中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,上海市疾病预防控制中心,上海市疾病预防控制中心,重庆市疾病预防控制中心,上海市疾病预防控制中心,复旦大学附属儿科医院,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,日本国立卫生研究院 北京 100052 ,北京 100052 ,上海 200336 ,上海 200336 ,重庆 400042 ,上海 200336 ,上海 200032 ,北京 100052 ,北京 100052
2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源
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基本信息:
DOI：
中图分类号:R3732
引用信息:
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基金信息:
WHO资助,项目编号(WP/CHN/IVD/001/RB02)