病毒学报

肠道病毒D68型流行基因型高灵敏通用型Real-time RT-PCR检测方法建立及应用

2023年河南省急性弛缓性麻痹病例中非脊髓灰质炎肠道病毒病原学及流行病学分析

2018-2023年新余地区手足口病流行特征及其CVA6型病毒分子特征研究

MPXV的流行动态、遗传演化分支及其公共卫生安全挑战

猴痘病毒对雌兔和雄兔致病差异研究

MG132对狂犬病病毒体外抑制作用研究

为研究MG132对不同毒力狂犬病病毒（Rabies virus,RABV）的体外抑制作用，本实验运用CCK8的方法评价MG132的细胞毒性，用直接免疫荧光（Direct immunofluorescence,DFA）、半数组织培养感染剂量法（TCID50）和qRT-PCR等方法分析MG132对RABV的体外抑制作用并以利巴韦林和法匹拉韦（Favipiravir,T-705）作为阳性对照评价MG132体外抑制RABV的效果。结果表明CVS-11及SC16感染N2a和BSR细胞后加入5μmol/L MG132均可在体外抑制CVS-11及SC16的复制，其中预加药2h以内没有抑制CVS-11及SC16复制的效果，但后加药1～24h均可抑制CVS-11及SC16的体外复制，并且感染后1h加药能达到与阳性对照利巴韦林相似的抑制效果且效果优于T-705。因此感染后添加MG132可以在体外有效抑制RABV的复制。

疱疹性咽峡炎：病原学、流行病学和防控策略

疱疹性咽峡炎（Herpangina,HA）是一种由人肠道病毒（Enterovirus,EV）感染引起的急性传染性疾病，多发于6岁及以下儿童，该病以急性发热和咽颊部位疱疹为主要临床表现，其病原型别多样，一年四季均可发病，春夏季为主，其复杂的血清型变异导致疫苗研发困难，加之婴幼儿普遍易感的特性，现已成为威胁儿童健康的常见公共卫生问题。本文深入剖析了HA的流行特征、病原构成、临床表现、诊断及治疗方法，旨在提高相关机构和部门对HA的认知水平，通过加强疾病的监测、早期诊断与积极治疗，为预防和控制HA的发生与传播提供科学依据，促进早期预警与干预机制的建立，减轻家庭和社会的经济负担。

免疫介导的胃肠道疾病中病毒作用机制的研究新进展

免疫介导的胃肠道疾病（Immune-mediated gastrointestinal diseases, IMGDs）是一类由免疫系统异常激活或失调引发的慢性炎症性疾病，其发病机制涉及遗传、环境与免疫系统的复杂互作。近年研究表明，病毒感染及肠道宏病毒组失调可能在IMGDs的发生发展中发挥关键作用。本文系统综述了病毒在乳糜泻、炎症性肠病（Inflammatory bowel disease,IBD）及贲门失弛缓症等疾病中的潜在机制，为制定旨在减轻疾病对患者健康和生活质量影响的新型治疗策略提供理论依据。

呼吸道合胞病毒实验室诊断技术研究进展

呼吸道合胞病毒（Respiratory syncytial virus,RSV）是导致婴幼儿和老年人急性下呼吸道感染的主要病原体之一。快速且准确的实验室诊断对于RSV感染的早期干预、疾病管理及防控策略的制定至关重要。目前，基于实时逆转录聚合酶链反应的核酸检测技术，凭借其高灵敏度、高特异性和快速出结果的特点，已成为最广泛使用的RSV检测方法。快速抗原检测虽然操作简便、快速，但其灵敏度和特异性通常低于基于PCR的检测方法；而病毒分离培养和抗体检测则主要用于流行病学调查。本文将全面探讨在临床和研究环境中可用于诊断RSV感染的方法，旨在为临床医生和研究人员提供科学依据，助力优化诊断策略，提升RSV感染的诊断效率和准确性。

2020年7月-2021年12月芜湖市6例人冠状病毒HCoV-HKU1基因特征的分析

探究本地区人冠状病毒HKU1的基因特征并研究其进化关系。对2020年07月-2021年12月芜湖市第二人民医院发热门诊采集成人急性上呼吸道感染患者咽拭子样本，样本进行RNA提取及实时荧光RT-PCR检测，并通过逆转录-链式聚合酶反应（RT-PCR）对HCoV-HKU1 RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA-Polymerase,RdRp）、刺突蛋白（Spike, S）、核衣壳蛋白（Nucleocapsid, N）3个靶基因进行基因扩增及序列测定；Genbank下载51株代表性HCoV-HKU1全基因组序列，分别用获得的RdRp、S、N核苷酸序列构建分析集并进行基因亲缘性关系树分析；最后基于HCoV-HKU1不同基因型对S基因片段进行氨基酸位点变异分析。本研究期间共收集701例样本，并成功检出6例HCoV-HKU1阳性样本，感染率为0.86%(6/701)；基因亲缘性关系树分析结果显示，3株HCoVHKU1样本被鉴定为A基因型（202007032、202008190、202008324），其余3株样本属于B基因型（202008180、202101291、202101280）；此外，S基因氨基酸位点变异分析表明，A、B、C不同基因型存在特异性变异位点，而247-249号氨基酸位点变异可能是影响B基因型转化为C基因型的关键因素。本研究基于RdRp、S和N基因序列分析其基因型及S基因氨基酸位点变异特点，丰富了我国HCoV-HKU1基础研究数据。

含P_RP_L启动子的原核高效表达载体的组建及其应用

我们组建了一个含P_RP_L自动子的原核高效表达载体,它同时含有cI调控基因、多酶切点和两个强的转录终止序列。带起始密码子ATG的外源基因可以插入启动子下游的多酶切点,表达非融合蛋白,产品可供临床使用。我们实验室已用它成功地表达了人γ干扰素、人白细胞介素-2和人肿瘤坏死因子等,表达量均占菌体总蛋白的20％以上。

鸡的J亚群白血病病毒的分离及部分序列比较

通过接种鸡胚成纤维细胞、聚合酶链式反应 (PCR)技术及特异性单抗的间接荧光抗体反应 (IFA) ,从某大型肉用型种鸡场的疑似J亚群白血病的病鸡中 ,以及 2 5个临床健康的商品代肉鸡群的 2群中 ,分离鉴定出J亚群禽白血病病毒 (ALV J)。在用抗ALV Jgp85单克隆抗体JE9的IFA中 ,来自病鸡群的两株病毒SD990 1和SD990 2呈强阳性反应 ,来自临床健康肉鸡群的YZ990 1和YZ990 2株呈弱阳性反应。对YZ990 1株和SD990 2株的PCR产物直接测序结果表明 ,这二个中国株的囊膜蛋白 gp85的氨基酸组成与原型株HPRS 10 3及美国分离株ADOL Hcl有 89%～ 93%的同源性 ,它们相互间的同源性是 92 %。其 3′端LTR区与原型株HPRS 10 3则有 95 %～ 97%的同源性 ,但中国的两株病毒在紧靠 3′端LTR的“E”成分中 ,出现了一个 139个碱基的缺失性突变 ,而代之以一个 11个碱基的插入序列。

在我国腹泻患儿中发现诺瓦克样病霉感染

诺瓦克病毒是引起无菌性急性胃肠炎爆发的重要病原。１９９０年１０月至１９９１年１月从河南省急性腹泻门诊患儿便样中发现了诺瓦克样病毒。经电镜观察，病毒直径约为２８ｎｍ，病毒壳似由有结构的亚单位组成，进一步用诺瓦克病毒特异的寡核苷酸引物做逆转录一聚合酶链式反应（ＲＴ－ＰＣＲ），检定为阳性。由ＰＣＲ产物测得的核苷酸序列与诺瓦克病毒原型株相应序列比较，同源性为７２％。以上结果证实，在我国腹泻病人中有诺瓦克样病毒感染。这对我国病毒性胃肠炎流行的防治研究具有重要意义。

肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征

2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源

我国地方品种鸡分离到的一个禽白血病病毒新亚群的鉴定

为探明我国地方品种鸡群禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)的特点,通过接种DF-1细胞及细胞培养上清液p27抗原的检测,从芦花鸡中分离得到三株外源性ALV禽白血病病毒,分别是JS11C1、JS11C2和JS11C3,并对其进行亚群鉴定分析。用PCR方法扩增env基因测序,并与已知鸡源各亚群ALV的囊膜蛋白(gp85)作氨基酸同源性比较。这三株ALV的env基因的gp85大小为1 005bp,编码335个氨基酸;env基因的gp37大小为609bp,编码203个氨基酸。三个毒株之间gp85的同源性为91.9%～97.0%。与A、B、C、D和E五个经典亚群在GenBank中已发表的18个毒株的gp85的同源性仅在77.7%～84.6%间,显著低于鸡群中常见的A、B、E各亚群内的同源性范围(分别为88.2%～98.5%,91.6%～98.8%和97.9%～99.4%),而与J亚群参考株的同源性更是只有34.2%～36.5%。上述结果表明,芦花鸡分离到的三株病毒可能是不同于鸡源ALV已知6个亚群的一个新亚群,按国际上对ALV亚群分类的习惯,初步将其定名为K亚群。

新冠病毒SARS-CoV-2的感染机制研究进展

由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的冠状病毒病2019(COVID-19)作为一种新发传染病,已经蔓延到全世界的多个国家和地区,被WHO判定为全球大流行病(Pandemic disease),引发了严重的公共卫生安全问题。自SARS-CoV-2出现以来,病毒溯源和中间宿主等问题得到了民众的广泛关注,虽然只有约2%的感染者有野生动物接触史,但科学家普遍认为SARS-CoV-2是一种来自野生动物的病毒。病毒的跨种属传播十分困难,而且往往会引起新宿主的高病死率,但SARS-CoV-2被发现以来,表现出对人类机体已经有了很好的适应性,具有传播能力强和病死率较低的特性,这与之前发现的引起新发、突发传染病的大多数病毒有所不同。因此,本文对SARS-CoV-2的病原学,功能受体和基因组进化等方面的研究进展进行综述,以期为SARS-CoV-2的溯源提供新的视角。

新型冠状病毒肺炎的疫情趋势预测

2019年12月以来,湖北省武汉市部分医院陆续发现了多例不明原因肺炎病例,现已证实为新型冠状病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)。全国各地采取了前所未有的措施,大力开展疾病救治和防疫工作。本文收集中国国家卫生健康委员会公布的官方统计数据预测疫情走向。传统SEIR模型中仅考虑病例和处于潜伏期的感染者,病例具有传染性而潜伏者无传染性;事实上,新冠肺炎确诊患者在医院中隔离无法对外界易感人群造成感染,有研究表明处于潜伏期的感染者可能具有传染性。因此,本研究提出了改进的传染病传播模型—ISEIR,将患者分为未收治的发病患者(具有传染性)和已收治的确诊患者(不考虑传染性),并考虑处于潜伏期的感染者具有传染性;以历史数据动态拟合模型参数,来摆脱固定参数的局限性。在数据预处理中根据每日有效再生数的概率分布将2020年2月12至14日这三天的临床诊断数据进行预处理,摊入到前期数据中。疫情分成全国(湖北省外)和湖北省两大区域分别进行探讨,通过新模型ISEIR预测今后疫情的进一步发展,并计算每日的有效再生数变化。结果显示,湖北省的有效再生数从3.108逐渐降低,2020年4月19日所有患者将全部治愈出院,累计确诊患者为66 487人;全国(湖北省外)的初始有效再生数为1.929,小于湖北省,2020年3月26日所有患者全部治愈,累计确诊患者13 270人。从结果中可以发现,在严格的防控措施下疫情得到了有效抑制,验证了目前防控措施的有效性,但仍需要防止复工潮引起的疫情反弹。

新型冠状病毒（2019-nCoV）治疗药物体内外研究及药物研发进展

2019年12月以来,中国湖北省武汉市陆续发现了多例新型冠状病毒感染的肺炎患者,随着疫情的蔓延,中国其他地区及境外也相继发现了此类病例。2020年1月12日,世界卫生组织(WHO)将该新病毒暂定命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。2019-nCoV是继SARS冠状病毒(SARS-CoV)、MERS冠状病毒(MERS-CoV)之后发现的一种具有高传染性且可以引起重症呼吸道疾病的新型病毒,临床尚无特效治疗药物。本文结合临床治疗、体内外的研究对相关指南推荐的治疗药物及药物研发进展进行综述,旨在为2019-nCoV病毒感染的肺炎患者的临床治疗提供借鉴。

2019新型冠状病毒的研究进展

自2019年12月以来,新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的肺炎疫情在中国武汉暴发,随后疫情迅速蔓延,扩散至中国其它各省市。新型冠状病毒属于β冠状病毒属,与SARS-CoV和MERS-CoV近缘但有较大区别,尤其是刺突蛋白(Spike,S),根据序列相似性推断可能来源于蝙蝠,使用与SARS-CoV相同的血管紧张素转化酶Ⅱ(Angiotensin-converting enzyme Ⅱ,ACE2)受体进入细胞,以飞沫和接触传播为主要传播途径,缺乏有效药物治疗和疫苗是疫情防控的挑战。

埃博拉病毒侵染细胞机制的研究进展

埃博拉病毒能在人类和非人灵长类中引起严重的埃博拉出血热,病死率可高达90%,并且目前还没有针对埃博拉病毒有效的疫苗或者是治疗手段。面对埃博拉病毒带来的挑战,针对埃博拉病毒的相关研究已经成为病毒学的热点问题。其中,关于埃博拉病毒侵染细胞机制的科学研究对于开发病毒疫苗以及新型治疗药物有非常关键的作用。因此,本综述拟就埃博拉病毒侵染细胞机制方面的研究进展进行总结。