]李俊含，张勇，冀天娇，等.江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析[J].病毒学报，2021, 37(1):89-96.
[24]李焕，徐昌平，严菊英，等.浙江省2002—2010年急性出血性结膜炎暴发疫情病原体CA24v的全基因组序列分析[J].中华流行病学杂志，2013, 34(5):496-502.DOI:10. 3760/cma. j. issn. 0254-6450. 2013. 05. 019.
[25]Harris KS, Reddigari SR, Nicklin MJ, et al.Purification and characterization of poliovirus polypeptide3CD, a proteinase and a precursor for RNA polymerase[J]. J Virol, 1992, 66(12):7481-7489. DOI:10. 1128/jvi. 66. 12. 7481-7489. 1992.
[26]阮旭琴，姚云芳，谈娟，等.筛选EV713C蛋白酶切割的宿主细胞蛋白[J].南开大学学报（自然科学版），2021, 54(6):23-29.
[27]Caine EA, Moncla LH, Ronderos MD, et al. A single mutation in the VP1 of enterovirus 71 is responsible for increased virulence and neurotropism in adult interferondeficient mice[J]. J Virol, 2016, 90(19):8592-8604.DOI:10. 1128/jvi. 01370-16.
[28]张凤娟，刘德辉，王晓倩，等. 2014—2019年山东省潍坊市流行的肠道病毒A组71型的VP1区基因特征分析[J].疾病监测，2023, 38(10):1229-1232. DOI:10. 3784/jbjc. 202302090030.
[29]Chen P, Lin XJ, Ji F, et al. Evolutionary phylogeography reveals novel genotypes of coxsackievirus A24 variant and updates the spatiotemporal dynamics in the population with acute hemorrhagic conjunctivitis[J]. Int J Infect Dis, 2022,124:227-239. DOI:10. 1016/j. ijid. 2022. 10. 007.
[30]Lynch JP III, Kajon AE. Adenovirus:epidemiology,global spread of novel types, and approach to treatment[J]. Semin Respir Crit Care Med, 2021, 42(6):800-821. DOI:10. 1055/s-0041-1733802.
[31]潘丽峰，刘辉，崔琪奇，等. 2014—2016年上海市浦东新区腺病毒感染引起的急性出血性结膜炎分子流行病学特征[J].中国病毒病杂志，2019, 9(1):39-44.
[32]赵锦铭，严岚，程红，等.急性结膜炎的腺病毒病原及其DNA基因型[J].中华流行病学杂志，2002, 23(S1):144. DOI:10. 3760/j. issn:0254-6450. 2002.z1. 064.
[33]Goh KT, Ooi PL, Miyamura K, et al. Acute haemorrhagic conjunctivitis:seroepidemiology of coxsackievirus A24 variant and enterovirus 70 in Singapore[J]. J Med Virol, 1990, 31(3):245-247.DOI:10. 1002/jmv. 1890310313.
[34]Filleul L, Pagès F, Wan GC, et al. Costs of conjunctivitis outbreak, réunion island, France[J].Emerg Infect Dis, 2018, 24(1):168-170. DOI:10. 3201/eid2401. 170916.
基本信息:
DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004583
中图分类号:R777.31
引用信息:
[1]杨银柯,钟干芳,徐俊贤等.2023年广东省急性出血性结膜炎流行末期病原组成及基因进化分析[J].病毒学报,2024,40(05):1010-1021.DOI:10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004583.
基金信息:
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